| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,356,445 | A→T | 6.6% | intergenic (‑34/+25) | dtpC ← / ← cadA | dipeptide/tripeptide:H(+) symporter DtpC/lysine decarboxylase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,356,445 | 0 | A | T | 6.6% | 275.5 / 5.1 | 99 | intergenic (‑34/+25) | dtpC/cadA | dipeptide/tripeptide:H(+) symporter DtpC/lysine decarboxylase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/43); new base T (3/4); total (52/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGAATGAGTAAGGCACGCATGCCGTAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAGCGCCGATTTCACACAGCAT > NC_000913/4356314‑4356586 | agcaTGAGTAAGGCACGCGTGCCGTAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTccc < 1:16703/140‑1 (MQ=255)agaATGAGTAAGGCACGCATGCCGTAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTGTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTccc > 2:219965/1‑143 (MQ=255) aaTGAGTAAGGCACGCATGCCGTAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTTTGTTC‑CCAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCtt > 1:289253/1‑143 (MQ=255) aTGGGTAAGGCACGCAGGCCGTAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTg < 2:463162/143‑1 (MQ=255) gggaaGGCACGCATGCCGGAAAAACTGGAGTACTCCCAGAGTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCGTTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCTTGCCACTTCCCtttttt < 1:520249/140‑5 (MQ=255) aGTAAGGCACGAATGCCGTAAAAACGGAAGTGCTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGGATATCGCGCGCGGCTGTGAGAGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCTTGCCACTTCCCtttttt < 1:225265/143‑5 (MQ=255) ggaaGGCACGCATGCCGTAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGGGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCTTGCCACTTCCCttttttg < 2:540753/141‑6 (MQ=255) aGGCACGCATGCCGTAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGc < 1:227146/143‑1 (MQ=255) aGGCACGCATGCCGCAAAAGCCCAAGTACCCCCAGATCGGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGCAAAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAg < 1:794326/143‑1 (MQ=255) gCACGCATGCCGTAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCGGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATTTTC‑AAATATGTCACGTGGCTAGCCACTTCCCTTCTTCGAGcgt > 1:270673/1‑141 (MQ=255) cGCCTGCCGTAAAAACTGAACTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAatt < 1:380252/143‑1 (MQ=255) gCATGCCGTAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAatta < 1:316646/143‑1 (MQ=255) gTATAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTg < 2:120303/143‑1 (MQ=255) gTAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTg < 1:691741/143‑1 (MQ=255) gTAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTg < 2:392351/143‑1 (MQ=255) tAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGGTATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGAGTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCACCTTCCCTTGTACGAGCTAATGAGTTTTGGc > 2:424146/1‑143 (MQ=255) tAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGATAAAATATGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAATTGAAGTGGTTATCTACTTCCCTTGTATGAGCTAATTATTTTTTGc > 1:214471/1‑143 (MQ=255) tAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGAATACATGTATTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAATGCACTTCCCTTGTACGCGCTAAGTATTTTTTGc > 1:764192/1‑143 (MQ=255) tAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGGGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAGAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCGTGTGCGAGCTAAATATTTTTTGc > 2:303344/1‑143 (MQ=255) aaaaCTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGGACGAGCTAATTATTTTTTGCtt > 2:685951/1‑143 (MQ=255) gAAGTACCCCCAGATTTGGATCGCCACGCTATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTtcttct < 1:61879/143‑1 (MQ=255) cTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTCGTCATGGGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCCTGTACCACATAACTATGAGTAGCTCTCTTCGTTCaac > 2:605478/1‑142 (MQ=255) taccAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATa > 2:155819/3‑143 (MQ=255) cccAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGTGGGTGTTTTCATGAGTTCTCCTTATGAGC‑AACCAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTTTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCactcc > 1:204406/1‑139 (MQ=255) ccAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGCGGGTGTTTACATGTGTACACCGTATGAGC‑TATGAGGGGAAGTGGCAAGCCACTTCTCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATAcc > 1:517031/1‑143 (MQ=255) ccAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCCCTTCCCTTGTACGAGCTAATTCCTTTTTGCTTTCCTCTTCCCATAcc > 2:294578/1‑143 (MQ=255) ccAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGAGTTCTGCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCACTAcc > 1:722855/1‑143 (MQ=255) ccAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCGGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCCGATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACGGCCCTGGTACGCGCGGATGCTTTTTTCCTTTCTTAtttagacagc > 2:38534/1‑136 (MQ=255) tttGGATCGCCACTATACAGTATATCGCGCTCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAAc < 2:699563/143‑1 (MQ=255) tttCGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGTGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAAc < 2:71480/143‑1 (MQ=255) ctcccaTCGCCACGAGATACTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AACAACGGGACGCGGCACGACCGTTCCGTTGTACGAGCTGATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAAc < 2:765541/138‑1 (MQ=255) tGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTTCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTGTTCTTTCAACACCTTAACgg > 2:576589/1‑143 (MQ=255) tCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTGTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTATTTGCTGTCTTCTTTCACTACCTTAACGGtata > 2:745015/1‑143 (MQ=255) cgtcACGATATAGTGTAACGCGGTAGGCTGTGAGTGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAATAAGGGAGGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAg < 2:612178/140‑1 (MQ=255) cGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAg < 1:470546/143‑1 (MQ=255) ctaCGATATAGTATATCGTGCGCGGCTGTGAGGGTGTTATCATGTGTTCTCCATATGAGA‑AAAAAACAGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCAAATCATTATATGCTTTCGTCTTTCAATAACTTATCGGTACAgag > 2:180254/3‑141 (MQ=255) ccACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGCGGGTGCTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAGGTGGCAAACCCCTTCCCTTGTACGTGCTAATTATTTTGTGCTGTCTGCTTGCACTGCCATAACAGTATAGCg > 2:262518/1‑143 (MQ=255) atatAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGACGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCAt > 1:255217/1‑143 (MQ=255) tataGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGccctg > 1:65221/1‑140 (MQ=255) ctcggatatCGTGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAGAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCATTACCTTAACGGTATAGCGGCCATCa < 2:501399/138‑1 (MQ=255) ataGTATATCGAGCGGGGATTTGAGGAGCTTTTCATCTTTTCTCCTTATGAGC‑AAAAGAGGGAAGTGGCAATCCACTTCCCTTGTACAAGCTAATTATTGTATATTGTCTTGTTTCTATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCa < 2:60215/143‑1 (MQ=255) aGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGc < 1:641435/143‑1 (MQ=255) tataTCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCt > 1:825797/1‑143 (MQ=255) tataTCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCt > 1:204805/1‑143 (MQ=255) atatCGCGCGCGGCTGAGAGGGTGTTTACATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGGGGCACGCCCCTTCCCTTGTACGAGCTAATCATTTTTTGCTTACATCTTTCAATACCTTCACGGTACCACGGccaccacgctg > 2:815852/1‑138 (MQ=255) cgcgcgcgGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACgg > 1:717781/1‑143 (MQ=255) cgcgcgcgGCTGTGAGGGTGTGTTCCTGTGTTCTCCTTACGCGC‑AAACCCGGCAAGTGGCTAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACgg < 2:491972/143‑1 (MQ=255) gcgcgGCCGGGAGGGTGTTTTCCGGTGGTGTTCTTATGAAC‑AAAGAAGGGGAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGGTCTAATTATTTTTTGCTTTCCTCTTTCAATACCTTTGCGGTATAGGGGCCATCAGCCTGACGGTAt < 2:331356/143‑1 (MQ=255) gcgGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGc > 1:282740/1‑143 (MQ=255) gcgGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTGTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTAGAGCGGCCATCGGGGTGACGGTGTGc > 1:104252/1‑143 (MQ=255) cgGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACCGTCTAGCGGCCCTCAGCCTGCCGGTACGCa > 1:241989/1‑143 (MQ=255) ggCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCCTCAGCCTGACGGTCTGCAc > 1:291686/1‑143 (MQ=255) ggCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCAc < 1:413871/143‑1 (MQ=255) cTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCg > 1:736117/1‑143 (MQ=255) tgAGGGTGTTGTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGa < 2:315121/143‑1 (MQ=255) gggTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCACTACCTTAACGATGTAACGCCCCTAAGCCTGACCGTATCCACCTTGCata > 1:403227/1‑143 (MQ=255) ggTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAatgt > 1:736619/1‑141 (MQ=255) tgtTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGTTGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCg < 2:360622/143‑1 (MQ=255) tgtTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCg > 1:53333/1‑143 (MQ=255) ttttCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTGTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGt > 2:10743/1‑143 (MQ=255) ttcgggtgtTCGTCTTATGGGC‑GAAAAGGTGAAGTGGTAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGttt < 2:642545/138‑1 (MQ=255) ttaaTGTGTTCTTCGTATGATC‑AAAAAAGGGGATTGGCATGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGttt < 2:123855/140‑1 (MQ=255) ttCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATCCCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGttt < 1:330319/143‑1 (MQ=255) tCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGAAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTc > 1:532861/1‑143 (MQ=255) tgtgTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCaaa < 1:719637/143‑1 (MQ=255) tgtgTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCaaa < 1:718870/143‑1 (MQ=255) gtgtTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAg < 1:80580/143‑1 (MQ=255) tgtTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGc > 1:205363/1‑143 (MQ=255) tgtTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGCTTCAAAGc > 1:205733/1‑143 (MQ=255) gtTCTGGTTAGGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTGAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGcc < 2:573617/143‑1 (MQ=255) gccctATGAGA‑AAAAAAGTGAAGTGGCAAGCCACCTCCCTTGTACCAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAAGATCTAAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTTAATATCGGTTTCAAAGCCCGGa < 2:748893/139‑1 (MQ=255) cTTGTGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATa < 2:204406/143‑1 (MQ=255) taggAGC‑AAAAAAGGGACGTGGCAAGCCACTTCTCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGt < 2:140911/140‑1 (MQ=255) tATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTGTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTGTGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGAtggg > 1:288742/1‑140 (MQ=255) aagAGC‑AACACCGGGAAGTGGCAACCCAACTCCCTTGCACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGCAGGTACGTATCGTCAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTg < 1:384814/141‑1 (MQ=255) aTGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACg < 1:601787/81‑1 (MQ=255) aTGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACg > 2:601787/1‑81 (MQ=255) gAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAg > 1:217929/1‑143 (MQ=255) aGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTgcgc > 1:798558/1‑143 (MQ=255) aGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCAACCAACAGCCTGACAGTATACACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGacc > 1:702600/1‑141 (MQ=255) c‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATAACGGTTTCAACGCCCGGACCGTgcgcgc > 2:277926/1‑143 (MQ=255) caaagaGGGAAGTGGCAGTGCACGTCCCTTGTCCGAGCTAATTATTTGTTGCTCTCTTCTTTCACTGCCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAGCGcc < 2:736581/142‑1 (MQ=255) agaaacGGGACGTGGCATGCGACTTCCCTTGCACGCGCTACTTATTCTTTGCTTGCTTCCTCCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCTTCAGCCTGACGGTATGCAGCGTGAATATCTGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAGCGcc < 2:401995/141‑1 (MQ=255) aaaaGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCCAAGCCCGGATAGTGAGCGCCGa > 1:373363/1‑143 (MQ=255) aaaaGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTGTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGCATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAGGCCCGGGTAGTGAGCGCCGa > 2:417872/1‑143 (MQ=255) aaaGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGTGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGCATAGTGAGCGCCGAt > 2:74582/1‑143 (MQ=255) aaaGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGACTAGCGGTGTCAAAGCCCGGATGGTGAGCGCCGag > 1:290145/1‑142 (MQ=255) aGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAGCGCCGAttt > 1:93840/1‑143 (MQ=255) gggAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGGTTCAAAGCCAGGATATGCAGCGCCGATTTc > 2:147631/1‑143 (MQ=255) ggAAGTGGCTTGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAGCGCCGATTTca > 1:437165/1‑143 (MQ=255) ggAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCGTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCGCGGATAGTGAGCGCCGATTTca < 2:722855/143‑1 (MQ=255) ggAAGGGGCAAGGCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTGTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCGGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAGCGCCGATTTca < 1:786090/143‑1 (MQ=255) gaGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGATCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCATTACCTTAATGGTATAGCGGCCATCAGTCTGACAGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCATAGCCCGGATAGTGAGCGCCGATTTcaca < 2:665800/142‑1 (MQ=255) caGTCGCAAGCCACTTCTCTTGTACGATCTAATTATTTTTTGCTTTCTCCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTTACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAGCGCCGATTTcaca < 2:764192/142‑1 (MQ=255) aGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAGCGCCGATTTcacac < 2:769815/143‑1 (MQ=255) tGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAGCGCCGATTTCACACAg > 1:690698/1‑143 (MQ=255) gtcAAGCCACCTCCCTCGTACGAGCTAGTTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAGCGCCGATTTCACACAGc < 2:816536/141‑1 (MQ=255) ggCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATCGTGAGCGCCGATTTCACACAGc > 1:23269/1‑143 (MQ=255) cAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAGCGCCGATTTCACACAGCAt < 1:88529/143‑1 (MQ=255) | AGAATGAGTAAGGCACGCATGCCGTAAAAACTGAAGTACTCCCAGATTTGGATCGCCACGATATAGTATATCGCGCGCGGCTGTGAGGGTGTTTTCATGTGTTCTCCTTATGAGC‑AAAAAAGGGAAGTGGCAAGCCACTTCCCTTGTACGAGCTAATTATTTTTTGCTTTCTTCTTTCAATACCTTAACGGTATAGCGGCCATCAGCCTGACGGTATGCACCGTGAATATCGGTTTCAAAGCCCGGATAGTGAGCGCCGATTTCACACAGCAT > NC_000913/4356314‑4356586 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |