New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4306577 = | 30 (1.450) | 3 (0.150) | 3/250 | NT | 9.9% | coding (21/1986 nt) | yjcS | alkyl sulfatase |
? | NC_000913 | 4306596 = | 26 (1.330) | coding (2/1986 nt) | yjcS | alkyl sulfatase |
AATTCTGATTAACCTGTTGGGTATATTGAGTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTTAATAAGTGGAAGTGTGAGCGGAACGCGCCATTTTATTAGGCATT > NC_000913/4306459‑4306737 | cgctcacacttccacttattaaagtcgcaatttcccaattatgataacgccagctttaaatgacgtatcttgcatgtattacatatttacgacataaatgataaatggagatttatatGAATAACCGAGAGTTATTCATATaa > 2:215263‑M1/119‑143 (MQ=255) aTTCTGATTAACCTGTTGGGTATATTGAGTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATaaa > 1:96279/1‑143 (MQ=255) cttaTTAACCTGTTGGGTATATTGAGTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAAtct < 2:199655/140‑1 (MQ=255) aCCTGTTGGGTATATTGAGTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATCACCGAGAGTTAATCATATAAGTCTCcaatta > 2:133470/1‑143 (MQ=255) cttattaaagtagcagtttcccaatgatgataacgctagcgttaaatgacgtattttgcatggattacatatttacgacataaatgataaatggagatttatatGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCcatttatca > 2:360811‑M1/105‑143 (MQ=255) tGGGTATATTGAGTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCcatttatcattt < 1:351079/143‑1 (MQ=255) atatTGAGTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGATAAAACGGAATAACGGAGAGTTATTCATATAAATCTCTATTTATAATTTATGTc > 1:65537/1‑143 (MQ=255) atTGAGTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATCACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATCTAAATCTCCATTTATCATTTATGTCgg > 1:104552/1‑142 (MQ=255) gTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGACCGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTAACATTTATGTGATAAata > 2:352287/1‑143 (MQ=255) tatgataacgccagctttaaatgacgtattttgcatggattacatatttacgacataaatgataaatggagatttatatGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCAt > 1:359158‑M1/80‑143 (MQ=255) tCGCTGCCTCGCTCGCGTTAGCGGTATCTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCAt < 2:21728/143‑1 (MQ=255) cGCTTCCTCTTGCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATg < 2:20714/143‑1 (MQ=255) cTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCa > 1:300245/1‑143 (MQ=255) ttCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCaa > 1:214726/1‑143 (MQ=255) ttCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAAAAATCCGGCTCGAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCAGTGATGTCGTAAATATGTAATCCAGGCaa > 2:154451/1‑143 (MQ=255) cggtaccGGTATTTACCATCATGCTGCTGGCGGCAGTTAACTCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCAGTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCAtt < 2:288580/137‑1 (MQ=255) cgTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCAtt > 1:353322/1‑143 (MQ=255) gTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCTCTTTATCGTTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCAttt > 1:376256/1‑143 (MQ=255) gCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGGATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAg > 2:66366/1‑143 (MQ=255) gCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTGTTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAg > 1:208580/1‑143 (MQ=255) aTTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGc < 1:297068/143‑1 (MQ=255) aTTTACCAGCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGc < 1:209414/143‑1 (MQ=255) atggattacatatttacgacataaatgataaatggagatttatatgaataactctcggttattcATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATa > 1:359158‑M2/65‑143 (MQ=255) tGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATaac > 2:310660/1‑142 (MQ=255) tGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAAt > 1:58260/1‑143 (MQ=255) gcAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAACTCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGc > 1:322018/1‑143 (MQ=255) cAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATGTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATCCAAAATACGTCATTTAAACCTGGCGTGATCATCATTTGGAAATTGCg > 2:87975/1‑143 (MQ=255) tgataaatggagatttatatgaataactctcggttattcATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAACGCTAGCGTTATCATCATTGGGAAACTGCTACTTTAATAAg > 2:360811‑M2/40‑143 (MQ=255) aaTCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTGAAAAAGTGGaa > 2:128130/1‑143 (MQ=255) aaTCCTGCGCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTTAATAAGTGGaa > 2:179375/1‑143 (MQ=255) tCAAACGGAAGAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATGTATCATTTATGTCGTAAATATGTAAGCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTTAATAAGTGGAAGTGTGAGc < 1:133470/143‑1 (MQ=255) ttatatgaataactctcggttattcATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATACATGCAAGATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTTAATAAGTGGAAGTGTGAGCg > 2:215263‑M2/26‑143 (MQ=255) CCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTTAATAAGTGGAAGTGTGAGCGGAACGCGccagt < 1:354974‑M1/143‑3 (MQ=255) cGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTTAATAAGTGGAAGTGTGAGCGGAACGCGCCAttt > 1:219850/1‑143 (MQ=255) gagattcATAGAAATCACCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAAGCCATGGAAAATACGGCATTTAAAGCTGGCGTTATCAGAAGTGGGAAATTGCGACTTTAATAAGTGGAAGTGTGAGCGGAACGCGCCATTttatta < 2:381587‑M2/136‑1 (MQ=255) tattcATATAAGTCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAGATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTTAATAAGTGGAAGTGTGAGCGGAACGCGCCATTTTATTAgg < 2:14777‑M2/138‑1 (MQ=255) tattcATATAAATCTCCAGTTATAATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGGCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTTAATAAGTGGAAGTGTGAGCGGAACGCGCCATTTTATTAgg < 1:4696‑M2/138‑1 (MQ=255) cATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATGGGGAAATTGCGACTTTAATAAGTGGAAGTGTGAGCGGAACGCGCCATTTTATTAGGCAtt < 2:104552‑M2/142‑1 (MQ=255) | AATTCTGATTAACCTGTTGGGTATATTGAGTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTTAATAAGTGGAAGTGTGAGCGGAACGCGCCATTTTATTAGGCATT > NC_000913/4306459‑4306737 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |