Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 475,972 | C→G | 7.0% | intergenic (+21/+10) | ybaY → / ← atl | PF09619 family lipoprotein YbaY/DNA base‑flipping protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 475,972 | 0 | C | G | 7.0% | 182.4 / 6.1 | 65 | intergenic (+21/+10) | ybaY/atl | PF09619 family lipoprotein YbaY/DNA base‑flipping protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/26); new base G (2/3); total (36/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.49e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.59e-01 |
GCCGGTACAGCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAAC > NC_000913/475831‑476113 | gCCGGTACAGCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTGCACCAACTCAGGTGAATCCGTCGTCGACAGTTACAACTCCTACGCAACAATCAGCCAGACTACCCCTCGCCGccc > 2:620355/1‑143 (MQ=255) gCCGGGACAGCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGACAGTGGCCGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGccc < 1:462030/143‑1 (MQ=255) ccGGTACAGCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCg > 1:655245/1‑143 (MQ=255) cGGTACAGCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCCGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCgg < 2:637892/143‑1 (MQ=255) tACAGCACTCCGCCCTCCCGGTCCAGGCCAGCGGGGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTGCGGCAGTTCCAGCTTCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGgaga < 1:77805/143‑1 (MQ=255) cAGCGAACCGCCGCGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACAACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCTGCAGTTCCAGCTCCTACGGAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAgg < 2:173942/143‑1 (MQ=255) aGCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAggg < 1:366532/143‑1 (MQ=255) aGCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAggg < 1:623800/143‑1 (MQ=255) gCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGCCGTTAACCCTCTCCGCCCGGCGAGGGt > 1:349351/1‑143 (MQ=255) cAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCGGGCGAATGCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCGCCCCGCCCGCAGAgggcg > 2:918565/1‑141 (MQ=255) cAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGAGGGtt < 1:615118/143‑1 (MQ=255) gCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAg < 2:923918/143‑1 (MQ=255) ggTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCCGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGa > 1:1048293/1‑143 (MQ=255) tCAGGGCCGCCGTGGCGCAACGACTACCGGACCTTCGACCTCGCCAACCCAGGTGAATCCGTCCTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATaa < 2:911929/143‑1 (MQ=255) gCCAGCGTTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGCTGAACAATGCACCATTATGGTCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCt < 1:512101/143‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCt > 1:939114/1‑143 (MQ=255) gCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACGCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTGAACCCTCTCCGCGCGGAGTGGGTTCGTAGTTCCATCGATAACGCt > 1:10585/1‑143 (MQ=255) ccAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTAGCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATGTTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTCCCAGCGAGAACGCTg > 2:1052869/1‑143 (MQ=255) cAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGc > 1:530264/1‑143 (MQ=255) gcgtgggCCCAACGACTACCGTACCTTAGACTGCTCCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCAGCAGTTCCAGCTCCTACGCAAGATTAAGCGACGGCAACCCTCGCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCaa < 2:486120/138‑1 (MQ=255) gcAGCGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAAGATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGAttt < 1:335684/143‑1 (MQ=255) cAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCGATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCGAGCGATAACGCTGCACGTCggcttg > 2:802309/1‑138 (MQ=255) aaCGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCACTATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGCTAACGCTGCAAGTCGATTTGc > 2:145653/1‑143 (MQ=255) cTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCt > 2:940138/1‑143 (MQ=255) tACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCtt > 2:489141/1‑143 (MQ=255) tACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAACCTTAACCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGCGGGTTAGTAGTTCCAGCGATCACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCtt > 1:1080729/1‑143 (MQ=255) cGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGAAGGTAACCCTCTCCGCCCGCAGAGGGTTAATAGGTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCGCGCGTccc > 2:99776/1‑143 (MQ=255) ttCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATAcc > 2:981893/1‑143 (MQ=255) ttCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGCTAGTAGCTCCAGCGCTGACGCTGCAAGGCGCTTTGCGCGCTTccacgtacc > 2:904939/1‑136 (MQ=255) cTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGCTTTGCCCGCTTCCCGCTACCATcac > 1:220414/1‑143 (MQ=255) cTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGGTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATcac < 1:923492/143‑1 (MQ=255) ttCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTc > 2:921394/1‑129 (MQ=255) ttCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTc < 1:921394/129‑1 (MQ=255) aCCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACCCCt > 1:670585/1‑143 (MQ=255) aCCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAACTCGATTTGCCCCCTTCCCCATACCATCCCACCt > 2:758158/1‑143 (MQ=255) cAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCCGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTc < 1:857774/143‑1 (MQ=255) atgtCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCt < 1:679995/140‑1 (MQ=255) atccagcTTCGCCAGTTCCAGCGCCTACGCAATATTAGGCCACGTTAACCCTCTCCGCCCTTATAGGTTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑c < 1:925586/137‑1 (MQ=255) ttCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGc < 2:1048293/143‑1 (MQ=255) cGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCGAGTACTG‑CCTGTCGCTg > 1:646631/1‑143 (MQ=255) ggCAGTTCCGGCGCCTACGCGGTATTTGGCGACGTTAAGCCCCGCCGCCGGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCGTGCGTCCCGTTCCCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGa < 2:1025416/143‑1 (MQ=255) gCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGAGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTCCTGCCAGCAATG‑CCTGTCGCTggc > 2:432417/1‑141 (MQ=255) cAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGCTAACGCTGCACGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCAGACCTTCTGCCAGTGACG‑CCCGgcgccgcca > 2:594114/1‑138 (MQ=255) gTTCCAGCTCCTACGCAAGATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCt < 2:605200/143‑1 (MQ=255) ccAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTa > 1:680919/1‑143 (MQ=255) tACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACGCCTTCTGCCAGGAAGG‑CCTGTCGCTGACGCAGTAAAcacggt > 1:622984/1‑143 (MQ=255) cGCAATATTAAGCGACGGTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAGCGCGGCAAGTCGAGTTGCCCGCTTCCCGATACCATCGCGCCCTCT‑CAAGATATGTTGTGTCGGTGACGCTGTAAAtacggtgc > 1:298394/1‑141 (MQ=255) cAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAAtccggtccgg > 1:699082/1‑143 (MQ=255) aaTATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTACCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATccggtccggt < 1:940138/143‑1 (MQ=255) ttAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGc > 1:783999/1‑143 (MQ=255) gCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTCAGCGaaa > 2:993301/1‑143 (MQ=255) gCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGCAAATCCGGCCCGGTTAGccaca > 2:68713/1‑139 (MQ=255) gCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCAAGTAATG‑CCTGTCCCTGACGCTGTAAATCCGGTCCAGATAggcaac > 2:68734/1‑138 (MQ=255) gACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAAtt < 2:655245/143‑1 (MQ=255) gACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGGTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAAtt < 1:497350/143‑1 (MQ=255) aCGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGCAAGtg > 1:823159/1‑143 (MQ=255) cGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATtgt < 1:277588/143‑1 (MQ=255) aCCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTCCCAGCGCTCCCGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGt < 1:38088/143‑1 (MQ=255) ccTCTCCGGGCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTgg > 1:680715/1‑143 (MQ=255) ctctCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATCACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTCCCGTGGc < 2:460556/143‑1 (MQ=255) ctctCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGc < 1:489141/143‑1 (MQ=255) ctctCCGCCCCGTGTTGGTTACTAGTTCCAGCTATTACGCTTCAGGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATCCCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGc < 2:558393/143‑1 (MQ=255) tctcCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTCCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATACGGTCCGGTTAGCGAAATTGCGCCGTGGCg > 1:477845/1‑143 (MQ=255) gccGCCCGGAGAGGGTTAGCAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTATTG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGAt < 1:66985/142‑1 (MQ=255) cGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTACATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGAATa > 2:91719/1‑143 (MQ=255) cGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAACG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTCTGCCGTGCCGATTa > 2:630386/1‑143 (MQ=255) gCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTaa < 1:850335/143‑1 (MQ=255) cccGGAGAGGGCTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATAGCATCACCCCTTCTGCCCGTAATG‑CCTGTCGCGGCCGCTGTAACGCCGGTCCGGTTAGCGCAACTGTGCCGTGGCGATGAac > 2:67508/1‑143 (MQ=255) | GCCGGTACAGCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATG‑CCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAAC > NC_000913/475831‑476113 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |