| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 568678 = | 2845 (48.780) | 34 (0.610) | 20/268 | 2.3 | 1.3% | intergenic (+31/‑17) | emrE/ylcJ | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE/protein YlcJ |
| ? | NC_000913 | 568704 = | 2546 (45.930) | coding (10/150 nt) | ylcJ | protein YlcJ | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 392 total aligned reads displayed.
GACAATTAAGGTCACATTATCTTGAATATACAACAATAATCGTATTGCAATTTTCTTACGCCATAATCTTGAAAGCACAAAAGAATACATAAAAAATAAAGACATTAACAAAAAGCATAAAACGAGGCTCATATAAATATAAGAGCCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/568826‑568678‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gagcctcGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTA‑TTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTTAAATAAAAAATAAA > NC_000913/568704‑568845 GACAATTAAGGTCACATTATCTTGAATATACAACAATAATCGTATTGCAATTTTCTTACGCCATTATCTTGAAAGCACAAAAGAATACATAAAAAATAAAGACATTAACAAAAAGCATAAAACGAGGCTCATATAAATATAAG > 2:969770/1‑143GACAATTAAGGTCACATTATCTTGAATATACAACAATAATCGTATTGCAATTTTCTTACGCCATAATCTTGAAAGCACAAAAGAATACATACAAACTAAAGACATTAACAAAAAGCATAAAACGAGGCTCATATAAATCTAAG > 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CGTTTTATGCTGTTTGTTAATGTCTTTA‑TTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTTAAATAAAAAATAAA < 1:517503/143‑1 CGTTTTAGGCTTTTTGTTAATGTCTTTA‑CTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTTAAATAAAAAATAAA < 1:20203/143‑1 GACAATTAAGGTCACATTATCTTGAATATACAACAATAATCGTATTGCAATTTTCTTACGCCATAATCTTGAAAGCACAAAAGAATACATAAAAAATAAAGACATTAACAAAAAGCATAAAACGAGGCTCATATAAATATAAGAGCCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/568826‑568678‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gagcctcGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTA‑TTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTTAAATAAAAAATAAA > NC_000913/568704‑568845 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |