| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2651755 | 96 (0.800) | 5 (0.040) | 4/262 | NT | 5.1% | coding (533/4962 nt) | yfhM | bacterial alpha2‑macroglobulin colonization factor ECAM; anti‑host protease defense factor; periplasmic inner membrane‑anchored lipoprotein |
| ? | NC_000913 | = 2651772 | 97 (0.860) | coding (516/4962 nt) | yfhM | bacterial alpha2‑macroglobulin colonization factor ECAM; anti‑host protease defense factor; periplasmic inner membrane‑anchored lipoprotein | |||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GTTTGTCTGACTGCCAGTTCGCCAGCGAATTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGATGTCGCGGGTAGTTATAGTTTTTTCGTAATCTTTACTGAAGGTTGCGTTGTTGAGTGCTTTGACCTCCTTGCCAATAGTAACGATCAAATCACGTTTCGGTTCGA > NC_000913/2651606‑2651902 | gTTTGTCTGACTGCCAGTTCGCCAGCGAATTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCGGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAG < 1:777641‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGACTGCCAGTTCGCCAGCGAATTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGgcagca > 2:2048996/1‑150 (MQ=255) tGACTGCCAGTTCGCCAGCGAATTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGcagcag < 1:1055578/150‑1 (MQ=255) gACTGCCAGTTCGCCATCGAATTGCGGTAATCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCagcagc < 1:1245131/150‑1 (MQ=255) gACTGCCAGTTCGCCAGCTAATTTAGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACAGCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTTCCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGcagcagg > 1:1272118/1‑149 (MQ=255) aCTGCCAGTTCGCCAGCGAATTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCg > 2:421521/1‑150 (MQ=255) gCCAGTTCGCCAGCGAATTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAAc > 1:1561184/1‑150 (MQ=255) cAGTTCGCCAGCGAATTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTTTTAACGTTGAGCGCCATTCCCGGCAGCCCTTCCACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAAccc > 1:1289987/1‑149 (MQ=255) ggtctccAGCGAATTGCGGTATTCGCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATGCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGTCATCCCTGAAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACg < 1:306980/145‑1 (MQ=255) gCCAGCGAATTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTTACGCGGAAGAAGTTACCATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCTTTACCGGCTGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGAAGCGAACCACGGctg < 2:1212249‑M2/150‑4 (MQ=255) ccAGCGAATTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGctgg < 2:1961739‑M2/150‑5 (MQ=255) ccAGCGAATTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGctgg > 1:1751402‑M2/1‑146 (MQ=255) cAGCGAATTGCGGAATACCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGctggc > 1:829360‑M2/1‑145 (MQ=255) aGCGAATTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGGGCCATTAGCGGCAGCCCTTGAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACGACGGctggca > 2:1408665‑M2/1‑144 (MQ=255) cGAATTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGctggcaaa < 1:2029525‑M2/150‑9 (MQ=255) aaTTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGccgtggttcgctgctgcctggcaaagt < 2:565580‑M1/150‑28 (MQ=255) aTTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGccgtggttcgctgctgcctggcaaagtc < 1:1134992‑M1/150‑29 (MQ=255) aTTGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGccgtggttcgctgctgcctggcaaagtc < 2:758066‑M1/150‑29 (MQ=255) ttGCGGTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGGAGCAGCGAACCACTGCTGGCAAAACCg < 2:730673/150‑1 (MQ=255) gTATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGccgtggttcgctgctgcctggcaaagtcgttgaa < 1:949377‑M1/150‑35 (MQ=255) tATTCCCATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGcag > 2:1218253/1‑148 (MQ=255) cccATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGtt > 2:934757/1‑150 (MQ=255) ccATTGGCTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTg < 2:919922/150‑1 (MQ=255) 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cTAATGAATGCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACAGGCAGACCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGATGTcg > 2:1045646/1‑150 (MQ=255) aatgaatgCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGATGTcgcg > 1:477907/1‑150 (MQ=255) aatgCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGATGTCGCTGGTa > 1:1752725/1‑150 (MQ=255) atgCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGATGTCGCGGGTAg > 2:1583317/1‑150 (MQ=255) atgCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGATGTCGCGGGTAg > 1:1039574/1‑150 (MQ=255) atgCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGATGTCGCGGGTAg > 1:1669802/1‑150 (MQ=255) tgCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGTCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGATGTCGCGGGTAGt < 1:328462/150‑1 (MQ=255) gCTGGCAGAGATTCTGGCTTAACGCGTAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTTTGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGGCAGGCTGCAGCGAAGCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGATGTCGCGGGTAGtt < 1:124777/150‑1 (MQ=255) ggCAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAAAGTTGAGCTCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCAGGCAGCCGCGCCCCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGGTGTCGCGGGTAGTtata > 2:1025603/1‑150 (MQ=255) cAGAGATTCTGGCTTAACGCGGAAGAAGTTAACATCGACATTATTAACGTTGAGCGCCATTACCGGCAGCCCTTCAACGACTTTGCCGGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAACACCGCCGCTGGGTTGGATGTCGCGGGTAGTTATAGt > 1:367159/1‑150 (MQ=255) 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gACTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGctggcaaagtcgttgaagggctgccggtaatggcgctcaacgttaataatgtcgatgttaacttcttccgcgttaagccagaatctctgccagcattcattagccaatgggaataccgcaat < 1:1134992‑M2/150‑123 (MQ=255) aCTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGctggcaaagtcgttgaagggctgccggtaatggcgctcaacgttaataatgtcgatgttaacttcttccgcgttaagccagaatctctgccagcattcattagccaatgggaataccgcaatt < 2:565580‑M2/150‑124 (MQ=255) aCTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGATGTCGCGGGTAGTTATAGTTTTTTCGTAATCTTTACTGAAGGTTGCGTTGTTGAGTGCTTTGACCTCCTTGCCAATAGTAACGATCAAATCACGTTTc < 1:235874/150‑1 (MQ=255) aCTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGATGTCGCGGGTAGTTATAGTTTTTTCGTAATCTTTACTGAAGGTTGCGTTGTTGAGTGCTTTGACCTCCTTGCCAATAGTAACGATCAAATCACGTTTc < 2:341077/150‑1 (MQ=255) cTTTGCCAGGCAGCAGCGAACCACGGCTGGCAAAACCGACGCTGGGTTGGATGTCGCGGGTAGTTATAGTTTTTTCGTAATCTTTACTGAAGGTTGCGTTGTTGAGTGCTTTGACCTCCTTGCCAATAGTAACGATCAAATCACGTTTCg > 1:171310/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |