| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,764,427 | G→A | 100% | intergenic (‑41/+286) | sufA ← / ← rydB | iron‑sulfur cluster insertion protein SufA/small regulatory RNA RydB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,764,427 | 0 | G | A | 100.0% | 211.4 / ‑6.7 | 68 | intergenic (‑41/+286) | sufA/rydB | iron‑sulfur cluster insertion protein SufA/small regulatory RNA RydB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (33/33); minor base C (1/1); total (34/34) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATGTTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCTAAGAATTAGGTATCTCATTGTTA > NC_000913/1764288‑1764565 | tGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTa < 2:248566/143‑1 (MQ=255) gCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAg > 2:851707/1‑143 (MQ=255) ccaccaGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATCTTAGt > 1:393286/1‑143 (MQ=255) ccaccaGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGt < 2:317208/143‑1 (MQ=255) caccaGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTGAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCCTATTAGTg > 2:264545/1‑143 (MQ=255) caGCTCACGGATGGGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCGTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATa < 2:50343/143‑1 (MQ=255) cGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTa < 1:491914/143‑1 (MQ=255) gATGTGTATCGCCGCTGCGGGGGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTAta > 1:676889/1‑142 (MQ=255) gtgtATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTATGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGt < 2:1090160/143‑1 (MQ=255) tgtATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACCGCATATTAGTGATAATGACTATCAgat > 2:115684/1‑141 (MQ=255) tgtATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGtt < 1:982072/143‑1 (MQ=255) tCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAAc > 2:584679/1‑143 (MQ=255) tgtCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAg > 1:877889/1‑143 (MQ=255) tgtCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAg > 1:703044/1‑143 (MQ=255) tgtCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAg < 1:107746/143‑1 (MQ=255) tCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGCGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAggg > 1:916318/1‑143 (MQ=255) cAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAgggg < 2:138436/143‑1 (MQ=255) aGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGCTTTACCTCACTTCATCGCTCTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCCGACGCGGGGGc > 1:479695/1‑143 (MQ=255) aGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTCTCCGTTGAACCCAGCAAACGCAGGGGc > 2:174942/1‑143 (MQ=255) cGTTAAGCCTTG‑CAGGCGAAATCTTGTCGGTGAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCttt < 2:245033/143‑1 (MQ=255) aaGCCCTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTAcc < 1:614187/143‑1 (MQ=255) ttGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGCTAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTaaa > 1:310117/1‑143 (MQ=255) ttGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTcaa > 1:25200/1‑143 (MQ=255) cAGGCGAACGCTGGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGCTTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACAt < 1:862051/143‑1 (MQ=255) cGACATCTTGTAGATTAGAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCtt < 1:147219/143‑1 (MQ=255) cGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCtt > 1:908370/1‑143 (MQ=255) ttGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAACACATGCTTTTTGCCt > 1:866169/1‑143 (MQ=255) ttGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCt < 1:595251/143‑1 (MQ=255) gggTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATTGCGTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCtt < 2:829797/143‑1 (MQ=255) gggTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGTGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCtt > 1:879208/1‑143 (MQ=255) ggTTAAAGGTCCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCttt < 1:311184/143‑1 (MQ=255) ttAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTta > 1:838519/1‑143 (MQ=255) aaaGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTtaat < 1:337663/143‑1 (MQ=255) ggTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAg < 1:927733/143‑1 (MQ=255) gccgccTGGATGCATGTCCATCGATTTCCCTCACTTCAGCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTAGCAGTTCAACCCAGCAACCGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAg < 2:161937/139‑1 (MQ=255) tCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCAt < 2:747857/143‑1 (MQ=255) gAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGAc > 1:574849/1‑143 (MQ=255) tGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCCGCGTATAACAGCATATTAGTGAGAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCt < 1:413566/143‑1 (MQ=255) tGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCt < 1:584679/143‑1 (MQ=255) gCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCCTTACTGTTTTACTTGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTg > 2:230458/1‑143 (MQ=255) aTGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTGTTAATAAGCATAGACCCTGAt > 1:958776/1‑143 (MQ=255) gTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCATTACCGTAAAACATGCTTTTCGCCTGCTTTTAATACGCATAGCCCCTGAtgt > 2:438810/1‑143 (MQ=255) tCCATCGCTTTACCTCACTTCATCGCCTACCGCCAACGGCAGCATATTAGTGCTAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGAtgtg < 2:1069905/143‑1 (MQ=255) tCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGAtgtg > 1:673558/1‑143 (MQ=255) ccATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGAtgtgt < 1:965030/143‑1 (MQ=255) ccATCGATTTACCTCACTTCATCGCTGTCGGCGGATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGAtgtgt < 1:264545/143‑1 (MQ=255) aTCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACTCAGCAAACGCGGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTGTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTgg < 2:141643/143‑1 (MQ=255) aTCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGCTGTGTgg > 1:976756/1‑143 (MQ=255) aTCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTgg > 1:760344/1‑143 (MQ=255) tCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTggg < 1:491271/143‑1 (MQ=255) ccTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACACAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTGTTGCCTGCTTGTAACAAGCATAGACACTGCTGTGCGGGTTGACAgg > 2:416912/1‑143 (MQ=255) cgcACTTGGTCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATGATGATTATCAGTTCAACCCAGCGAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTGTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGc < 2:515541/141‑1 (MQ=255) tCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCTGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTAGGCTGCCGTTAATAAGCGTAGCCCCTGATGTGTGGGTTAACAGGcc > 2:658218/1‑142 (MQ=255) tCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGcg > 1:670322/1‑142 (MQ=255) tCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCa > 1:37451/1‑143 (MQ=255) ttCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCt > 1:900022/1‑143 (MQ=255) cATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCTaa > 1:23638/1‑143 (MQ=255) cATCGCGTTCAGCGTAGAACAGCATCTTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCTaa < 2:1002221/143‑1 (MQ=255) aTCGCTTTCAGCGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCTAAg < 1:1009582/143‑1 (MQ=255) tttCAGCGTATAACAGCATAGTAGTGATAATGATTAGCAGATCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCTAAGAATTa < 1:18854/143‑1 (MQ=255) tgtCAGCGTAGAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCTAAGAATTa < 2:503514/141‑1 (MQ=255) cGTATAACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCTAAGAATTAGGTAtc > 1:563544/1‑143 (MQ=255) tataACAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGCGTTAACAGGCCCGCTACGACTTAGGTAcctc > 1:1004149/1‑143 (MQ=255) aaCAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCTAAGAATTAGGTATCTCAtt < 1:680570/143‑1 (MQ=255) aCAGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCTAAGAATTAGGTATCTCATTg > 2:157704/1‑143 (MQ=255) aGCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGTGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGACGTGTGGGTTAACAGGCACGCTAGGAATTAGGTAGCTCATTGtt > 2:998418/1‑143 (MQ=255) gCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCTAAGAATTAGGTATCTCATTGTTa < 1:99893/143‑1 (MQ=255) gCATATTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCTAAGAATTAGGTATCTCATTGTTa < 1:569709/143‑1 (MQ=255) | TGCCACCAGCTCACGGATGTGTATCGCCGCTGCGGGTGTCAGCGTTAAGCCTTGCCAGGCGAAATCTTGTGGGTTAAAGGTTCCTGAATGCATGTCCATCGATTTACCTCACTTCATCGCTTTCAGCGTATAACAGCATGTTAGTGATAATGATTATCAGTTCAACCCAGCAAACGCAGGGGCTTTACCGTAAAACATGCTTTTTGCCTGCTTTTAATAAGCATAGACCCTGATGTGTGGGTTAACAGGCACGCTAAGAATTAGGTATCTCATTGTTA > NC_000913/1764288‑1764565 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |