| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3830353 | 51 (0.900) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.7% | intergenic (+17/‑104) | xanP/yicH | xanthine:H(+) symporter XanP/AsmA famly protein YicH |
| ? | NC_000913 | = 3830358 | 52 (1.000) | intergenic (+22/‑99) | xanP/yicH | xanthine:H(+) symporter XanP/AsmA famly protein YicH | |||||
AGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAGCTGCTTCTCTACATTCTCATCGCTCT > NC_000913/3830218‑3830500 | aGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAAtt < 2:617536‑M2/143‑3 (MQ=255) gCCGCTGGTTTTGCAGGCTGCGCCTGAGTGGCTGAAAAGCCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCAGCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAAtta > 2:56891‑M2/1‑140 (MQ=255) gATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAATCTTGCTCTCCTCCGGGAGCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAAttaccgccg > 1:533890‑M2/1‑134 (MQ=255) aGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCa > 1:1034663/1‑143 (MQ=255) aGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCa < 1:639311/143‑1 (MQ=255) aGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTACGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCa > 2:19764/1‑143 (MQ=255) ccccTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCCCCTCtt > 1:664495/1‑143 (MQ=255) cgAACAACCTGCTCTCCTCCGGTATCGCCGCGGGCGGCCTTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCg < 2:624838/142‑1 (MQ=255) aaaacCCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCCATTG‑GTTGTATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGcc < 1:509636/143‑1 (MQ=255) aaCCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGAGTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAAGCACCGCCGCAGTCTCACCGCCTTAACCATTCCAGctcca > 2:775879/1‑139 (MQ=255) aCCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGa < 1:617536/143‑1 (MQ=255) cTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTCAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGCgg > 1:36208/1‑143 (MQ=255) ctcctcCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGCTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTGTAACCATTCCCGCCTTGAGAGTTgc > 1:498476/1‑143 (MQ=255) tccGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGt < 1:839950/143‑1 (MQ=255) tccGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGt < 1:840060/143‑1 (MQ=255) ggATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAAt > 1:911638/1‑143 (MQ=255) gATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATc > 1:337402/1‑143 (MQ=255) ccgcGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATCTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTATCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGACTGCGCGTAAACAGTGCa > 2:453856/1‑143 (MQ=255) cTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTAtgtg > 2:793215/1‑143 (MQ=255) tG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTCTCACCATTCCCGCCTTGTTGATTGCGCGTAAATCGTACATAAATCACTTaaatgc > 1:11501/1‑138 (MQ=255) ccATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGCAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTAATGTGCAt > 1:417517/1‑143 (MQ=255) cATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCAtt < 1:19764/143‑1 (MQ=255) gCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCGTTTCACgg > 1:176170/1‑143 (MQ=255) aTCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATgg < 1:396624/143‑1 (MQ=255) aTCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATgg < 1:1038230/143‑1 (MQ=255) tCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAAttaccgccgccagtgaattactgtttttctggtgggaaaatcagattcagcacgatggcagtaataccgcccgcggcgatcccggaggagagc < 1:438388‑M2/143‑94 (MQ=255) tCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGa > 2:134718/1‑143 (MQ=255) tCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGa > 2:500413/1‑143 (MQ=255) tCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGa > 1:1106662/1‑143 (MQ=255) cTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGCCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCACGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGaa > 1:3604/1‑143 (MQ=255) ttttCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGAcc > 2:245669/1‑143 (MQ=255) tttCCCACCAGAAAAACAGTAATTAAATGGCGGCAGTAAGATAATTACAGCCACAGTATCACCTCTTTACCAATTCCCGCCTTGAGAATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCCTTTCACGGGCTGGCAGACCa > 1:901807/1‑143 (MQ=255) tgcccACCAGACAAGCAGTAATTCACTCGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCAt < 2:221815/141‑1 (MQ=255) tCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATg > 2:1049754/1‑143 (MQ=255) cccACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAAttaccgccgcccgtgaattactgtttttctggtgggaaaatcagattcagcacgatggcagtaataccgccggcgccgatgccggaggacagcaggtctctc < 2:327595‑M2/143‑103 (MQ=255) cccACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGa < 1:1060914/143‑1 (MQ=255) ccacctGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGaa < 2:911638/143‑1 (MQ=255) caccaGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGaaa > 1:291697/1‑143 (MQ=255) caccaGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCCTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACGAAGaaa > 2:686710/1‑143 (MQ=255) caccaGAAAAACAGTAATTCACTGGCGACGTGAAGATAATTACCGCCGCAGACTCACCGCTCTGACCAGCCGTGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTAGGTGCATTTCACGGGGTGGAAGACCATgcac > 2:1078108/1‑140 (MQ=255) accaGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAAt > 1:1010590/1‑143 (MQ=255) caGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTCTGTGAATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAAttc > 2:227148/1‑142 (MQ=255) accaCAGTAATCCACTGGCGGCGGTAAGATGATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTg < 2:940051/140‑1 (MQ=255) acaaCAGTAACCCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGGAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTg < 2:908443/141‑1 (MQ=255) aaaCAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAAttaccgccgccagtgaattactgtctttctggtgggaaactcagattcagcacgatggcagtaataccgcccgcggcgatcccggcggagagcaggtttttcagccattcag < 1:583637‑M2/143‑113 (MQ=255) aaCAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTggg < 2:633282/143‑1 (MQ=255) aCAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCATTGACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGGAGACCATGAAACTTATTGGGa > 1:137133/1‑143 (MQ=255) cAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGaa < 1:793215/143‑1 (MQ=255) aGTAATTCACTGGCGGTGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGTAAGACCATGAAATTTATTGGaaaa > 1:608205/1‑142 (MQ=255) aGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGGTAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGCTTGCGCGTAAATCGTGCAGAACTCCCTTATGTGCATTTCGCGGGATGGAAGACCGTGCAAGTGATTGGGagg > 1:271972/1‑141 (MQ=255) tAATTCCCTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAgct < 1:613170/143‑1 (MQ=255) aTTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATCTCATGGGCTGGACGACCATGACATTTCTTGAGAAgctgc > 1:265045/1‑143 (MQ=255) aCTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAAGTTACTGGGAAGCAGCttgt > 1:111688/1‑141 (MQ=255) tGGCGGCGGTAAGCTGATTCCCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAGCTGCTTctct < 2:1040527/143‑1 (MQ=255) tGGCGGCGGCAAGATAATTGCCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCAGCCCCGCCGTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAGCTGCTTctct < 1:129140/143‑1 (MQ=255) gcggTAAGATGATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAGCTGCTTCACTatagt < 2:1031171/143‑5 (MQ=255) gcggTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAGCTGCTTCTCTACAtt < 1:614645/143‑1 (MQ=255) ggTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAGCTGCTTCTCTACATtct < 1:1079245/143‑1 (MQ=255) gATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAGCTGCTTCTCTACATTCTCATCg > 1:317319/1‑143 (MQ=255) gATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAGCTGCTTCTCTACATTCTCATCg > 1:1033312/1‑143 (MQ=255) aTTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAACTCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAGCTGCTTCTCTACATTCTCATCGctct > 1:264686/1‑143 (MQ=255) | AGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAGCTGCTTCTCTACATTCTCATCGCTCT > NC_000913/3830218‑3830500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |