| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 696863 = | 42 (0.350) | 20 (0.180) +GAAGAAACAATC |
8/254 | NT | 21.5% | intergenic (‑33/+2) | glnW/glnU | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
| ? | NC_000913 | = 697134 | 118 (0.980) | intergenic (‑1/+379) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B | |||||
AACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCT > NC_000913/696720‑697012 | aaCCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAACACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAAAACGAGCGGTGAACGGCGTAAGCTAAGAAGATCGCt > 1:1971069/1‑150 (MQ=21) cTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCACAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTa < 1:1701748/150‑1 (MQ=255) ctcggcgCCAGTTTCTGTCCTCGATTGCGGGGGTACTTCGAGTCGTCCTAGGTAATGCCGGTATCATAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGa < 1:1776517/144‑1 (MQ=21) aCGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAAAAACACCGCTGAAACGATAAATCTAAGAAAATCGATGGTGTACCTCGAt > 2:1809795/1‑150 (MQ=14) gTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCGTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTc > 1:679624/1‑150 (MQ=255) ttGTTTCTTAGATGGCTTTTCTACCTGGATTCGACACAGGTAATGACGGTATCAATTTCCGGTGTCTTACTGATTGTCGATACCTAAATAACTGTGCGTTGAAGCGATTACTTTAATACGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAggg < 2:931108/150‑1 (MQ=255) ttCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAGCCGGGCGGTGAAACGCGTAGTCGAAGAAGATGGATCGGGTACCTGGATTCCATACAGGGAAAGGATGTATCAAATACCGGttcgtaac > 2:1814698/1‑143 (MQ=18) gtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCg < 2:1515294‑M1/62‑1 (MQ=255) ggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCt < 2:1701747‑M1/64‑1 (MQ=255) aCCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGATGATGGCTGGGTTACCTGGATTCGAACCAGGGAAGTCCGGTATCATAAACCGGTTCCTTACCGCtt > 2:1822243/1‑150 (MQ=37) tacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTgg < 1:229415‑M1/67‑1 (MQ=255) cgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCg < 1:964889‑M1/69‑1 (MQ=255) ggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAcc < 1:978523‑M1/74‑1 (MQ=255) gattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAAGCCGGTATCAAAAACAGGTGCCTTACCGCTAGGCGATAccc < 1:931109‑M1/75‑1 (MQ=255) ccGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAGCCGGGCGGTGAACCGGGTACTCGAAGATGATGGCTGGGGTACCTGGATACGAACCAGGCGATGCCGGAATCAACTGCGGGTTCGTTACAGCTGGGCGATAcccc > 2:1169697/1‑150 (MQ=25) caacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCcatac < 1:2009921‑M1/80‑3 (MQ=255) cAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACAGCTTGGCGATACCCCATCCGTa > 1:1554148/1‑150 (MQ=255) cAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAGAAACGGGCGGTGAAGCGGTTACTCTAAGAAGGTGGCTGGGGTACCTGGATACGAAGCAGGCCCAGCCGGATAAAAAAACCGCTTCCAAACCGATGGGCGATACCGCAtaagaa > 2:974951/1‑145 (MQ=255) tgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCaaaa > 2:363447‑M1/66‑112 (MQ=255) tgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCaaaa < 1:363447‑M1/47‑1 (MQ=255) tgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGAtaccccataaggacg < 1:1988868‑M1/85‑8 (MQ=255) gTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATGCGAACCAGGGAATGCCGCTATCAAAAACAGGTGCCTTACCGCTTGGCAATACCCCAACCGTACAACGCttt > 1:886790/1‑150 (MQ=38) tGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTAATCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGATCCAGGGAATACCGGTATAATAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACCGTACAACGCTTTc > 2:1600360/1‑150 (MQ=25) atcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATACGGCCAAcgcttact < 1:749324‑M1/94‑4 (MQ=255) cattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGACGAacgctttaggg < 2:1600460‑M1/96‑5 (MQ=255) cattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATACGTACAACGGtttcagg < 1:170435‑M1/96‑4 (MQ=255) ccGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGat > 2:1970884/1‑149 (MQ=255) cGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAAt > 1:1096698/1‑150 (MQ=255) cGCTTGGCGATACCCCAAAAACCGGGCGCTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTCAAt > 1:355395/1‑150 (MQ=255) 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cccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 1:654296/1‑150 (MQ=255) cccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg > 2:1042064/1‑150 (MQ=255) cccAATAACCGCGCTGTGAACCGATTACTCGACGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg < 2:964888/150‑1 (MQ=255) ccaaccgagctacgtagcccgtacgcttatacGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGAATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGAc > 1:1468905‑M1/33‑150 (MQ=255) actgagctatgtagcgagtttgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTg > 2:2009920‑M1/30‑150 (MQ=255) accgcgcttcgtaccgagatttcttctacGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTg > 2:415261‑M1/30‑150 (MQ=255) tgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATACGAACACCGCTTTCTGGAGAATGGTGAGGGAGGCGATACTTGaa < 2:1470712‑M1/123‑1 (MQ=255) cGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGaa > 2:1251168/1‑150 (MQ=255) gggCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAAc > 2:550445/1‑150 (MQ=255) gCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGCGACTTGAACTc > 1:892361/1‑150 (MQ=255) 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1:1103730‑M1/83‑1 (MQ=255) ttgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTa > 2:1103729‑M1/11‑93 (MQ=255) cTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGATTGGTGCGGGAGGCGAGCCTTGAACTCGCACACCTTgcggcg > 1:336381/1‑150 (MQ=255) cTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGCGGCGAGACTTGAACTCGCCCACCTTgcggcg > 1:200249/1‑150 (MQ=255) cTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcggcg > 1:1256869/1‑150 (MQ=255) cTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcggcg > 1:955195/1‑150 (MQ=255) cTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGGACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgcggcg > 2:1583985/1‑150 (MQ=255) cGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAACACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGcc > 1:109615/1‑150 (MQ=255) cGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGCCTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGcc > 1:1696099/1‑150 (MQ=255) cGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCCCACCTTGCGGCGcc > 1:706298/1‑150 (MQ=255) cGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGcc > 2:1304532/1‑150 (MQ=255) cGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGcc > 1:579130/1‑150 (MQ=255) tattagaTGGCTGGTGTACCTGGATTCGTACCAGGGATTGCCTGTTTCATAACCCGGTGCGTTTCCTCTTGGCGATACGCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGGGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAg < 1:1687160/146‑1 (MQ=255) cGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAAcc > 1:1515295‑M1/2‑150 (MQ=255) gaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCt > 2:542200/1‑150 (MQ=255) | AACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCT > NC_000913/696720‑697012 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |