Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,482,224 | T→G | 8.1% | intergenic (+23/+31) | ynbD → / ← azoR | putative phosphatase/FMN dependent NADH:quinone oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,482,224 | 0 | T | G | 8.1% | 170.6 / 2.3 | 73 | intergenic (+23/+31) | ynbD/azoR | putative phosphatase/FMN dependent NADH:quinone oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/34); new base G (4/3); total (36/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAAT > NC_000913/1482083‑1482365 | gatgtgaCGGGCACTCGAATACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATCCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTTACAGACCAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAata < 1:168585/142‑1 (MQ=255) ttaCGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGGTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGACTGAGATGTGGACTGAATACCTa > 2:693056/1‑143 (MQ=255) ttaCGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTa > 1:509014/1‑143 (MQ=255) gACACTGTAAAACCGTTGATGAAGCTATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTc < 2:231744/143‑1 (MQ=255) gACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTc < 1:297992/143‑1 (MQ=255) acacTGGAAGACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTcc < 2:821469/143‑1 (MQ=255) tGTAAAACCGTTAGTGAAGCGATTCGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGACGTCGCGACGGTGCGAAAACCGGGACGTGGATTGACGTGGGGACAGAACATCTACAGTCcaccg > 2:874269/1‑141 (MQ=255) tGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGTGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAACGACGCGAAGAACAAAGAAAAACAGGAAAGAGGATTGAGATATGGACTGAATATCTACAGTCCACAt > 2:517383/1‑143 (MQ=255) tGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGCGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCCCAAAGCGATGCGGAGATTATGGGACAACAGGTAGGTGGACTGAGATGTGGACTGAAGATCTACAGTCcacct > 2:43980/1‑141 (MQ=255) tGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACAt > 1:326474/1‑143 (MQ=255) tGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCAAAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACGGGTAAGGAGAGTGAAATGTGGACTGAATATCTAGAGTcgaaat > 2:288332/1‑138 (MQ=255) gTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGTAGATATTCAGTCCACATc < 1:126343/143‑1 (MQ=255) tAAGACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGTAGATATTCAGTCCACATct < 1:449840/143‑2 (MQ=255) aaaaCCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCaa > 1:978547/1‑143 (MQ=255) aaaCCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACCAAGCGGTGCTGAGATTATGGGAAAACAGGGACGGGGAGTGAGACGTGGAGCGAAAATCTACAGGCCACCTCAAg > 2:671762/1‑143 (MQ=255) aCCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGAc < 2:492894/143‑1 (MQ=255) aCCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGAAGCCGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAAGATCTACAGTCCACATCAAGAc > 2:710511/1‑143 (MQ=255) cGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCAGAGATTCGGGGAAAACAGGTGAGTGGATTGAGATGGGGACTGAATATCTACCGTCCACAGCAAGAcag > 2:219673/1‑141 (MQ=255) aaTGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACCAGCACAAAGCGATGCTGAGATCATGGGAAAACAGGGAACTGGATTGAGATGTGGACTGAAGATCCACACTCCACACCCAGACCGTGTc > 2:507451/1‑143 (MQ=255) aaGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGCGACTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGt < 1:148117/143‑1 (MQ=255) aGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGCCTGCATAGCTACAGTCCACATCAAGACCGGGGCCGGtt > 2:1013370/1‑143 (MQ=255) ctaataacTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTAt < 1:646430/136‑1 (MQ=255) gtttcgCTATATTAGAGCCAGACGCCCTCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGCGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATg < 2:155029/138‑1 (MQ=255) gATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGCGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGCGGATTGAGATGTGGACTGCATATCTACAGTCCACAACAAGACGGGGTCCAGTGATg > 2:215530/1‑143 (MQ=255) cTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGaaa < 1:579170/143‑1 (MQ=255) atatTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTGCCCATCAAGACCGTGTCCGGGTATGCAGAcaca > 2:80877/1‑143 (MQ=255) tatTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGAGGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACaa < 1:358347/143‑1 (MQ=255) gtgcaggCCAGACGCACGGAGAGTTTGCGGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGACAACATGTGAGTGGGGTGAGATGTGGACGGAATATCTACAGTGCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAAt < 2:125529/137‑1 (MQ=255) atTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGaa > 2:56674/1‑138 (MQ=255) atTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGaa < 1:56674/138‑1 (MQ=255) tccGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATg < 1:268783/141‑1 (MQ=255) tCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGc > 1:251131/1‑143 (MQ=255) aGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGAt > 2:199837/1‑143 (MQ=255) aCGCCAGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAGAGCGATGCTGGGATTAGGGGAATACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATgg < 2:787965/143‑1 (MQ=255) ccGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACACTGCTGTCGctgcctgc > 2:820194/1‑143 (MQ=255) ccGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgctgc > 1:660049/1‑143 (MQ=255) cGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgctgct > 1:454501/1‑143 (MQ=255) cGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCGGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgcggct > 1:89259/1‑143 (MQ=255) gCAGATTGTGCTGACGGACGAGCACGAAGCGATGCTGAGATTATGGGAACACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCGAGACCCTATCCTGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCtt < 2:637474/143‑1 (MQ=255) gCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAAAAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCtt > 1:1023043/1‑143 (MQ=255) aTTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGc < 1:517383/143‑1 (MQ=255) aTTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGc > 1:211520/1‑143 (MQ=255) gtGACAGACGCGCTAGCAGCGTTGTGGAGATTATGGGAAAACGGGTAAGTGGACTGAGATGTGGACTGACTATCTACAGTCCACATCAAGGCCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGa < 2:551727/142‑1 (MQ=255) cTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCACGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGa < 1:549579/143‑1 (MQ=255) aCAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAGTATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTCTTGGGTCAGAGtg > 2:569989/1‑143 (MQ=255) cAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACtgt > 2:662062/1‑143 (MQ=255) aGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACtgtg > 2:206460/1‑143 (MQ=255) gCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCg > 2:993020/1‑143 (MQ=255) cacaAAGCGATGGTGCGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGc < 2:956398/143‑1 (MQ=255) aTGCTGAGAGTAGTGGAAAACAGGTAGGTGGAGTGAGAGGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAGCAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTc < 2:557510/143‑1 (MQ=255) aTGCGGAGAGTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATGGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACAGCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTc < 1:239176/143‑1 (MQ=255) tGCTGAGTTTATGTGAAATCAGGTAAGTGGATTGAGAGGAGGACTGAATATCGACAGGCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTcc < 1:114844/143‑1 (MQ=255) gagaTTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCCACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGACGTCAACCTTCAGTCGATGGCTGCTTTGGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGAc > 1:486278/1‑143 (MQ=255) gagaTTATGGGAAAACAGGGAAGTGGATGGAGAGGTGGACTGAAGATCTACAGTCCACATCGAGACAGTGACTTCTTGTGCAGACTCAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGAc < 2:126474/143‑1 (MQ=255) tGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGc > 1:562879/1‑143 (MQ=255) tGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATAAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGc > 2:903355/1‑143 (MQ=255) gactcccggTAAGTCGCTTGAGATCTGGACTGACTATCTCCAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGAt < 1:726141/136‑1 (MQ=255) gaccgcAGGCATGTCGACTGAGATCTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGAt < 1:649899/138‑1 (MQ=255) gAAAAGAGGGAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGAt < 1:856804/143‑1 (MQ=255) gAAAACAGGTAAGGGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGAt < 1:835866/143‑1 (MQ=255) aaaaCAGGTAAGTGGATTGAGATGGGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATc < 1:290478/143‑1 (MQ=255) ttAAGTGGATTGAGATGTGGACGGAATATCTACAGTCCACTTCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCgg < 1:640034/142‑1 (MQ=255) tAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGc < 2:509014/143‑1 (MQ=255) aGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGAGCGGTCACTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGa < 2:472235/143‑1 (MQ=255) gttgATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGaa < 2:608360/140‑1 (MQ=255) gTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCGGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGaa > 1:25273/1‑143 (MQ=255) gTGGATTGAGATGCCGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACCATGCTATGGTGTGGTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGTCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGaa < 1:396396/143‑1 (MQ=255) tGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAg < 2:211520/143‑1 (MQ=255) agaTGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAAtt > 1:665955/1‑143 (MQ=255) tgtgGACTGTAGATATTCAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGAGCCCTTCGGCGGAGACACATTTca > 2:867117/1‑143 (MQ=255) acggAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCg < 1:854839/140‑1 (MQ=255) aCTGAATTTCTACTGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCg < 2:140718/143‑1 (MQ=255) aCTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACACTGCTGTCGATGGCTGCTCTTGCGTCAGCCTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCCTATGCGATCCCTTCGGCCAAGCACAATTTCACATCg > 2:361495/1‑143 (MQ=255) aCTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCg > 2:390126/1‑143 (MQ=255) atatCTACAGTCCACATCAAGACTGTGCCCGTGTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAAt > 2:921917/1‑143 (MQ=255) | TATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAAT > NC_000913/1482083‑1482365 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |