New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3721998 = | 57 (1.010) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.2% | noncoding (1366/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | NC_000913 | 3722033 = | 55 (1.040) | noncoding (1401/1443 nt) | IS150 | repeat region |
CGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAA > NC_000913/3721892‑3722175 | tttgtctcaggtattcaccgaaaggcagacagagaaaagccccacctgactataaatcaaagtttgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgctattcaattggagtcagaccta > 2:632315‑M2/143‑143 (MQ=255) ggggtgtTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGAGGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCtata < 2:178885/140‑1 (MQ=255) ggAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAACAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCtata > 1:655808/1‑143 (MQ=255) ggttttttATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGc < 2:999404/140‑1 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gatgaGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACt > 1:71908/1‑143 (MQ=255) gatgaGTGAAGTAAGATAAGCGAACTGAAGAATGCTGTTACGGAACATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACt < 1:423815/143‑1 (MQ=255) ttCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGACTATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGCCTCCAATTGACTAT‑CGGAATCAGACCGAGATGCCTCGGGTTTAACT‑GTCCac > 1:18076/1‑142 (MQ=255) tAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACtttt > 1:871142/1‑143 (MQ=255) atatAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGTATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTg < 2:1000297/143‑1 (MQ=255) aGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGACAAAAT‑ATGTTGTTTTTGCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTc > 1:1098506/1‑143 (MQ=255) aGCGAACTGAAGGATGCGGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAAGTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTc < 2:489814/143‑1 (MQ=255) aaGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAAc < 2:701503/143‑1 (MQ=255) ggATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACtt < 1:1040263/143‑1 (MQ=255) aTGCTGTGAAAGAATATATTGAATACTACAACAGAAGAAGAATTACCCTGAAAATAAAAGGTCCGTCTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTAGATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACGTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTg < 2:1016722/143‑1 (MQ=255) tGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGa < 2:71908/143‑1 (MQ=255) cTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGAtt < 2:812132/143‑1 (MQ=255) cTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGAtt < 2:635374/143‑1 (MQ=255) ttACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTtat < 1:548497/143‑1 (MQ=255) gtACGGCATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGCAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTtat < 2:417804/142‑1 (MQ=255) caaCGCAATACATGAAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTtat < 1:727650/141‑1 (MQ=255) aCGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAATGGGATGGCTCCAATCGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAg < 1:511230/143‑1 (MQ=255) cGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTTATTTATAGt > 2:752867/1‑143 (MQ=255) aaTATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAg > 2:13319/1‑143 (MQ=255) tagtGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAGGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTgg < 2:925967/140‑1 (MQ=255) 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aaTACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTCTTGGGGTCAATACAAACTTTGCTTTATCGTACGGTTGGGcgt > 2:468064/1‑141 (MQ=255) actacAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATGAAAAGGGCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTACAACTTTTTGGGGTCAGTCCAACCTTTGATTTATACTCAGGTGGGGCTTTtc > 2:135468/1‑143 (MQ=255) ctacAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTtct > 2:637114/1‑143 (MQ=255) ctacAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTtct < 1:204272/143‑1 (MQ=255) cgacaacaGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTtct < 2:24851/141‑1 (MQ=255) 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gaaTTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCg < 2:755192/143‑1 (MQ=255) aTTAGCCTGAAATTACAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGt < 1:449259/143‑1 (MQ=255) tAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGa < 1:464494/143‑1 (MQ=255) tGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATAcc > 2:660859/1‑143 (MQ=255) tGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGATGGGGATTTTCTCTGTCTCGCTTTCGGTGAAtcct > 2:1085852/1‑140 (MQ=255) aatgcaaaGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGTATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATCTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTga < 2:1003227/138‑1 (MQ=255) aaTTAAAAGGTCTGACTTCTATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATTCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTga < 2:309597/143‑1 (MQ=255) ttAAAAGGTCTTACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTgaga < 1:839760/143‑1 (MQ=255) tgaaaaGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTgaga < 1:153008/141‑1 (MQ=255) aaaGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACaa < 1:784516/143‑1 (MQ=255) 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gacctATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCtt > 1:564986‑M2/6‑143 (MQ=255) gacctATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCGGAGACAAACGGTCACAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCtt > 2:952463‑M2/6‑143 (MQ=255) tATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTCCAAGCTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTtaata > 2:964146‑M2/2‑143 (MQ=255) atatGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCCATTCTAGCTtaataa > 2:497235/1‑143 (MQ=255) | CGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAT‑CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACT‑GTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAA > NC_000913/3721892‑3722175 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |