| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3411602 | 89 (0.740) | 6 (0.050) | 6/256 | NT | 7.0% | intergenic (+35/‑51) | fis/yhdJ | global DNA‑binding transcriptional dual regulator/DNA adenine methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 3411616 | 78 (0.710) | intergenic (+49/‑37) | fis/yhdJ | global DNA‑binding transcriptional dual regulator/DNA adenine methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAG > NC_000913/3411453‑3411750 | ccTGTTGGACATTGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCT < 1:1370657‑M1/150‑1 (MQ=255)ccTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCT > 1:895285‑M1/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTa > 2:468278/1‑150 (MQ=255) 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tAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTATAGGTGTCACAAAGGGACTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACt < 2:613704/150‑1 (MQ=255) aaaTGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACt < 1:1205395/150‑1 (MQ=255) aaaTGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACt < 2:1612592/150‑1 (MQ=255) aaaTGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACt > 2:1959656/1‑150 (MQ=255) tGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTTTTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTaa > 1:650292/1‑150 (MQ=255) cTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTaaaa > 1:414778/1‑150 (MQ=255) tGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAg < 2:28949/150‑1 (MQ=255) aTTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGAt > 1:737284/1‑150 (MQ=255) aTTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGAt > 2:1939313/1‑150 (MQ=255) ttAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtaccacggttgatgcccatcatcagcgcagcacgggtctggttaccacgg < 2:467032‑M2/150‑124 (MQ=255) tAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGCCCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATcc > 2:1853638/1‑150 (MQ=255) tAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATcc < 1:1583687/150‑1 (MQ=255) aaaaaGGCGCTACTCGGCATGGGGAagcgcctttttaataaagcatatagctaacctgaattacttcatgccgtattatttcaattttttacgcagcgtacaaccgttgatgcgcatcatcagagcagcaggcgtctggttaccacgggt < 1:1622‑M2/150‑126 (MQ=255) aaaaGGCGCTtccccatgccgagtagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgccgcgtaccacggttgatgcccatcatctgcgcagcacgggtctggttgccacgggtg > 1:593167‑M1/1‑10 (MQ=255) aaaaGGCGCTtccccatgccgagtagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtaccacggttgatgcccatcatcagcgcagcacgggtctggttaccacgggtg < 2:1205394‑M1/150‑141 (MQ=255) aaaaGGCGCTtccccatgccgagtagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtaccacggttgatgcccatcatcagcgcagcacgggtctggttaccacgggtg < 1:1121448‑M1/150‑141 (MQ=255) aaaaGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGTGTGACCTTGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATcccc < 1:1541179/150‑1 (MQ=255) aaaGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCccg < 2:126077/150‑1 (MQ=255) gcgcTACTCGGCATGGGCAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGa < 1:792865/150‑1 (MQ=255) cgcTtccccatgccgagtagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtaccacggttgatgcccatcatcagcgcagcacgggtctggttaccacgggtgtattgc > 2:248037‑M1/1‑4 (MQ=255) cTtccccatgccgagtagcgcctttttaatcaagcatttagctaacctgaattagttcatgccgtattttttcaattttttacgcagcgtaccacggttgatgcccatcatcagcgcagcacgggtctggttaccacgggtgtattgcat > 2:69750‑M1/1‑2 (MQ=255) cTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAg > 1:1151778/1‑150 (MQ=255) | CCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAG > NC_000913/3411453‑3411750 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |