| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,555,206 | 0 | G | A | 8.8% | 295.9 / 13.5 | 105 | intergenic (‑24/+22) | eutR/eutK | eut operon transcriptional activator, AraC family/putative ethanol utilization carboxysome structural protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (52/43); new base A (5/4); total (57/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.52e-01 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TTCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCCTGCCGTC > NC_000913/2555057‑2555354 | ttCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTAgg < 1:482249/150‑1 (MQ=255)ttCATAGACATCCGTTGGCTGTCGTTGATGAACATTATCCAGTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTAgg < 1:1020570/150‑1 (MQ=255) tCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTAGGa > 1:920024/1‑150 (MQ=255) 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ccGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACt > 2:660817/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACt < 2:1445912/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTACAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACt > 1:1173933/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGTCCTACAACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTACCGTCCCGGCTGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTGTTTCAAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACt > 1:546524/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGTCCTACAACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACt > 2:447472/1‑150 (MQ=255) cGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCCGCCACtt > 1:807272/1‑150 (MQ=255) ggttgtAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTcc < 2:2038915/149‑1 (MQ=255) tggtAGGACACCCGGCACCTCCGACTGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCCTg < 2:1868018/148‑1 (MQ=255) tAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCCTGCCg > 1:1681586/1‑150 (MQ=255) aGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCCTGCCGt > 2:1730490/1‑150 (MQ=255) ggACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAATGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCCTGCCGTc < 2:402621/150‑1 (MQ=255) ggACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAATAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCTAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCCTGCCGTc < 2:565019/150‑1 (MQ=255) | TTCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCCTGCCGTC > NC_000913/2555057‑2555354 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |