Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,497,953 | A→T | 6.4% | intergenic (+13/‑319) | intB → / → insC‑6 | KpLE2 phage‑like element; putative integrase/KpLE2 phage‑like element; IS2 insertion element repressor InsA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,497,953 | 0 | A | T | 6.4% | 219.1 / 6.7 | 79 | intergenic (+13/‑319) | intB/insC‑6 | KpLE2 phage‑like element; putative integrase/KpLE2 phage‑like element; IS2 insertion element repressor InsA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/32); new base T (2/3); total (43/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.52e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.97e-01 |
CATAAAGCAGAGCATCTGGAAGAACGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCATTATTTATATACATTCAATAAAAA > NC_000913/4497812‑4498095 | gaTAAGGCAGAGCATCTGGAAGAACGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGTAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCaaa < 1:1053201/142‑1 (MQ=255) cATAAAGCAGAGCATCTGGAAGAACGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAAAATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCaaa > 1:1095844/1‑143 (MQ=255) aTAAAGCAGAGCATCTGGAAGAACGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCCAAt > 1:532507/1‑143 (MQ=255) aTAAAGCAGAGCATCTGGAAGAACGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAAt > 2:734868/1‑143 (MQ=255) aTAAAGCAGAGCATCTGGAAGAACGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAAt > 1:527270/1‑143 (MQ=255) tAAAGCAGAGCATCTGGAAGAACGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATg > 1:302124/1‑143 (MQ=255) cAGAGCATCTGGAAGAACGGCGATTGATGCTAGAGTGGTGGGCTGATTTTCAGGATGTAGACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAAGGCCCgg > 2:581975/1‑143 (MQ=255) cAGAGCATCTGGAAGAACGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCgg < 2:459168/143‑1 (MQ=255) agagCATCTGGAAGAACGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCggg > 1:618871/1‑143 (MQ=255) agCATCTGGAAGAACGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCATTTGCCCGGGat < 1:992391/143‑2 (MQ=255) gCACCTGGAAGAACGGCGAGTGCTGCTACAGTGGTGGGCCGAGTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCATTTGCCCGGGatg < 1:1095202/143‑3 (MQ=255) tCTGGAAGAGCGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGGTTTTCTGGATGTAAGCAGAGAAAGGTTTATCAGTCAATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCACGGGAAAATGCGCGGGAagtat > 2:1063632/1‑143 (MQ=255) ggAAGAACGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCCAATGCCCGGGCATTATTCt > 1:204793/1‑143 (MQ=255) caccGGCGATTTATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTAGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGa < 1:158702/140‑1 (MQ=255) cGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGatta > 2:475933/1‑143 (MQ=255) ggCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTCATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTATAGGattat > 2:956956/1‑143 (MQ=255) tGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCtt < 1:1014228/143‑1 (MQ=255) tGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCtt < 2:608385/143‑1 (MQ=255) tGAGGCTGCAGTGGTGGGACTATTTTCTGCAGAGAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTCAACATGCCAAGATTAATAATCTATTAAATCCGTAATCATCCCGGGCATTTGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCtt < 2:539057/143‑1 (MQ=255) catggcaCAGTTGTGGCCCTATTTTCTTGATGTAAACAGATAAAGGTTTATCAGTCCATATGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCTCGGGCAAATGTCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCttt < 2:544430/137‑1 (MQ=255) tGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGt > 2:50549/1‑143 (MQ=255) gCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATACGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGtt < 1:254804/143‑1 (MQ=255) cTACAGTGGTGGGCGGAGTTGCTGGATGTAAACAGAGAAAGGGTGATCAGTCGATGTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTa < 1:308340/143‑1 (MQ=255) cTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTa > 1:693802/1‑143 (MQ=255) tACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGATTCCGAGCACAGTTGAATATGCACAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCACGGACAACTGACAGGGAATTATACTAGGATGACTTTCTTTgctta > 2:237966/1‑139 (MQ=255) aCAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTGAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTaaa < 2:1023271/143‑1 (MQ=255) aCAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAGAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCAGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTGTGTTaaa > 1:918394/1‑143 (MQ=255) aGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTgaaaa > 1:30860/1‑143 (MQ=255) gtggtgGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTaaaaaa > 1:1079208/1‑143 (MQ=255) tggtggGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAg > 2:188723/1‑143 (MQ=255) ggCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACaaa > 1:369404/1‑143 (MQ=255) cccGAATTTCTGGAAGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAAc < 1:854147/142‑1 (MQ=255) ccGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACg < 1:86441/143‑1 (MQ=255) cGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACgg < 2:203152/143‑1 (MQ=255) tttCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATGTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTAtt < 2:916851/143‑1 (MQ=255) tCTGGATGTAAACAGAGCAAAGTTTGTCGGTCCATCTTAATAGCCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTaa < 1:150411/143‑1 (MQ=255) aTGTAAACAGATAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGAt < 2:881920/143‑1 (MQ=255) gTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTAATCTAGGATTATTTTCTTTGTAAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGt > 2:217294/1‑143 (MQ=255) aaCAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTATGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGtatt < 1:1057236/143‑1 (MQ=255) gagaAAGGGTGATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAGTAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGtatttact < 1:38365/143‑1 (MQ=255) agaAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAACGACAAACGGTATTAACGGATGtatttacta > 1:1011395/1‑143 (MQ=255) gaAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGtatttactat > 1:219769/1‑143 (MQ=255) aaaGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGtatttactatt > 1:196945/1‑143 (MQ=255) ggTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGtatttactatttac > 1:1050705/1‑143 (MQ=255) ggTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGtatttactatttac > 2:900810/1‑143 (MQ=255) tttATGAGTCCATTTGAAGATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCg < 1:216356/143‑1 (MQ=255) tCAGTCCATTTGAATTTGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTcc < 1:1044503/143‑1 (MQ=255) tCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACAGATCCCTGc > 2:743152/1‑143 (MQ=255) cagttGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAg < 1:927113/140‑1 (MQ=255) cagtggAAGATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCGCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTCTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAg < 1:829454/138‑1 (MQ=255) cATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTACCTGCAg > 1:1105554/1‑143 (MQ=255) ttGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAgggg < 2:1060138/143‑1 (MQ=255) ttattttGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAggggg < 2:947366/137‑1 (MQ=255) tGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAggggg < 1:615862/143‑1 (MQ=255) gAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAgggggg < 2:297333/143‑1 (MQ=255) atatGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTAGTATTTACCGCTCCCTGCATGGGGGAt > 1:243002/1‑143 (MQ=255) gCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCTGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATc < 2:959935/143‑1 (MQ=255) gCAAAGATTAATAATCAATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGCGGGGATTATc > 2:1042454/1‑143 (MQ=255) cAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCa < 1:642731/143‑1 (MQ=255) cAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGAGGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCa > 1:1029764/1‑143 (MQ=255) aaaGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGAGCAAATGCCCGGGAATTATCCTAGGATTATCTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGAAGGGGGGGTTATctg > 2:833206/1‑141 (MQ=255) aaGATTAATAATCCAATAAAACAGTAAGCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTACTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGa < 1:864214/143‑1 (MQ=255) ttAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATcc > 2:450140/1‑143 (MQ=255) agtagtCCAGTAAGACAGTAATCATCCCGGGGAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCcgc < 1:775757/138‑1 (MQ=255) ataatCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCcgcg > 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aaaCAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCatta > 2:888073/1‑143 (MQ=255) aGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCAttattta > 1:900604/1‑143 (MQ=255) aGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCAttattta < 2:302124/143‑1 (MQ=255) aGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCAttattta < 1:50549/143‑1 (MQ=255) taataaTCCCGGGCAAATGCCAGGGAATGATTTTAGGATTATTTTCTTTGTTACAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTAGCGCTTCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCTGCGGTTATTCATTATTtata < 2:53966/143‑1 (MQ=255) tAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCTCGGTTATTCCTTATTgata > 2:1104376/1‑143 (MQ=255) tcatcCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCATTATTTATATAc > 2:140976/1‑143 (MQ=255) ttcCCGGGCATTTGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGAGGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCATTATTTATATACAt > 1:228549/2‑143 (MQ=255) ttcCCGGGCATTTGCCCGGGAATTATTCTAGGATGATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCATTATTTATATACAt > 1:700734/2‑143 (MQ=255) tcCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATGCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTTACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATAAGAGTGGGCGGTGACTAACTATTTATATAAAtt > 1:723778/1‑143 (MQ=255) cGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCATTATTTATATACATTCaa < 1:188723/143‑1 (MQ=255) aaTGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTAACGCTCCCTGCAGGGGAGATTAACAGAATCCGCGGTTATTCATTATTTATATACATTCAATaaaaa < 2:445959/143‑1 (MQ=255) | CATAAAGCAGAGCATCTGGAAGAACGGCGATTGATGCTACAGTGGTGGGCCGATTTTCTGGATGTAAACAGAGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCATTATTTATATACATTCAATAAAAA > NC_000913/4497812‑4498095 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |