| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,716,033 | C→A | 9.0% | intergenic (+23/+33) | eamB → / ← grcA | cysteine/O‑acetylserine exporter EamB/stress‑induced alternate pyruvate formate‑lyase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,716,033 | 0 | C | A | 9.0% | 156.8 / 6.9 | 66 | intergenic (+23/+33) | eamB/grcA | cysteine/O‑acetylserine exporter EamB/stress‑induced alternate pyruvate formate‑lyase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/29); new base A (4/2); total (35/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.52e-01 | |||||||||||
ATGTGTGCTGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATAT > NC_000913/2715892‑2716174 | aTGTGTGCGGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGcc < 1:1009052/143‑1 (MQ=255) gggggCTGGGCGCGGGAGGGGCGTGTGTTTAGGCGATTGTGTGGGGAGGATGGTCGACAGTTAAATATCGAGCGTGCCGTGTTGATGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAAAGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCct < 2:493513/139‑1 (MQ=255) cTGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTcc > 1:621996/1‑143 (MQ=255) cTGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGGCGACCTCTTcc < 1:422910/143‑1 (MQ=255) gggCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGCTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGc > 1:465017/1‑143 (MQ=255) gggCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTACTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTCTTAACGCAAAGAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGc > 2:898633/1‑143 (MQ=255) ggCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCt > 1:590759/1‑143 (MQ=255) ggCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCt < 1:289603/143‑1 (MQ=255) gCGGGGCATCTGTTTGAGCGAGTGTTTCGCCAGTATGCTCGCCAGTTAACTGTCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAAc < 1:148041/143‑1 (MQ=255) cGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACt < 1:1068644/143‑1 (MQ=255) gggCATCTGTTTCCGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTg < 2:699667/143‑1 (MQ=255) ggCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTGAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCGCTTCCGCTTAGTAACTTGc > 1:309123/1‑143 (MQ=255) gCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCt < 2:836832/143‑1 (MQ=255) tCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGCGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACt > 1:834929/1‑143 (MQ=255) cTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACtt < 1:965785/143‑1 (MQ=255) tGTTTCAGCGATTGTTACGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAAGATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGAGCGGTAAGCATTTTCTATTAACGAACAAAAGCGGCAGAGGTCGCCCTCTTCCACTTATTAACTCACTACTTa > 2:973052/1‑143 (MQ=255) tttCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGCAAAAAAGCGGAAGAGGGCGCCCTCTTCCGCTTAGAAACTTGCTACTTaat > 1:846248/1‑142 (MQ=255) tttCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAg > 2:798307/1‑143 (MQ=255) tCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGcc > 1:242553/1‑143 (MQ=255) cAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTACCTTGCTACTTAAGCCt > 2:616759/1‑143 (MQ=255) aTTGCTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAg < 1:612744/143‑1 (MQ=255) tttCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCtt < 2:995190/143‑1 (MQ=255) ttCGCCAGTATTGTCGCCATTTGAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCttt < 2:217452/143‑1 (MQ=255) tCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTc > 1:221493/1‑143 (MQ=255) tCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTc > 1:397820/1‑143 (MQ=255) cccAGTATGGGCTCCAGTTAAATGTCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTATCGATAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAg < 2:1106337/142‑1 (MQ=255) ccAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGcc < 1:235766/97‑1 (MQ=255) ccAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGcc > 2:235766/1‑97 (MQ=255) ccAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAGAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTAGTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGGAAAGGTACGAgg > 2:556235/1‑142 (MQ=255) ttAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGCTa > 1:908442/1‑143 (MQ=255) tgattGCCCTGTGGTTGGTCTGTGGCGTGGGACGCGTTTTCTATTAACGAAAAAGAGCGGAAGAGGTCGCCCTCGTCCGCTGAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCgct < 2:1103211/140‑1 (MQ=255) gCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCgctg < 2:242553/143‑1 (MQ=255) tGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGAATGCTGTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGctgctg > 1:991150/1‑143 (MQ=255) ccTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTGGCTGCTTAAGCCTTACCGGCTTTCAGTAAAGGTACGCGCGATAACGTCGCGCGGCTGTTc > 1:302786/1‑143 (MQ=255) cTGTTGCTGGTCGATTGCGCGGGACGCAGGTTGGGCGGACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTcc < 1:38517/143‑1 (MQ=255) ttGCTGGTCTATTGCGCGGTACGTATTTTCTATTAACGTAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTGCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGa < 2:140529/143‑1 (MQ=255) ttGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTGCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTGTCCGTAAAGGTACGAGCGGTAACGTGGCGCTGCTGTTCCGGa > 1:124329/1‑143 (MQ=255) ttGCTCGTCTTTTGTGCGGTACTCATTTTCTATTGACGTAAAAAAGCGGAGTAGGTGTCCCTCTTTCGTTTAGTATCTTGCTTCTTAAGCCTTACTGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGa < 2:915620/143‑1 (MQ=255) gCTGGTCTGTTGCGCGTTACGCATCTTCTATTCACGAAAAAAGGCGGAAGAGGTCTCCCTCTTCCGCCGAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTCCAGGGTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGt < 2:8931/143‑1 (MQ=255) gCTGGTCTGTTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGCAAAAAAGCGGAAGCGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTCACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGt < 2:857734/143‑1 (MQ=255) cTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATCAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTc > 1:401817/1‑143 (MQ=255) tGGTCTGGTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAGCGAAGAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCa < 2:236752/143‑1 (MQ=255) ctgtggcgcGGTACGCATGTGCTATGACCGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCagaga < 1:613839/138‑1 (MQ=255) cgaTTGCGGGGTACGCATTTTCTATTCACGCAACAAAGCGGAAGCGGTCACCCTCTTCCGCTTAGTACCTCGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCCGTAATGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCagaga < 1:789696/141‑1 (MQ=255) cTATTGCGCGGTACGCATTTTCCATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCagaga < 1:27317/143‑1 (MQ=255) cgcgcTGTGCGCAGTTTGTATTAAGGATAAAAAGCGGAAGAGGTCGAACTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTGAAGCCTTACAGGCTTGCAGGAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTa < 2:179091/142‑1 (MQ=255) cgcgGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTaaa < 1:932985/143‑1 (MQ=255) gcgGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGGCAGAGAGTTACAg > 2:803749/1‑143 (MQ=255) cgGTACGCATTTTCTATGAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGc < 1:936023/143‑1 (MQ=255) tACGCATTTTCTATTATCGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGaa < 1:91284/143‑1 (MQ=255) tACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGaa < 2:621996/143‑1 (MQ=255) ttttCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGGTAAAGCGAACTGCAt > 2:13106/1‑143 (MQ=255) ttCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATaa > 2:811069/1‑143 (MQ=255) aCGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATac > 1:328833/1‑143 (MQ=255) aaaaaaaGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATAcgcg > 1:56687/1‑143 (MQ=255) aaaaGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTGCGGAGTCAGAGAGTTAAAGGGAACTGCATAACCGGGTACACGGAt > 2:939919/1‑143 (MQ=255) aaGCGGAAGAGGGCGACCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGGACTGCATAACCGGATACACGGATgg > 1:459849/1‑143 (MQ=255) cGGAAGAGGGCGACCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGACCTGCATAACCGGATACAGGGATGGACa > 2:263663/1‑143 (MQ=255) cGGAAGAGGGCGACCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCa > 1:504161/1‑143 (MQ=255) cGGAAGAGGGCGACCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGCCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCCGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGCTACACGGATGGTcc > 2:760554/1‑142 (MQ=255) ggAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCCTAACCGGCTACACGGATGGTCAg > 2:218283/1‑143 (MQ=255) gAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCATACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGACCGACATAACCGGATACACCGCTGGTCAGc > 2:339567/1‑143 (MQ=255) gagGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCAGCTGc > 1:447485/1‑143 (MQ=255) ggTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCAGCTGCgg > 1:143404/1‑143 (MQ=255) tCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATAGACGGATGGTCAGCTGCGGat > 1:661811/1‑143 (MQ=255) cGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCAGCTGCGGata > 2:685428/1‑143 (MQ=255) cGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCAGCTGCGGata < 1:798307/143‑1 (MQ=255) gCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCAGCTGCGGatat < 1:616759/143‑1 (MQ=255) gCCCGCTTCCGCTTAGTAACGTGCGCCTTAAGCCTTACAGGCTTGCAGTAGAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGCACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCAGCTGCGGatat < 2:44983/143‑1 (MQ=37) | ATGTGTGCTGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATAT > NC_000913/2715892‑2716174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |