| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 315852 | NA (NA) | 52 (1.300) | 13/256 | NT | NA | noncoding (624/1255 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 315875 | NA (NA) | noncoding (647/1255 nt) | IS3 | repeat region | |||||
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
ACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/315707‑315852‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTC < NC_000913/315875‑315734 ACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTCCGGT‑GCCACCCGGCACA‑ACATGTATCTGCGTGCTCAGGCTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAG > 1:810280/1‑143ACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGGCGGATG‑AACTCCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAGCGTAAAAACCGTGGCGGCAAG > 1:773298/1‑143ACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAG < 1:49619/143‑1ACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAG < 1:432692/143‑1ACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAG > 1:558456/1‑143ACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACAGATG‑CACTGCGGGCACAGGGCTACCCCGTTAACGTGAGAACAGAGGCGGGAAG > 2:648152/1‑143ACGCGTCAGCAGTGCCGCCAACACGGCGGCGGCGTTGTCCTCGCGTCTTTTACCCTGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAG < 2:322139/143‑1 cgtGTCAGCAGTTCCCCCAACACTGCGCCAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGC < 2:333361/140‑1 ccgggCAGCAGTGCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGGTACGGT‑GCCCCGCGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAACACAGTGGCTGCAAGC < 2:761094/138‑1 CGCGTCGGCAGTTCCGCCAACCCTCCGACAGCGGTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGC < 2:280099/143‑1 CGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTATAAACCGTGGCGGCAAGC > 1:216474/1‑143 CGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGC > 1:680214/1‑143 CGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGC < 2:719524/143‑1 CGCGTCAGCAGTTACGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAAGCGTCGCGGCAAGC > 1:356743/1‑143 CGCGTCACCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGC < 2:16520/143‑1 gcgttgGCAGTGCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTCTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGCCGGATG‑AACTGCGTGCCCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCC < 2:666554/137‑1 GCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCC > 1:662022/1‑143 GCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGCTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTGACGTGAAAACCGTGGCCGCACGCC > 2:198600/1‑143 CGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACCGGGTTGGCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCT < 1:768753/143‑1 CGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTCCCCCCACGCCGGTTCG‑GG‑AACGGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCT < 2:362141/143‑1 CGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCT > 1:402852/1‑143 CGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCT < 2:728343/143‑1 CGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCT < 1:458038/143‑1 CGTCAGCAGTCCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGCCCCCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GAACCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCT < 2:395089/143‑1 CGTCAGCAGCTCCGCCAACACTGCGACAGCGCTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGCCGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCT < 1:13840/143‑1 CGTCAGCACTTCCGCCAACGCTGCGACCGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGATCAAACCAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCT < 2:131142/143‑1 GTCAGCAGTTCCGCCAACCCTACGACAGCGTTGTCCTAGCGGCTTTTACCCGCGCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCCCAGGGATACCCCCTTCACGTAACAACCCTGGCGGCCAGCCcg > 2:25402/1‑141 AGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTAGGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCACTTTAAAGTAAAAACCGTGGCGGAAAGCatgggg > 1:115259/1‑137 GCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAACACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGCTG‑AACTGAGTCCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCACGCCTTCGCC > 1:362361/1‑143 CAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTTGAGGTTTTTACGCGCTCAAAACCGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGGTACCCCTTTAACGTAAACACCGTGGCGGCAATCCcgccccg > 2:798249/1‑136 CAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCGCAGGGTTACCCCTTTAACGCACAAACCCTGGCGGCAAGCCacacccg > 2:337055/1‑136 AACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTG < 1:283358/143‑1 cgaggGCGTGGTGCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGC < 2:159647/138‑1 CGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTGCGCCCTCAGTCCCTGACGGCGC < 2:678845/143‑1 CGACAGCGCTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTCCCGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGC < 1:749511/143‑1 gcCAGCGCTGTCCTGGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTGCGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCA < 2:498611/141‑1 GACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTCCCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTGCGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCA < 1:384863/143‑1 GACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAATACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGTTG‑ATCTGCGTGCTCAGTGTGACCCCTGTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTGTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCA < 1:99859/143‑1 GACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCA < 2:765603/143‑1 GACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCA < 1:817120/143‑1 gCAGCGTTGTGCTCGCGGCTTCTACCCGGTCAACACAGCGCTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAG < 2:21122/142‑1 cCAGCCTTGCCTTCGCCGCTTTTACCCGGTCAACACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGCCGGATG‑AACTCCGTGCTCACGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAG < 2:82269/142‑1 atcGCGTTGTCCTCGCGGCTTTGACCGGGTCCATACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCACGGTTACCCCTTTAACGTAAAACCCGTGGCGGCAAGCCTGCGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAG < 2:473003/140‑1 agAGCGTGGTCCTCGCGGCTTTGACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAGCCGTGGCGGCAAGCCTGCGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAG < 1:236430/141‑1 ACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAACCAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTGCGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAG < 1:197881/143‑1 ACAGCGTTGGCCTCGCGGCTTTTACCCGGGCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTGCGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAG < 2:128871/143‑1 CAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGG < 1:462350/143‑1 CAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCGTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGG < 1:172942/143‑1 CGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAACCCGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTT < 2:26677/143‑1 CGTTGTCCGCGCGGCTGTTACCCGGGCAAAACGGCGTGACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTT < 2:814235/143‑1 TTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAGGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGC < 1:373807/143‑1 GGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTT < 1:436000/143‑1 GGCTTTGACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTT < 1:523580/143‑1 gagtCCTTTGCCCTCAGTCCCTGAGGGCGCAGGCTGGCCGGCACGGTGTTGACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAAC < 1:69017/139‑1 gtGCCTTGGCCCTTAGTCCCTGGCGGCGCAGGCTGGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGCACCCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGCAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACG < 2:520992/141‑1 GCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTATCCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCT < 1:410283/143‑1 GCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGGACGCAGTTCACCCGTCAGGCGTGCGCCACCGTCACGCTGTTTCGACCGCGTAAAAGCCGCGAGGACAACccg > 2:203035/1‑140 GCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGGCCGGGAAAAAGCCGCGAGGACAACGCT > 1:14375/1‑143 GCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGGGGACAACGCT > 2:242510/1‑143 GCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCT < 2:706406/143‑1 GCCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCCCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTCACCCGGTCAAAGCCGCCAGGGCAACGCT > 2:107912/1‑143 CCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCTCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGGAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACACTG < 2:713110/143‑1 CCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTACAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTATTGACCGGCTAGCAGCCGCCACGACAACGCTG > 2:45970/1‑143 CCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCCGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGCACAACcgtg > 2:292994/1‑139 CCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTG < 1:759833/143‑1 CCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTG > 1:8540/1‑143 CCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTG < 1:13011/143‑1 CCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTG < 1:651929/143‑1 CCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGACGCGAGGACAACGCTG > 1:471224/1‑143 CCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGCCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGCCCGGACCACACCCCCGACGACAACGCTc > 1:724124/1‑142 CCTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGCTTTTACGTTAAACGGGTAACCCTGAGCACGCCGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTCTTTTGACCGGGTAAAAGCCCCCAGGCCAACGCcg > 2:693413/1‑141 CTTTGCCCTCGGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTACCCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGT > 2:544127/1‑143 CTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGTGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGT < 1:423840/143‑1 CTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGTGCTCCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGT > 1:261236/1‑143 CTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAGCGCTGTGGTGAGCGGGGAAAAGCCGCGCGGAGGACGCTGg > 1:545967/1‑142 CTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGAGAACGCTGT > 2:479191/1‑143 CTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACGACGCTGT > 1:585442/1‑143 CTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGT > 1:42254/1‑143 CTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGT < 1:694739/143‑1 CTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGT > 1:177897/1‑143 CTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGT > 1:616842/1‑143 CTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCAGCGAGGACAACACTGT > 2:603502/1‑143 CTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGCGTAAAAGCCGCGACGACAACGCTGT > 2:731187/1‑143 CTTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTGGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGttat > 2:38421/1‑139 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTCACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTC < 1:304524/143‑1 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTTTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTC < 1:527333/143‑1 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAGAAGCCGCGAGGCCAACGCTGTC > 2:775632/1‑143 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAGAAGCCGCGAGGACAACGCTGTC > 1:329761/1‑143 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGTACGAGGCTGTC > 1:102334/1‑143 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTC < 1:568210/143‑1 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCGGTC > 1:634549/1‑143 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGCACAACACTGTC > 2:407703/1‑143 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACACGGTTTTAACCGGGTACCAGCCAACAGGACCACGCTGTC > 2:745481/1‑143 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGCGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGCACAAGCCGCGAGGACACCGCTGTC > 2:788026/1‑143 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGGAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGGGGGCAACGCTGTC > 1:604052/1‑143 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTGTGTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTC < 1:162983/143‑1 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCGTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTC < 1:511529/143‑1 TTTGCCCTCAGTCCCTGACGACGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCGGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACGACGCTGTC > 2:560990/1‑143 TTTGCCCTCAGCCCCTGCCGCCGCCGGCTTGCCCCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACTCCGTTCAGCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTC < 2:296408/143‑1 TTTGCCCTCAGCCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACCTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGACAGGCATGGGGCAACGTAACGCTGGTTTGACCAGGTAAAAGCAGCAAGGACGACGCTcca > 2:306671/1‑140 ACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGT‑GCCCCACGCCTGACGGATG‑AACTGCGTGCTCAGGGTTACCCCTTTAACGTAAAAACCGTGGCGGCAAGCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/315707‑315852‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctTTGCCCTCAGTCCCTGACGGCGCAGGCTTGCCGCCACGGTTTTTACGTTAAAGGGGTAACCCTGAGCACGCAGTTCATCCGTCAGGCGTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTC < NC_000913/315875‑315734 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |