Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,208,201 | G→A | 8.0% | V60M (GTG→ATG) | ttdT → | L‑tartrate:succinate antiporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,208,201 | 0 | G | A | 8.0% | 179.2 / 4.6 | 71 | V60M (GTG→ATG) | ttdT | L‑tartrate:succinate antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/38); new base A (2/4); total (29/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.29e-01 |
GCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTGATTTT > NC_000913/3208062‑3208343 | gcgggCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGAtggtgg < 1:112228/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTggg < 1:576319/143‑1 (MQ=255) tgccGGTCATCGCCAGTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGt < 2:74362/140‑1 (MQ=255) tGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGGTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGt < 2:44753/143‑1 (MQ=255) gtgCGGGCAGCGCCACTATGGCTCTTCTTCCGGGTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGt < 2:366100/141‑1 (MQ=255) ggCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAGCCCCTGCCGGGTGCCGTGGTTGCGATGGCgggga > 1:226672/1‑141 (MQ=255) aTCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGCACCCCTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTGTATccct > 1:331207/1‑141 (MQ=255) tCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGCCTGATCCTCGCACCCGTCCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATCTCcatc > 2:378858/1‑143 (MQ=255) ccATTGTTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACGTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGATGGATATACCCaccatc < 2:274020/143‑1 (MQ=255) ccATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCatcatc > 1:26133/1‑143 (MQ=255) ccATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGATGGATATACCCaccatc < 2:391365/143‑1 (MQ=255) attattGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGc < 1:877615/143‑1 (MQ=255) ttattGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGcc < 2:996245/143‑1 (MQ=255) ttattGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGcc < 2:853194/143‑1 (MQ=255) ttattGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGATGGATATACCCACCATCGcc < 1:648363/143‑1 (MQ=255) ctctAGTGCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGATGGATATACCCACCATCGCCaccacg < 2:88983/143‑6 (MQ=38) ctctACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTCGTGGCGCTTGTGGGTATAACCATCATCGCCATAccc > 2:153575/1‑141 (MQ=255) tctACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGGGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCGATCATCGCCATGctct > 1:989236/1‑143 (MQ=255) tctACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGAACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATActct > 1:821128/1‑143 (MQ=255) cGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCCTCATCGCCATACTCGCTCGCTgg > 2:160124/1‑143 (MQ=255) gtcggcGCACGCCTGGTGACCCATACCTGGCTCTCCTTTGCCGTTTTTACTGGCGTCATCGTTGGACTGCTCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGgct < 2:316522/138‑1 (MQ=255) gCAGGGCGGGAGAACCCTACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGtt < 1:75788/143‑1 (MQ=255) aGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCa > 2:575398/1‑143 (MQ=255) gggCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTCCTGGCGTGATCGTTGGACTGCTCCTCGAACCCCTGCCCGGTGCCGTGGTGGCCATGGTGGGTATATCCCTCATCGCCATCCTCTCTCCCTGTCTGCTGTTCAg < 1:859433/143‑1 (MQ=255) gCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGctgctg > 2:151085/1‑136 (MQ=255) gCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGctgctg < 1:151085/136‑1 (MQ=255) cTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATCCTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGccc > 1:163076/1‑143 (MQ=255) tGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTAATAGCGTGATCGATTGGCTGCTGCACGAACCCGTGCCGGGTGCTGTTTTTGCGTAGATGGGTAAAAGCGTGATCGCCCTCCCCCCTTCATGGCTTGTGTTCAGcgca > 2:171172/1‑140 (MQ=255) gagaACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGa < 1:623885/143‑1 (MQ=255) agaACCCTCCCTGGCTCTACTTGGCTGTTTTTACTGGGGTGTTCGTTGGCCTGTTCGTCGTCGCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATTTCCCTCGTCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGag < 2:269456/143‑1 (MQ=255) agaACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGag < 1:869157/143‑1 (MQ=255) aCCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTACCGAGGGCCGTTTTTGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTAGCTGCTGTTCAGCCCGgcgcgg > 2:317121/1‑141 (MQ=255) ccATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGagcagc < 2:203104/143‑1 (MQ=255) cATACCTGGCTCTACTTGGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGGTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAgct < 2:628334/143‑1 (MQ=255) tACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCCTACTCTCTCCCTGGGTGCTGTTCAGACCGGagcagcccc > 2:100179/1‑140 (MQ=255) tACCTGGCTCTACTTGGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGAGCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAgctcg < 2:393872/143‑1 (MQ=255) cTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCACTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAgctccctc > 2:11487/1‑143 (MQ=255) ggCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGCCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAg < 1:33628/143‑1 (MQ=255) tctACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTCGGACTGATCGTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCa < 2:226672/143‑1 (MQ=255) ctccTTGGCCGTTTTTACTGGCGCGATCCTTGGACTGACCCTCCAACCCGTGCCGGGTGCCGGGGTGGCGATGGTGGGTATACCCATCACCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGCGCAGCTCGCTCAGCCAg < 1:1018058/140‑1 (MQ=255) tACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGACCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAgg < 1:797574/143‑1 (MQ=255) ccGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTaaa > 1:600143/1‑143 (MQ=255) ccGTGTTTACTGGCGTGATCGTTGGGCTGATCCCCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTaaa < 1:491711/143‑1 (MQ=255) ccGATTTTACCGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGCGCCGGGTGCCGTTGTGGCAGTGGTGCGTATTTCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTCTTCAGTCTTGATCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTaaa < 2:317481/143‑1 (MQ=255) gcttttACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCCGGAACCCGTGCCGGGTGCCGGGGTGGCGACGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAAtt < 1:323344/141‑1 (MQ=255) gTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAAtg > 2:258942/1‑142 (MQ=255) cGTGCTCGTTGGACTGATCCTCGAACCAGTGCAGGGTGCCGCGCTGGCGATGGTGGGCATATCCATCATCCCCATACTCTCTCCCTGCCTGCTGTTCGGCCCGGAGCCGCACGCTCAGCCAGACTTTAGATTGCCTGCatgat > 2:992856/1‑139 (MQ=255) gttaTCGTTGGACCGACCCTCCAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATc < 1:228401/140‑1 (MQ=255) tCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCctc > 1:96354/1‑143 (MQ=255) ttGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCg < 1:909659/143‑1 (MQ=255) ttGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCg < 1:138095/143‑1 (MQ=255) gACGGATCCGCGAACCCGTGCCGCGCGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTgg < 2:460749/143‑1 (MQ=255) tggtCCGCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCGGGCTTCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGcc < 2:1040200/140‑1 (MQ=255) tGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCGAGGCTTTAAATTCACTGCACAATCCCTCTCGTGGGcc > 1:912437/1‑143 (MQ=255) tGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGcc > 1:441934/1‑143 (MQ=255) gATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATGATCGCCATACTCTCTCAATGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTGTGAATGCACTGCAGAATCCCTCTCGTCGGCCg > 1:885849/1‑143 (MQ=255) cTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCGGTATc > 2:867144/1‑143 (MQ=255) cTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTc > 2:861561/1‑143 (MQ=255) cTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTCAAATGCGCTGCCACATCCCTCTCGCGCGCCGTGTc > 2:733301/1‑143 (MQ=255) gAACCCGGGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCgg < 1:459877/143‑1 (MQ=255) aaCCCGTTCGGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGt < 2:142779/143‑1 (MQ=255) gcccGGGCCGGGGACCGTGGTGGCGGTGGGGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGtt < 2:970225/142‑1 (MQ=255) ccGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGtttt > 1:354297/1‑143 (MQ=255) ggCCGGGCGCCGTGGTGGCGAGGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCt < 1:160124/142‑1 (MQ=255) ccGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTAAGCCCGCAGTTGCTCGCCCCGCCAGGCCTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGCGGGCAGTTTCCGGCATATCCAATTCCGtt > 2:422247/1‑143 (MQ=255) cGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAAGTCGGtga > 2:56436/1‑141 (MQ=255) tggCGTTGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCCCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTgg < 1:635714/143‑1 (MQ=255) ggCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGc < 1:575398/143‑1 (MQ=255) gCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCCGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCt < 1:567563/143‑1 (MQ=255) gCGATGGTGGGTATAGCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCt < 1:153575/143‑1 (MQ=255) gCGATGGGGGGTATATCCATCATCGCCATCCCCTCCCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCt < 2:934323/143‑1 (MQ=255) cGATGATGGATATACCCACCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCCCTCGTGGGCCGTTTCCGGCTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTg > 2:364755/1‑143 (MQ=255) tggtgcGTATATCCGTCATCGCTATACTTTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCCGCCGGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTGAtt < 2:241957/143‑1 (MQ=255) ggtggGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTCCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTGAttt < 1:658402/143‑1 (MQ=255) gtggGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGCCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTGAtttt > 1:954068/1‑143 (MQ=255) | GCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTGATTTT > NC_000913/3208062‑3208343 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |