Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,196,204 | G→A | 74.5% | intergenic (‑105/+128) | thiC ← / ← rsd | phosphomethylpyrimidine synthase/regulator of sigma D |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,196,204 | 0 | G | A | 74.5% | 85.8 / 29.3 | 62 | intergenic (‑105/+128) | thiC/rsd | phosphomethylpyrimidine synthase/regulator of sigma D |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (8/8); new base A (22/22); total (32/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.83e-01 |
TTGTTCGCGGCGGGTCAGTTTTGTTGCAGACATAGCTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAGCGCAGAACTCAAGCAGGATGTTT > NC_000913/4196067‑4196346 | ttgttCGCGGCGGGTCAGTTTTGTTGCAGACATAGCTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGGTGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGt > 1:85070/1‑143 (MQ=255) ttCGCGGCGGGTCAGTTTTGTTGCAGACATAGCTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTAtt > 2:639665/1‑143 (MQ=255) gcggcgGGTCAGTTTTGTTGCAGACATAGCTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGc < 1:642718/143‑1 (MQ=255) cggGTCAGTTTTGTTGCAGACATAGCTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGa > 1:26756/1‑143 (MQ=255) cggGTCAGTTTTGTTGCAGACATAGCTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGa > 1:368185/1‑143 (MQ=255) gggTCAGTTTTGTTGCAGACATAGCTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGAt < 1:910080/143‑1 (MQ=255) aGTTTTGTTGCAGACATAGCTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTGGCCTGAGCAGGt > 1:146699/1‑143 (MQ=255) ttttGTTGCAGACATAGCTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAACCCACAGAAGAAGCAAGAGACGAGCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACCCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCGGATCAGGGTc > 2:786293/1‑143 (MQ=255) ttgCAGACATAGCTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCgg > 2:565215/1‑143 (MQ=255) gCTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATaa > 1:700155/1‑143 (MQ=255) cTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATaaa > 1:1105750/1‑143 (MQ=255) tCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCACTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCCGATCCCGAATaacc > 2:343537/1‑141 (MQ=255) cATTCCAAAAGGTTACGGACGTGGCTTGTCAGCCGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTGGTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACg < 2:905073/143‑1 (MQ=255) tCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGtc < 1:166364/143‑1 (MQ=255) cAAAAAGTTACGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGCTGAAGCAAGAGACGCTCGCCGCAGGGGCGCTGCGGTCGCGGCTTAACTCTTGTTCCCTCGCCGGGCGTTAGCCTGCTCAGGTGCCGCGGAGCCCGCATCCACgggcgc > 1:40065/1‑139 (MQ=255) cAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGTGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGtct‑c < 1:98264/143‑1 (MQ=255) cAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGtct‑c > 1:499061/1‑143 (MQ=255) cAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGtct‑c > 1:531171/1‑143 (MQ=255) cAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGtct‑c > 1:125294/1‑143 (MQ=255) aaaaaGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑Ca < 2:1050949/143‑1 (MQ=255) aaaaaGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGAGTAACTCTTGTTCCCTGCACAGGTGTTAGCCTGAACAGGTCCCGCGGATCCCGAGTAAACGCTCT‑Ca > 2:69800/1‑143 (MQ=255) caaGTTAAGGGCGTTGCTTGTCAGACTACGGACACAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTATCTCTTTTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGc < 1:398346/142‑1 (MQ=255) ggACGTGGCTTGGCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATGAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAg < 2:168648/143‑1 (MQ=255) cGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCa < 1:306597/143‑1 (MQ=255) ggCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTc > 1:961988/1‑143 (MQ=255) cTTCTCACACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCg < 1:114053/143‑1 (MQ=255) ttGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGa < 1:639665/143‑1 (MQ=255) gTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGCCT‑CAGCCCGTCAAGGCCCCCCGAcc > 1:951942/1‑142 (MQ=255) tCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACaa < 1:178529/143‑1 (MQ=255) aGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGACTAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACACGa > 2:917726/1‑143 (MQ=255) cgacgGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAAt < 2:368185/143‑1 (MQ=255) gacgGATGAAGCTAGAGACGTTCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCGGATCAGGTGCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAAtt < 1:129734/143‑1 (MQ=255) acgGATGCAGCAAGAGACGCTCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTa < 2:744246/143‑1 (MQ=255) aTGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGccc > 2:686944/1‑143 (MQ=255) tGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCACTTCACAGGTCTTAGCCTCATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCGCTCCGACAGGAACTGAGcccc > 1:210804/1‑143 (MQ=255) gCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑aa > 1:900622/1‑143 (MQ=255) agaCGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATggg < 2:26756/143‑1 (MQ=255) agaCGACCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCGTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTGAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATggg < 2:740275/143‑1 (MQ=255) tcgcaTCGCCCCTGCGGCGATGCGATAGCAGATTAACTATTGTTCCCTTCACCGGTATTAGCCTGATCACGTGCCGCGGATCGCGAATAAACGGTCTCCGGCCAG‑TAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCAC‑CAAGgggg > 2:513003/5‑143 (MQ=255) gacgacCCCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATgggg < 1:701745/143‑1 (MQ=255) aTCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCGCAGGTCTTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGCTCCCGAATCCACGGTCT‑CAGCCCGTTAAGGCACTCAGACAAGAAAATAACCCCGC‑AAACGGGACacg > 1:126716/1‑141 (MQ=255) aTCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACGGGTATTAGCCTGAGCAGGGTGCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCGGTTAAGGAGCTCCGGAGAGAAGTTGGCCCCGC‑AGAGGGGGCAtt > 1:95876/1‑143 (MQ=255) aTCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCACTACCCAGCTTATTGACTGATGAGGTTTATAGTTTCCCTATGAAACGGTCT‑CAGCCCGTTACGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AGATGGGGCAtg > 1:257478/1‑142 (MQ=255) ccgcTGGCGCGATGCGCTCGCATACTAGCTCTTGTTCCCGCCACAGGTATTCGCCTGATCAGCTTCCGCGGATCCCGAATACACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAAt < 2:576786/143‑1 (MQ=255) ccgcAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCAAGCCACACCACTCCGACAAGAACGGAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGagt > 2:658028/1‑141 (MQ=255) ccgcAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTAATAGCCTGATCAGGTTCCGCGGAGCCCGAATAAACGGTGT‑CAGCCAGTTAAGGCACTGCGACAAGAAATTAGGCGCGC‑AAATGGGGCAtgggat > 1:227502/1‑138 (MQ=255) cgcAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATg > 2:201887/1‑143 (MQ=255) ggggCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATGCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGCAAAATGGGGCCTTGAATGtca > 1:155765/1‑141 (MQ=255) gcgatgcgatAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTa < 1:966950/143‑1 (MQ=255) gatgcgatAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGACAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTAcg > 2:297798/1‑143 (MQ=255) cAGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAgc > 2:357243/1‑143 (MQ=255) aGATTAACTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAgcg < 2:125294/143‑1 (MQ=255) aGATTAACTCTGGTTCCCTTCACAGGCATTAGGCTGCTCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGGCAAGAAATTAGCCCGGC‑ACGTCGGTCACTGAATGTAAATTACGCGTTAACAgcg < 2:907176/143‑1 (MQ=255) aaCTCTTGTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAGCGCAGaa < 2:700155/143‑1 (MQ=255) aaCTCTTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAGACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAGCGCAGaa < 1:641454/143‑1 (MQ=255) tctTGTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCCTTGAAAGTAAAGTACGCGTTAACAGCGCAGAACTc > 1:623780/1‑143 (MQ=255) ctTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAGCGCAGAACTCa < 2:85070/143‑1 (MQ=255) ctTGTTCCCTTCACAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAGCGCAGAACTCa < 1:651859/143‑1 (MQ=255) tcgTTCCCTTCGCAGGTATTCGCCTTATCAGGTTTCGCGGATCCCTAATCAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGATATTAGCCCCTC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAGCGCAGAACTCaa < 1:321084/141‑1 (MQ=255) ggtCCCTTCGCAGGCATGCGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAGCGCAGAACTCAAGc < 1:293057/141‑1 (MQ=255) ccTTCACAGGTAGTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACGCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAGCGCAGAACTCAAGCAGGa < 2:40242/143‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGTTTGCCTGGTCATGTTCCGCGGATCCCGATTAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTATATTACGCGTTAACAGTGCAGAACTCAAGCAGGATg < 2:402893/143‑1 (MQ=255) gCAGGTATTAGCCTGATGAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAGCGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAGCGCAGAACTCAAGCAGGATGttt < 1:300816/143‑1 (MQ=255) gCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATACACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAGCGCAGAACTCAAGCAGGATGttt < 2:14232/143‑1 (MQ=255) gCAGGTACTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAGCGCAGAACTCAAGCAGGATGttt < 1:144/143‑1 (MQ=255) | TTGTTCGCGGCGGGTCAGTTTTGTTGCAGACATAGCTCATTCCAAAAAGTTAAGGACGTGGCTTGTCAGACGACGGATGAAGCAAGAGACGATCGCCGCAGGGGCGATGCGATAGCAGATTAACTCTTGTTCCCTTCGCAGGTATTAGCCTGATCAGGTTCCGCGGATCCCGAATAAACGGTCT‑CAGCCAGTTAAGGCACTCCGACAAGAAATTAGCCCCGC‑AAATGGGGCATTGAATGTAAATTACGCGTTAACAGCGCAGAACTCAAGCAGGATGTTT > NC_000913/4196067‑4196346 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |