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Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
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GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCATCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCT > 1:757647/1‑143 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGAAAAACACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGACTCGTGCGCGCGGCGATTACCCGTTCAAAACAGCGTTACGGTGCACCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCc > 2:510044/1‑142 GCTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGAAAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCT > 1:741090/1‑143 GCTGGTAGACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCCCGCCTGCCGGGCGAACTGCGTGCc > 2:879687/1‑142 CTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACACGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCTC < 1:730859/143‑1 CTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCTC < 1:762296/143‑1 CTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCTC < 1:372335/143‑1 CTGGTATACGTGGTCTCAGCCGCTGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGCTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCTC < 1:5353/143‑1 GTGGGGCACCGTAACGCTGTTTTGACCGGGTAAAAGCCGCGAGGACAACGCTGTCGCAGTGTTGGCGGAACTGCTGACGCGTGCTTATCCTTGTCCGCCGCTGACACCACGTATACCAGCCGCTGCGGGCCACCCGGAGCAC‑‑‑GCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/315788‑315642 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcggcTGGTATACGTGGTGTCAGCGGCGGACAAGGATAAGCACGCGTCAGCAGTTCCGCCAACACTGCGACAGCGTTGTCCTCGCGGCTTTTACCCGGTCAAAACAGCGTTACGGTGCCCCACGCCTGACGGATGAACTGCGTGCTC > NC_000913/315671‑315812 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |