| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 935,584 | A→T | 14.5% | P787P (CCA→CCT) | ftsK → | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 935,584 | 0 | A | T | 14.5% | 104.0 / 4.6 | 63 | P787P (CCA→CCT) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/17); new base T (2/6); total (39/24) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.65e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAAC > NC_000913/935437‑935729 | tGTACATCATCCTCATCATGCGTTTGCACGGGAGGTGGAATATCAGGAGCCTCACCAACCATTTCCGCCGCAGCATCAGTTTCAGCAGCCACAACTGCCGGCTGCGCCGCATGAACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCcaca < 2:351212/150‑1 (MQ=12) tACAGCAGCCGCAACACCCGCTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCACCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCAcagc < 1:447342/150‑1 (MQ=255) agcagcCGCCCCCTCCGTTTGCTCCGCAGCAGGAAGATCTTCAGCCGCAACAACCCGTTCCGCCGCAGCATCAGATTCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGACGCAGCAACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACagcagc < 1:1353959/150‑1 (MQ=18) agcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACagcagc < 2:1526544/150‑1 (MQ=255) atccGCAACAACCTGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCAGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAat < 2:910284/148‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACCGCCGGTTGCGCCGCATCCCCACTATCCGCAGCGGCAGCACCCGGGGGCgccgcagccgcagtggc > 2:1762517/1‑145 (MQ=17) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGGATCAGCAGCCTCAACAGCAGGTTGAGCCGCATCCCCAGACACCGCAGCAGCAACAACCGGTGGCGCCGCTGCCGCaaattc > 2:971184/1‑146 (MQ=17) caacaaCCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGAAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAATATCCGCAGCCACAACCGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCCGCAAGATcac > 1:1486979/1‑149 (MQ=21) 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caATATCAGCAGCCGCAACAACCCGGTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGcgccg < 1:1166374/150‑1 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCGCACTATCAGCAGCATCAACAGCCGTTGGGGCCGCATCGGCAATGGCAGCAGCAGCAACAACCGGATACGCCgctgcagg > 2:806839/1‑149 (MQ=18) agcagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCCCAATATCCGCAGCATCAACAACCGGTTGAGCCACATCAGCAATATCAGCAGCAGCAACAACCGAATGCGCCgcagccga > 2:1588177/1‑147 (MQ=25) agcagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCCGCAGCCGCAACCACCGGTTGCGCCACAGCGGGACTATCCGCAGCCGCAACAACCGCAGGCGCCgcagccgc > 1:1362245/1‑150 (MQ=25) agcagcCGCAACAACCAGATCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCgcagcagc < 2:922118/150‑1 (MQ=255) 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acCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCGCAATATCCGCAGCCGCAACCACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGcc > 1:2025410/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACACCCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCCGACGCAACCACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGccc > 1:1757325/1‑149 (MQ=255) gTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCGCAGCCACAATATCCCCAGCAGCAACAACAGTTTGGGCGACAGCACGAAAAACAGCAGCGGCATCAACCGCTTCCGCCGCAGCCGAAGTATCAGCAGCGacaa > 2:627446/1‑150 (MQ=21) cagccgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGAGCCACAGCCGCAATATCAGCAGCCGCAACCACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGtt > 1:1829040/1‑150 (MQ=255) agccgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCGCACTATCCGCAGCCGCAACCACCGGTTGCGCCTCAGCAGCAATATCCGCCGCAGCAACACCCGGTTGCGCCGCAGCTGCAGGAGCAGCAGCGACAgccgccggagg > 1:347234/1‑145 (MQ=255) ataagcagcCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCTCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGGAGTATCAGCAGCAACAACCGCCAGTTGCGCcacacc > 2:1034676/4‑148 (MQ=21) ccgcagcCCCAACACCCGGTCGCGCCGCAGCCACATTAGCAGCCCCCGCAACTACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGGTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCg < 1:1500561/148‑1 (MQ=21) cagcagCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACATCAGCAATATCAGCAGCAGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAACAACAGCCCGATGCGCCACAGCCg > 2:1181081/1‑150 (MQ=21) agcagcCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCCGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTTTCCGCAGCCACTACAGCCAGTGCCGCCACACCCGc > 2:1882985/1‑150 (MQ=21) gcagcCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCa < 1:1568583/150‑1 (MQ=255) caGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTg > 2:1894085/1‑150 (MQ=255) ttgatctgcagcaACATTTTCAGCAGCCTCATCAACCTGTTGCTCCTCAGCATCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATc < 2:1965603/143‑1 (MQ=18) ttGCGCCGCAGCAACATTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCGACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCTGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATc < 2:1862447/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACCGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCCGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATccc > 1:1582123/1‑149 (MQ=255) gccgcAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCCCAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCCGGATACCCTGCTTCATCCGcg > 1:32978/1‑149 (MQ=255) ccgcAGGAAGAATATCAGCAGCCGCAACTAGTGTCGGCTACTGATCATCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCTCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTg < 1:137502/150‑1 (MQ=21) cgcAGCCACAAGCACAGCAGCCGCAACAACCGCCTGCTCCCCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGt < 1:87385/150‑1 (MQ=21) gcAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGCTACCCTGCTTCATCCGCTggt > 2:873849/1‑148 (MQ=255) cacaATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCTCCTCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCGTCCGCTGTTGATGc < 2:1481328/150‑1 (MQ=255) caATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGGTGTTGAGGCgg > 2:52278/1‑149 (MQ=255) aaTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCTCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTa < 2:1398733/150‑1 (MQ=255) tatCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAAt < 2:1172370/150‑1 (MQ=255) atCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATg > 1:1129595/1‑150 (MQ=255) tCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATgg < 1:2008914/150‑1 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCg > 2:710561/1‑150 (MQ=255) 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aacaacCCGACGCGCCACAGAAGAAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGccgtc < 2:568707/150‑1 (MQ=37) acaacCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACCACCGCCATTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCGGCGGTTGATGAGTAATGGCGACAGccgtca > 1:1260078/1‑149 (MQ=25) acaacCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGccgtcc > 2:1729853/1‑150 (MQ=255) caacCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACCGCCAGTTGCGCCACGACCGCCGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGccgtccg > 1:1532522/1‑150 (MQ=255) acCGGTTGAGAAACAGCAGCAATATCAGCAGCCTCAAAAACCGTTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGAAGCCAAAACAGCCAGTTGCGACACAACCGCAGGATACACTGCTTCATACGATGTTTATGCGTAATGGCGACAGACGTCAGtt > 2:1149924/1‑150 (MQ=255) 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cgcCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAAc > 1:1561042/1‑150 (MQ=255) cgcCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCATCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAAc > 2:1104161/1‑150 (MQ=255) | TGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAAC > NC_000913/935437‑935729 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |