Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,062,371 | A→T | 5.4% | N42I (AAT→ATT) | yihN → | MFS transporter family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,062,371 | 0 | A | T | 5.4% | 391.5 / 8.2 | 130 | N42I (AAT→ATT) | yihN | MFS transporter family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/70); new base T (3/4); total (55/75) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.40e-01 |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTGGTAATGCTATGTCGGTAAACTCATTTGTCACCACAGTGGGCTTTTTTCTGTCTATTTATTTTGCCGATAAACTACCGCGCAGATACACCATGTCATTCTCACTCATTGCGACAGGATTACTGGGTGTTTATTTGACG > NC_000913/4062222‑4062519 | ttttAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATTGGCGTTATTTAGTCTATTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCaa < 1:2010071/150‑1 (MQ=255) ttAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATg > 2:664327/1‑150 (MQ=255) tAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTACCACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATgg > 1:1312331/1‑150 (MQ=255) 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aaTTGTCAAATTGGTAATGCTATCGCGGTAAACTCATTTGTCACCACAGTGGGCTTTTTTCTGTCTATTTATTTTGCCGATAAACTACCGCTCAGATACACCATGTCATTCTCACTCATTGCGACAGGATTACTGGGTGTTTATTTgacg < 2:1312330/150‑1 (MQ=255) | TTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCGTTATTTAGTCTATTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCAGGAATATTTCCATTTGACCAATGGTCAAATTGGTAATGCTATGTCGGTAAACTCATTTGTCACCACAGTGGGCTTTTTTCTGTCTATTTATTTTGCCGATAAACTACCGCGCAGATACACCATGTCATTCTCACTCATTGCGACAGGATTACTGGGTGTTTATTTGACG > NC_000913/4062222‑4062519 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |