| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 866,530 | T→C | 8.1% | intergenic (‑166/‑38) | moeA ← / → iaaA | molybdopterin molybdotransferase/isoaspartyl dipeptidase proenzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 866,530 | 0 | T | C | 8.1% | 158.4 / 3.2 | 60 | intergenic (‑166/‑38) | moeA/iaaA | molybdopterin molybdotransferase/isoaspartyl dipeptidase proenzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/17); new base C (3/2); total (40/20) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 | |||||||||||
CTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACAGGAATTACGCTACATCGAGGCGTT > NC_000913/866399‑866662 | cTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAACATTCTGATATTTATAGCAAAAGTgg > 2:442564/1‑143 (MQ=255) tattatGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAACGTGGc > 1:809964/1‑143 (MQ=255) tattatGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGc > 2:795206/1‑143 (MQ=255) attatGTGAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCg > 2:381909/1‑143 (MQ=255) tatGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTTCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGaa < 2:910819/143‑1 (MQ=255) atGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGaaa > 2:570140/1‑142 (MQ=255) tCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGCGCGTAGCGCTGGATCCTGCCTTTACATGCCACACCCATCTCTCTATCTTCAACAATTGAATGAGGACTTCATAAAAATTCTGACATCTACAGCAAAAGTAGCGCaccca > 2:122359/1‑141 (MQ=255) aGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAAATCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAacaacca > 2:701785/1‑142 (MQ=255) aaaaCGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTa < 1:980424/143‑1 (MQ=255) cGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAACATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATgg > 1:817641/1‑143 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAACACTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCCAACCACCCTTAATGGAc > 2:416108/1‑143 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTACAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGAc > 1:998751/1‑143 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTACTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTACAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGAc > 1:201299/1‑143 (MQ=255) tGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTACTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAGTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATCGCAAGAGTGGGGAACCAGCCTTCATGGACGAATAcga > 1:738973/1‑141 (MQ=255) tGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGATCCTCCCTTTACGTGTCATATGCATCTTCCTATATTCAAAAATTGAAGAATTAGTTGATAATAATTCTGATATTGATAGCAAGAGTGGTGAAAGACCCTTAAAGGACGAATCCTa > 2:179095/1‑143 (MQ=255) tATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATCTCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAGTAATGCTGATGTTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATg > 1:340157/1‑143 (MQ=255) tATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATg < 2:652636/143‑1 (MQ=255) ccACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTACTGGACGAGTACTATGGGCa > 1:70470/1‑143 (MQ=255) gTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCAtt < 1:578186/143‑1 (MQ=255) gTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCAtt < 1:802688/143‑1 (MQ=255) tAGCGCTGGGTCCTGCATTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTg < 2:951603/143‑1 (MQ=255) ggTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAAGTCATAAAAATTCTTATCTTTATAGCAAAAGGGGCGAACCACCCATAATGGACGAATACTAAGAGCAAAGCAGTCATTGCAATTCaa > 2:918639/1‑142 (MQ=255) gTCCTGTCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCAtg < 2:200461/143‑1 (MQ=255) tCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCAtgg > 2:61696/1‑143 (MQ=255) cTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGACCCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCAtggtg > 1:558756/1‑143 (MQ=255) aTGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGc > 2:844083/1‑143 (MQ=255) tGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCa > 2:728353/1‑143 (MQ=255) tGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCa > 1:940212/1‑143 (MQ=255) ggccaatccatccGTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCACAAAAATGCTGATATCTAAAGCAAATTTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAAGACTAGGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCaa < 2:790352/138‑1 (MQ=255) tatCCATCTTTGTATATGCTAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGAGATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATTGACGAAGACGATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAg < 2:434701/143‑1 (MQ=255) atCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAAGTAGc > 2:560344/1‑143 (MQ=255) tCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCGGGTGCAATTAGcc > 1:912209/1‑143 (MQ=255) atgtgtCTATCTGCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCcgcg < 2:284997/138‑1 (MQ=255) aTCTTTCTATATTCAAAAATTTAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGGGGCGAACCAACATTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCcgcg < 2:820220/143‑1 (MQ=255) cTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTCATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCAGAGCGCata > 1:405431/1‑141 (MQ=255) cTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGa > 1:405468/1‑143 (MQ=255) tataTTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGAt < 1:103067/143‑1 (MQ=255) tataTTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGAt > 2:70962/1‑143 (MQ=255) tataTTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGAt > 2:189051/1‑143 (MQ=255) tatGCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGa < 1:249216/143‑1 (MQ=255) tCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTc > 1:771010/1‑143 (MQ=255) tCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAAATCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTc > 2:312753/1‑143 (MQ=255) aaaaaTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTg > 1:997678/1‑143 (MQ=255) aaaaaTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTg > 1:661449/1‑143 (MQ=255) aaaaTTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGc > 2:605985/1‑143 (MQ=255) ttGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACa > 1:608241/1‑143 (MQ=255) aaTGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGTAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACAGGa < 1:381909/143‑1 (MQ=255) tGAGTAATTCATAAAAATTCCGATATTTATAGCCAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATCCTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACAGGAAt < 1:563866/143‑1 (MQ=255) gTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCATATGAGTCTGAAACAGGAAtgaa > 1:399118/1‑140 (MQ=255) aaTTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAAGCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAAGGAGCCGCGGGCAGATGAGTCTGCAACAGGAAGTACGc > 2:1030572/1‑143 (MQ=255) aaTTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATCGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGCTGCAATTAGCCGCTCGCAGATGAGGCTGGAACAGGACTTACGc > 2:1030577/1‑143 (MQ=255) ttCATAAAAATTCTGATATTTACAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACAGGAATTACGCTa < 2:201299/143‑1 (MQ=255) ttCATAAAAATTCTGATATTTACAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACAGGAATTACGCTa < 2:998751/143‑1 (MQ=255) aTAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAAGTAGCCGCGCGGAGATGAGTCTGCAACAGGAGTTACGCTAGAt > 1:464978/1‑143 (MQ=255) tAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACAGGAATTACGCTACAta > 1:272190/1‑142 (MQ=255) tAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACAGGAATTACGCTACATc < 1:578792/143‑1 (MQ=255) aaaaTTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTAGGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACAGGAATTACGCTACATCGa > 2:1003889/1‑143 (MQ=255) aaaTTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATAGTGGCGCAGGTGCAGTTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACAGGAATTACGCTACATCGAg > 2:968853/1‑143 (MQ=255) ttCTGATGTTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACAGGAATTACGCTACATCGAGGCg < 1:616223/143‑1 (MQ=255) cTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACAGGAATTACGCTACATCGAGGCGtt < 2:809964/143‑1 (MQ=255) | CTATTATGTCAGAAAAACGCCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATCTTTCTATATTCAAAAATTGAATGAGTAATTCATAAAAATTCTGATATTTATAGCAAAAGTGGCGAACCACCCTTAATGGACGAATACTATGGGCAAAGCAGTCATTGCAATTCATGGTGGCGCAGGTGCAATTAGCCGCGCGCAGATGAGTCTGCAACAGGAATTACGCTACATCGAGGCGTT > NC_000913/866399‑866662 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |