| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 2,555,201 | 0 | T | C | 7.6% | 291.4 / 12.3 | 105 | intergenic (‑19/+27) | eutR/eutK | eut operon transcriptional activator, AraC family/putative ethanol utilization carboxysome structural protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/45); new base C (4/4); total (55/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.67e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CATGTTCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCC > NC_000913/2555053‑2555347 | cATGTTCATAGACATCCGCTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGGTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGtgttg < 1:1241588/150‑1 (MQ=255) tGTTCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTa < 2:162638/150‑1 (MQ=255) tGTTCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTa > 1:162638/1‑150 (MQ=255) 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gTTAATGCCGGGGGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGc < 2:254424/150‑1 (MQ=255) gtGCCGGGTGTCCTACAACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGCTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGcc > 2:1978455/2‑150 (MQ=255) gtGCCGGGTGTCCTACAACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACAACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCGGTTCGAGCGCATTTCTGGATTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGcc > 2:1356189/2‑150 (MQ=255) aTGCCGGGGGTTGTAGGACACCGGGCACCTCCGACCGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTTCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGcc < 2:978909/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGGCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCa > 2:2148/1‑150 (MQ=255) gCCGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGCAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCCGCCAAAGTGGGCAGCCag > 1:387042/1‑149 (MQ=255) gCCGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCAc > 2:1817097/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACt > 2:660817/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACt < 2:1445912/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTACAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACt > 1:1173933/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGTCCTACAACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACt > 2:447472/1‑150 (MQ=255) cGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCCGCCACtt > 1:807272/1‑150 (MQ=255) | CATGTTCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCC > NC_000913/2555053‑2555347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |