| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,599,760 | T→G | 5.6% | intergenic (‑102/+169) | livJ ← / ← rpoH | branched‑chain amino acid ABC transporter periplasmic binding protein/RNA polymerase, sigma 32 (sigma H) factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,599,760 | 0 | T | G | 5.6% | 225.7 / 3.6 | 72 | intergenic (‑102/+169) | livJ/rpoH | branched‑chain amino acid ABC transporter periplasmic binding protein/RNA polymerase, sigma 32 (sigma H) factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/30); new base G (2/2); total (40/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.58e-01 | |||||||||||
CCAGCGCGATACATCCTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCGGACTCTCATCCAGGGTT > NC_000913/3599613‑3599909 | ccAGCGCGATACATCCTTCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATActct < 1:772006/150‑1 (MQ=255)ccAGCGCGATACATCCTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCCTTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATActct > 1:1725937/1‑150 (MQ=255)ccAGCGCGATACATCCTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATActct < 1:1017297/150‑1 (MQ=255) cAGCGCGATACATCCTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTg > 1:674889/1‑150 (MQ=255) ctcgcgATACATCCTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATGCTTCTGGTTATTACGGGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGc < 2:1841984/148‑1 (MQ=255) gATACATCCTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTACAGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTATTTCAGCACTTTATTTCGATTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTaaaa > 1:586102/1‑150 (MQ=255) ttACATCCTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAAc < 2:1890773/149‑1 (MQ=255) tACATCCTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACa > 2:1129502/1‑150 (MQ=255) tACATCCTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACa < 2:1780552/150‑1 (MQ=255) cATCCTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGATCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGCacg < 2:1953080/150‑3 (MQ=255) aTCCTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTAAGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATAc < 1:1102821/150‑1 (MQ=255) tCCTTCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATAcc < 1:1796575/150‑1 (MQ=255) ccTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATAccc > 2:480804/1‑150 (MQ=255) cTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGAGTATGCTGCTAAAGCacgggta < 2:660142/150‑7 (MQ=255) gCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGAt > 2:328962/1‑150 (MQ=255) ccAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGAtt > 1:174689/1‑150 (MQ=255) aGTAACTCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGAtttt < 1:1522783/150‑1 (MQ=255) aGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGAtttt < 1:865298/150‑1 (MQ=255) gTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGAttttt < 2:927182/150‑1 (MQ=255) cccTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTACAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGa > 1:76458/1‑150 (MQ=255) ccTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGaa > 1:1642510/1‑150 (MQ=255) ccTTTATGTTCATCCTGAGAATCCACATTCTTCTGGTTTTTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGaa < 2:1233488/150‑1 (MQ=255) cTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAAt < 2:548522/150‑1 (MQ=255) ttATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTTTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACAACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAg < 2:83356/150‑1 (MQ=255) ttATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAg > 2:193042/1‑150 (MQ=255) aTGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTATATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATAGGAATATCt > 1:753394/1‑150 (MQ=255) gTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTAt > 1:1766542/1‑150 (MQ=255) gTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTAt > 2:557185/1‑150 (MQ=255) ccTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGAc < 2:955752/150‑1 (MQ=255) cTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACa < 2:1746006/150‑1 (MQ=255) aTCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTttat < 1:1983816/150‑1 (MQ=255) aTCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTttat > 2:529046/1‑150 (MQ=255) ccccATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTttatta < 2:29117/150‑1 (MQ=255) cccATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTaa > 1:834761/1‑150 (MQ=255) cccATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTaa > 2:513387/1‑150 (MQ=255) tctGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGc > 1:2025711/1‑150 (MQ=255) ggTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTATTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGAATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATATCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTg > 1:558171/1‑150 (MQ=255) tattaCGTGTGTTGTGATGGTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTgggg < 2:720480/150‑1 (MQ=255) cGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTgg > 2:1177117/1‑150 (MQ=255) cGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTCCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATATTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTgt > 2:1605632/1‑149 (MQ=255) tgttgtGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTGTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGtt < 2:1487849/150‑1 (MQ=255) tgttggGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGtt < 2:1444140/150‑1 (MQ=255) tgtgATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTg > 2:1164816/1‑150 (MQ=255) tgtgATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTg > 1:1606193/1‑150 (MQ=255) aTGGTGGTTTTCAGCACTTTATTTCGTTATATGCATGCCGCCCCGGGCTTTCGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATAATGGAATAGCTATTTTGACAGTGTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCgg < 1:967220/150‑1 (MQ=255) tgttgtTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGa > 2:356108/1‑150 (MQ=255) tgttTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAggg < 2:1766541/150‑1 (MQ=255) gttTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATTCTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGGTTATTTACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCAGGAgggg > 2:1357586/1‑150 (MQ=255) gttTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAgggg > 2:725630/1‑150 (MQ=255) cAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTg < 2:174689/150‑1 (MQ=255) gCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGat < 2:1916486/150‑1 (MQ=255) gCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGat > 1:667507/1‑150 (MQ=255) aCTTTATTTCGTTTTATGCATGCCTAACCGTTCTTTAGCAGCATACTCTGGTAAAACATAGCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGatta < 2:393031/150‑1 (MQ=255) cTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGattat > 1:678884/1‑150 (MQ=255) tCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACagag > 1:223456/1‑150 (MQ=255) cATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCaaaaaa > 2:1573591/1‑150 (MQ=255) aTGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAaaaaac < 1:2041370/150‑1 (MQ=255) aTGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGGTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAaaaaac < 2:1666628/150‑1 (MQ=255) 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aCCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCAGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAaaaaacaaaaac > 2:1424464/1‑150 (MQ=255) cGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAAcccc > 1:522183/1‑150 (MQ=255) gTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCg < 1:41763/150‑1 (MQ=255) gttttAGCAGAGTATGCTGCTAAAACATACCCGTTTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCggc > 1:198555/3‑149 (MQ=255) gttttAGCAGAGTATGCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCggc > 1:1740976/3‑149 (MQ=255) cTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCGGAc > 1:776408/1‑150 (MQ=255) tttAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGAAATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCGGAct > 1:1073814/1‑150 (MQ=255) agcagcATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCGGACtctc < 2:1606192/150‑1 (MQ=255) gcagcaTACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCGGACTCTCa > 2:638764/1‑150 (MQ=255) gcagcaTACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCGGACTCTCa > 1:388048/1‑150 (MQ=255) caTACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCGGACTCTCATCCa < 2:674889/150‑1 (MQ=255) aCTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGATTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCGGACTCTCATCCAggg < 1:328962/150‑1 (MQ=255) ctctGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGATGCCCAAAAAACAAAAACCCCGGACTCTCATCCAGGGt > 1:1426383/1‑150 (MQ=255) ctctGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCGGACTCTCATCCAGGGt > 1:734292/1‑150 (MQ=255) tctGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCGGACTCTCATCCAGGGtt > 1:1138506/1‑150 (MQ=255) | CCAGCGCGATACATCCTGCCAGTAACGCTTTACCCTTTATGTTCATCCTGAGAATCCCCATTCTTCTGGTTATTACGTGTGTTGTGATGTTGTTTTTCAGCACTTTATTTCGTTTTATGCATGACTACCCGTGCTTTAGCAGCATACTCTGCTAAAACATACCCGATTTTTATGATATTGGAATAGCTATTTTGACAGTTTATTAACAATCTGCGTGGGGATTGGCGTTTTGCCGGAGGGGAAATTGATTATTACAGAGGCCCAAAAAACAAAAACCCCGGACTCTCATCCAGGGTT > NC_000913/3599613‑3599909 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |