New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
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atcccgtcatcacccaccactcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTgg > 2:716359‑M1/23‑117 (MQ=255) cTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGc > 2:307725/1‑85 (MQ=255) cccgtcatcacccaccaccGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTAAAGGTAGATAAACTGAATGATAACCTTTCGTTagcaaacc < 2:1800185‑M1/131‑4 (MQ=255) cccgtcatcacccaccaccGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAATGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGCCCCACCAATTTAAACGTGGTAACGGGAAGAGAACGTGAAAGATTACGTTGCGTGagcaagag < 2:1326860‑M1/131‑4 (MQ=255) tCAGGTAACACCCTTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTCGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGcc < 1:1558328/150‑1 (MQ=255) tAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATgtaaaaaagcg > 1:1261509‑M1/1‑90 (MQ=255) tAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATgtaaaaaagcg < 2:1261508‑M1/101‑12 (MQ=255) aaCACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAgg < 1:1330236/150‑1 (MQ=255) cacCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGc > 1:1081966/1‑150 (MQ=255) acCCGAATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGCT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCg < 1:260119/150‑1 (MQ=255) acCCGAATGGGTCGTTAGCTCAGATGGTAGAGCAGTTTACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACTACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCg < 2:537723/150‑1 (MQ=255) ccGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAAGCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCgag < 1:1932196/150‑1 (MQ=255) gTATGGGTGGTTTGCTGATTTGGTTGAGCTGTTGACTTTTAATTAATTGTT‑TGATGGTTCGTTTCCTGCACGACCCACTTATTTTAAGGTTGTTTCTGGTTGATAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAc < 2:1854518/150‑1 (MQ=12) tATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACg < 1:668715/150‑1 (MQ=255) ggggCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAg < 1:578935/150‑1 (MQ=255) | CCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAG > NC_000913/781220‑781518 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |