| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4044087 | 109 (1.610) | 6 (0.110) | 6/230 | 6.4 | 6.5% | intergenic (+43/‑112) | dsbA/yihF | thiol:disulfide oxidoreductase DsbA/uncharacterized protein YihF |
| ? | NC_000913 | = 4044061 | 84 (1.520) | intergenic (+17/‑138) | dsbA/yihF | thiol:disulfide oxidoreductase DsbA/uncharacterized protein YihF | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGCGTTCCGGCGATGTTTGTTAACGGTAAATATCAGCTGAATCCGCAGGGTATGGATACCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCAGCATAAGTGGATATTCAAAGTTTTGCTGTTTTATCAGGGAATATTTATATGA > NC_000913/4043919‑4044202 | ggCGTTCCGGCGATGTTTGTTAATGGTAAATATCATTTGAATCTGCAGGGTATGGATAGCAGGAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACAt < 1:42062/143‑1 (MQ=255)ggCGTTCCGGCGATGTTTGTTAACGGTAAATATCAGCTGAATCCGCAGGGTATGGATACCAGCAATATGGCTGTTCTTGTTCAGCAGTATGCTGGTACCGTGATATATCTGTCCGTGACAAAATAATTCAATGTAAATTACAt > 1:346746/1‑143 (MQ=255) tttgttAACGGTTAATATCATTTTAATCCTTATTGTTTGGTTATTAGTTATTTTGTTTTTTTTGTTCATTAGTATGCTGATACAGTGAAAGATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAatat < 1:333801/143‑1 (MQ=255) tcatcGGTAAATATCAGCTGTATTCGCAGGGTATGGATACCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTTATACAGTGAAATATCTGTCCTAGAAAAAATAATTCTATGTATATTATATAAAGCCCGTGAATATTTAc < 2:402788/139‑1 (MQ=255) tttCAGCTGAATCCGCAGTGTATGTATACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATGTGTATGCAGATACAGTGAAAGATCTGGCCGAGAAAAAATAATTGAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCttttttt < 1:499971/141‑1 (MQ=255) atCAGCTGAATGCTCAGTCTATGTTTACCAGCTATATAGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAATTATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTtta < 2:1037485/143‑1 (MQ=255) atCAGCTGAATCCGCAGGGTATGGATACCAGCAATATTGTTGTTTTTGTTCATCAGTTTGCTGATACAGTGAAAAATCTGTCCGAGAACAAATAATTCCATGTAGAGTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTtta < 1:851424/143‑1 (MQ=255) actaagtGAATCCGCAGTGTATGGATACCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATCCAATGCCAAATCTGTCCGATAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCTCGTGAATATTCACGGGCTTTTTtta < 2:14942/137‑1 (MQ=255) tccgCTGTATCCGCAGGGTATGGATACCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTttat < 2:1136260/140‑1 (MQ=255) cTGAGTCCGCGGGGTATGGAGACCAGCAATAGGGATGTTTTTGTTAAGCAGTATGCTGAGACAGTGAAATATCTGTCCGAGACAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTattatt < 2:60320/143‑1 (MQ=255) cTGAATTCGCAGGGTATGGTTATCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCTAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTattatt < 2:1254167/143‑1 (MQ=255) cTGAATCCGCAGGGTATGGATACCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTattatt > 2:535710/1‑143 (MQ=255) aaTGCGCAGGGTATGGATACCACCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAATTTTGAGAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTtaa < 2:1235114/143‑1 (MQ=255) aaTCCGCAGGGTATGGATACCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTtaa > 2:1127305/1‑143 (MQ=255) aaTCCGAAGGTTATGGATACCAGCAATATTGTTGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGGAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTtaa < 1:1155767/143‑1 (MQ=255) aTCCGCAGGTTATGGCTACTAGTAATATTCATTTGTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCGGGCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTtaat < 1:319709/143‑1 (MQ=255) cGCAGGGTATGGATACCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTaataaa > 1:941007/1‑143 (MQ=255) cgggTATGGATACCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAataaatat < 2:453169/142‑1 (MQ=255) ggATACCAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGTTGATACAGTGAAATCTCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAAcaca > 1:625258/1‑143 (MQ=255) ggATACCAGCAATATGGACTTTTCTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTTAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCTATGTATATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACa < 2:1147507/143‑1 (MQ=255) aTACCAGCACTATGTATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATATTGTTTTTTTTTTGTCTGAGAAAAAAGAATTCAATGTAAATGACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACAtt < 1:1293/143‑1 (MQ=255) cAGTAATATGTATGTTTTTGTTCAGCAGTATCTTGATACATTTAAATATCTGTCCGAGAAAAAACAATTCATTGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTTACTGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGa < 2:1008874/143‑1 (MQ=255) cAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGa > 1:679607/1‑143 (MQ=255) cAGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTAACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGa > 1:751967/1‑143 (MQ=255) aGCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATCTAAATACATTCTGAt > 2:334847/1‑143 (MQ=255) gCAATATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAAGAAATATAAATACATTCTGATa < 1:1003970/143‑1 (MQ=255) cAATATGGATGTTTTTGTTCAGAAGTATGCTGATACAGTAAAATATCTGTCCGATAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATaa < 2:131371/143‑1 (MQ=255) aaTATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAt < 1:649103/143‑1 (MQ=255) aaTATGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACAGAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAAt < 1:1054332/143‑1 (MQ=255) atatGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATg < 2:844460/143‑1 (MQ=255) gttGGCTGTTTTGTTTCAGCATGACGATTATAAAGTGAAATATCTGTCTGAGAAAAATTAATTTAATTTATATTACATAAAGCCCGTGAATATTCGCGGCTTTGTTTGAGTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGc < 2:670513/141‑1 (MQ=255) tGGATGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTAATAATACAt > 2:439818/1‑143 (MQ=255) aTGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATACATcat > 2:1187336/1‑141 (MQ=255) tGTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTg > 1:1088829/1‑143 (MQ=255) cttttttGATCAACACTATCCTGACACAGTAAAACATCTCTACAACAAAAAATAATTCAATGTAAACTACATAAACCCCCTGAATATTCACGCGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTg < 2:871890/141‑1 (MQ=255) gTTTTTGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAACAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATTATTCATCCtcc > 2:181180/1‑141 (MQ=255) tttttGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATTCATTCTGATAATGCATcgttcc > 2:665183/1‑138 (MQ=255) tttttGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATAGATTCTGATAATGCATCATGcc > 2:925182/1‑143 (MQ=255) tttttGTTCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTATGATAATGCATCCTGcc > 2:1243743/1‑143 (MQ=255) tgtgCAGCAGTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTg < 2:28540/143‑1 (MQ=255) tCAGCAGTGTGCTGATACAGTGCAATATCGGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGGCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGAc < 2:1050374/143‑1 (MQ=255) cagTATGCTGATACAGTGAAATATCTGTCCGAGAAAAAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCATGAATATTCACGGGCTATTTTTATTATTTAATAACTATAAATACAATCTGATAATGCATCCGGCCGCTGGACatta > 2:589909/1‑143 (MQ=255) tGCTGATACAGTGTAATATCTGTCCGAGAAATAATAATTCAATGTAAATTACATAAAGCCCGTGAATATTCACGGTCTTTTTTTATTATTTAATAAATATAAATACATTCTGATAATGCATCCTGCCGCTGGACATTATTTCa < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |