| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 1269313 | 104 (0.870) | intergenic (‑38/‑10) | ldrA/rdlA | toxic polypeptide, small/sRNA antisense regulator affects LdrA translation; proposed addiction module in LDR‑A repeat, with toxic peptide LdrA | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCTGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAATTGTTCTGGTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGTCAGGTTGTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGATAACGCCGGCTTGGTG > NC_000913/1269164‑1269462 | cACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCTGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTAT < 2:1423062‑M2/150‑1 (MQ=255)aacCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCTGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTAT > 1:1643596‑M2/2‑150 (MQ=255) cGGTTACGCCACCAGCTGTCATTCGCTGCGGTTATAATTACCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAATATCATGGCAATCTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCGTTGTTGTAATGACATCATTTTGGTTCTATTCTTGAATTGt < 1:1762520/150‑1 (MQ=11) ggTTACGCCACCAGCTGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAATTGtt > 1:1491780/1‑150 (MQ=32) ggTTACGCCACCAGCTGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAATTGtt > 2:1062891/1‑150 (MQ=32) ggTTACACCACCAGCTGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAATTGtt < 1:1882584/150‑1 (MQ=17) ccaccaGCTGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAATTGTTCTGGTTc < 1:1871430/150‑1 (MQ=38) caccaGCTGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAATTGTTCTGGTTCa > 2:1265093/1‑150 (MQ=38) accaGCTGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGCTCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAATTGTTCTGGTTCaa < 1:915057/150‑1 (MQ=255) accaGCTGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAATTGTTCTGGTTCaa < 1:907364/150‑1 (MQ=39) tGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCATGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAATTGTTCTGGTTCAAGATTAg < 1:1305881/150‑1 (MQ=255) tGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAATTGTTCTGGTTCAAGATTAg < 2:185941/150‑1 (MQ=40) tGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAATTGTTCTGGTTCAAGATTAg < 2:872270/150‑1 (MQ=40) 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ggCTATTCTTGAATTGTTCTGGTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGTCAGGTTGTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGATAACGCCGGCt < 2:1700921/150‑1 (MQ=255) gCTATatgacgctcgcgcagtttgccatgattttctggcccgacctggcagcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcagctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaacgggcgtcaggctgccgtgatggcattat < 1:777928‑M2/150‑146 (MQ=255) gCTATatgacgctcgcgcagtttgccatgattttctggcacgacctggcagcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcagctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaacgggcgtcaggctgccgtgatggcaatat < 1:523262‑M2/150‑146 (MQ=255) gCTATatgacgctcgcgcagtttgccatgattttctggcacgacctggcagcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcagctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaacgggcgtcaggctgccgtgatggcaatat < 2:693265‑M2/150‑146 (MQ=255) gCTATTCTTGAATTGTTCTGGTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGTCAGGTTGTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTACCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGATAACGCCGGCtt > 1:1918346/1‑150 (MQ=255) ttaaatgaccctcgcgccgtttgccatgattttctgccactacctggcagcaccgatccgggcgggaattattacggcagcgattgtcagctgggggcgtaaccggaagtaaggtgaaaacgggcgtcaggctgccgtgatggaaatatg > 2:270573‑M2/2‑4 (MQ=255) cTATatgacgctcgcgcagtttgccatgattttctggcacgacctggcagcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcagctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaacgggcgtcaggctgccgtgatggcaatatg < 1:1520540‑M2/150‑147 (MQ=255) tatatgacgctcgcgcagtttgacatgattttctggcacgacctggcagcaccgatcctggcgggaattattacagcagcgattgtcagctggtggcgtaaccggatgtcaggtgaaaccgggcgtcaggctgccgtgatggcaatatgc < 1:317364‑M2/150‑148 (MQ=255) tATTCTTGAATTGTTCTGTTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGTCAGGTTGTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGATAACGCCGGCTTgg < 1:1265094/150‑1 (MQ=255) tATTCTTGAATTGTTCTGGTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGGCAGGTTGTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGATAACGCCGGCTTgg < 1:530253/150‑1 (MQ=255) atatgacgctcgcgcagtttgccatgattttctggcacgacctggcagcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcagctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaacgggcgtcaggctgccgtgatggcaatatgcg > 2:1274925‑M2/1‑2 (MQ=255) atatgacgctcgcgcagtttgccatgattttctggcacgacctggcagcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcagctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaacgggcgtcaggctgccgtgatggcaatatgcg > 1:1107658‑M2/1‑2 (MQ=255) atatgacgctcgcgcagtttgccatgattttctggcacgacctggcagcaccgatcctggcgggaattataaccgcagcgattggcagctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaacgggcgtcaggctgccgtgatggcaatatgcg > 1:1100644‑M2/1‑2 (MQ=255) atatgacgctcgcgcagtttgccatgattttctggcacgacctggcagcaccgatcctggcgggaattaataccgcagcgattgtcagctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaacgggcgtcaggctgccgtgatggcaatatgcg > 1:903358‑M2/1‑2 (MQ=255) tatgacgctcgcgcagtttgccatgattttctggcacgacctggcagcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcagctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaacgggcgtcaggctgccgtgatggcaatatgcgc < 1:870033‑M2/150‑150 (MQ=255) tatgacgctcgcgcagtttgccatgattttctggaacgacctggcagcaccgatcctggcgggaattattaccgcagcgattgtcagctggtggcgtaaccggaagtaaggtgaaaacgggcgtcaggctgccgtgatggcaatatgcgc > 2:995969‑M2/1‑1 (MQ=255) | CACCTTACTTCCGGTTACGCCACCAGCTGACAATCGCTGCGGTAATAATTCCCGCCAGGATCGGTGCTGCCAGGTCGTGCCAGAAAATCATGGCAAACTGCGCGAGCGTCATATAGCCGCCTTGTTGTAATGACAACATTTTGCGGCTATTCTTGAATTGTTCTGGTTCAAGATTAGCCCCCGTTCTGTTGTCAGGTTGTACCTCTCAACGTGCGGGGGTTTTCTCTTTCCAGCAACCAATGCCACCAGGGATAAAGCCCCCGCAACATTGCGCCTCACCGGATAACGCCGGCTTGGTG > NC_000913/1269164‑1269462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |