| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 315642 = | NA (NA) | 19 (0.480) | 12/270 | 2.2 | NA | noncoding (414/1255 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 315671 = | NA (NA) | noncoding (443/1255 nt) | IS3 | repeat region | |||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
GTGGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/315788‑315642‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcggcTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCTC > NC_000913/315671‑315812 GTGGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAGAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑G < 2:437615/143‑1GTGGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑G > 2:163236/1‑143GTGGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑G > 1:259245/1‑143GTGGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACAGGGTACAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑G > 2:669072/1‑143 gGGGGCACCGGAAC‑GCTGTCGTGACCGGGGAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GC < 1:64390/142‑1 cGGGGCACCGTAAC‑CCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTCGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GC < 1:384055/142‑1 TGGGGGACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GC < 1:328357/143‑1 TGGGGCGGCGTAAG‑GCTGTTTTGACCGGGTAGAAGCTGCGAGGAGAACGCTGTCGTAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCAGCTGACACCTCGGATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GC < 2:129233/143‑1 TGGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGCCGCGCGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GC > 1:749799/1‑143 TGGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GC < 1:210600/143‑1 TGGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GC > 1:192919/1‑143 TGGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GC > 1:427337/1‑143 TGGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATAACAACCGCTGCGAGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GC > 1:266897/1‑143 GGGGCGCCGGAAC‑GCCGGTTTGACGGGGTAAAAGCCGCGCGGACAACGCTGTCGCAGTGTCGTCGGAACCGTTGACGCCTGGTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCG < 1:107960/143‑1 GGGGCAGCGTATCGGCTG‑TTTGGCCGGGTAAAAGGCGCGAGGACGACGCGGTCGCAGGGTTGGCGGAACTGCCGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCG < 2:295966/143‑1 GGGGCACGGTAGC‑GCTGTTTTGACGGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACGCCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCG < 2:61810/143‑1 GGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCG < 1:40906/143‑1 GGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCG < 1:688716/143‑1 GGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCG > 1:496754/1‑143 GGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCG > 2:766268/1‑143 GGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCAGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGCCACCACGTATACCAGCCGCTGCGCGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCG > 2:665793/1‑143 GGGGCACCGTAAC‑GCTGTGTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCG < 1:284027/143‑1 ggcCACCGTAAC‑GCTGTTTTGGCCGGGGACAGGCCGCGAGGACAACGCTGGCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG < 2:479703/140‑1 gctCACCGTACC‑GCTGGTGTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGTACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG < 1:270977/140‑1 GGGCCCCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG < 2:197072/143‑1 GGGCCCCGCAAC‑GCTGTTTTGATCGGGTAAACGCTGCGAGGACAACGCTGTCCCTGTGCGGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG < 2:87784/143‑1 GGGCAGCGGAAC‑GCTGTGTTGACCGGGTACAGTCCGCGCGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTGCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG < 2:498709/143‑1 GGGCACCGTAAC‑TCTGGTGCGACCGGGTACACGCCGCGAGGACAACGCTGCCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTACCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG < 1:624571/143‑1 GGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCTGCTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG < 2:328779/143‑1 GGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCGGATGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGTGCACCGGGAGCAC‑‑‑GCGG > 2:568467/1‑143 GGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG > 1:467270/1‑143 GGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG < 1:734313/143‑1 GGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCAAGCCGGCGCAC‑‑‑GCGG > 2:181547/1‑143 GGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCAGATGAAAGGACGTCCCCCCCCCCCCGCGGGCCACTCGGAGCAC‑‑‑GCGG > 1:680308/1‑143 GGGCACCGTAAC‑GCGGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGGGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG < 2:583738/143‑1 GGGCACCGCAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGACCGGCTAGCGCGCGCCTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG < 1:70803/143‑1 ggcgtCGTAAT‑GCTGGTTTTACGGGTTGAAAGCAAGCAAGACATCGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGt < 2:740015/138‑2 GGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGCCAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGC > 1:609966/1‑143 GGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCGCCCGGAGCAC‑‑‑GCGGC > 1:619303/1‑143 GGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCAGCCGGAGCAC‑‑‑GCGGC > 1:202667/1‑143 GGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGCGCCC‑‑‑GCGGC > 1:496116/1‑143 GGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGC > 1:481843/1‑143 GGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGGATACCAGCCGCCGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGC > 2:710372/1‑143 GGCACAGTAAC‑GCTGTGTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGC < 1:60448/143‑1 GCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCCGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGTGCCACCCGGGGCAC‑‑‑GCGGCg > 2:207079/1‑142 GCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGCg > 1:356560/1‑142 ACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCAGGAGCAC‑‑‑GCGGaaca > 1:9547/1‑139 GTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACCCCACGTCTACCCGCCGCTGCGGGCCCCCCGGAGCCC‑‑‑GCGGCcccttg > 1:162130/1‑137 CGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCG > 2:761514/1‑119 CGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCG < 1:761514/119‑1 TTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG > 2:662699/1‑56 TTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG > 2:273186/1‑56 TTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGG < 1:662699/56‑1 GCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCACGCGGCGGCTGGTATACGTGCTGTCAGCGGCGGACCAGGATAAGCACGAGTCAGCAGTTCCCACAACACCACGACAGCGTTGTCCCCGCGGCATTTAC > 2:371809/1‑143 ACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGTGTTGTCCTCGC > 1:314527/1‑124 ACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGCTGGTATACGTGGT < 2:39146/55‑1 ACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGCTGGTATACGTGGT > 1:39146/1‑55 ACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGCTGGTATACGTGGT < 2:247744/55‑1 ACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGCTGGTATACGTGGT > 1:247744/1‑55 TATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGGTGTCCTCGCGGCTTCTTCGCGGACGAACCAGCGagc > 1:341273/1‑140 CAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCCGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGGCAAAACAGCGTTACGGTG > 2:585199/1‑143 CAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAACCAGCGTTACGGTG > 2:111603/1‑143 AGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCCCGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTGAAAACAGAGTTCCGGTGC > 2:31467/1‑143 GCTGCGGGCCACCCGGAGCACGCAGCGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAACCCGCGTTCCGGTGCC > 1:131426/1‑143 CTGCGGGCCACCCGGAGCACGCGGCGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCACAACAGCGTTACGGTGCCC > 1:606881/1‑143 agctGCTGGTAGACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACAGTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCG < 2:461565/139‑1 gccGCTGTTACACGCGGTGTCAGCGGCGGACAAGGAGAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGT < 2:700971/140‑1 GCGGCTGGTGTACCGGCTGTCAGCGGCTGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGT < 2:534676/143‑1 GCGGCTGGTATCCGTGGTGCCAGCGCCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGT < 1:554804/143‑1 GCGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGT > 1:526620/1‑143 GCGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGT < 1:512012/143‑1 GCGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGT < 2:431871/143‑1 GCGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGT < 1:123440/143‑1 GCGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGT < 2:448419/143‑1 GCGGCTGGTACTCGTGGTGCCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGT < 2:640527/143‑1 GCGGCTGGGATACGTGGTGTCGGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTGCCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGT < 2:228281/143‑1 GCGGCGGGTATACGTGGTGTCAGCCGCGCACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGT < 2:560881/143‑1 GCGGCGGGTATACGTGGTGGCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGT < 2:242101/143‑1 CGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGAGAGCCTTGTCCTCACGGCGTTTACCCGGTCCCAACAGCCTTACGGTGCCCCACGGCGGCCCGATGAACTGCGcg > 1:67323/1‑141 CGGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGGTGAACTGCGTG > 2:726552/1‑143 CGGCTGGTATACGTGGCGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTG < 1:56702/143‑1 CGGCTGGTAGACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATGAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAACCAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTG < 2:146148/143‑1 CGGCTGGTAGACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTG < 2:735154/143‑1 CGGCCGGTATCCGTGGTGTTAGCGGCGGACTAGCCTGACCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTGTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTG < 2:106911/143‑1 GGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGC < 1:583727/143‑1 GGCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGGGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGGGTGC > 1:475291/1‑143 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGCTGAACTGCGTGCT > 1:78623/1‑143 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGACCTGCGTGCT > 1:319166/1‑143 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCT > 1:112470/1‑143 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCT > 1:212842/1‑143 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCT > 1:439742/1‑143 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCT < 1:462932/143‑1 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCT > 2:395995/1‑143 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGGGCT > 1:361344/1‑143 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACAGCGTGCT > 2:481299/1‑143 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACCGATGCAATGCGTGCc > 2:601342/1‑142 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGGGCCCCACGCCTGACGGCTGAACTGCGTGCT > 1:22838/1‑143 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCGCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACCGCCCCCCACGCCCGGCGGACGAACCGCCTGCc > 2:301441/1‑142 CTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACGAGGGTAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACACAGTCCATCTTTACCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCTC < 2:422039/143‑1 CTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCTC < 1:700900/143‑1 GTGGGGCACCGTAAC‑GCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/315788‑315642‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcggcTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCTC > NC_000913/315671‑315812 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |