New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3036329 | 46 (0.970) | 5 (0.110) | 5/250 | NT | 10.3% | intergenic (‑47/+44) | prfB/recJ | peptide chain release factor RF2/ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
? | NC_000913 | = 3036346 | 44 (0.980) | intergenic (‑64/+27) | prfB/recJ | peptide chain release factor RF2/ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
TCAAAGATACCCCCTAAGAACGTCGGAGCGTTCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGG > NC_000913/3036205‑3036488 | tCAAAGACACCTCCTAAGCACGGCGGAGCGTTCCTTGAGGTCCTGCATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCATACTTGGTCTGATTTCTTTTATTGTGCTCGTCACAATGCGGTGATAAGAGCGGAATTGTACCCAATCCAc < 1:484404/143‑1 (MQ=255) aaaGATACCCCCTAAGAACGTCGGAGCGTTCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCAcgc < 1:862724‑M2/143‑4 (MQ=255) aaaGATACCCCCTAAGAACGTCGGAGCGTTCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCAcgc < 1:309774‑M2/143‑4 (MQ=255) aaGATACCCCCTAAGAACGTCGGAGCGTTCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCAcgct > 1:754078‑M2/1‑139 (MQ=255) gATACCCCCTAAGAACGTCGGAGCGTTCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGAGTAATTTCGAACATGGTCTGATTGCTTTTATTGAGCTGTTCAACATGCGGTGATACGAGCGGGGTTGCACCCAATCCAccgtct < 1:408446‑M2/143‑7 (MQ=255) gAACGTCGGAGCGTTCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCACTCCACGCTCTTTTTTATAgcga > 1:182083/1‑143 (MQ=255) gAGCGTTCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACg > 2:555049/1‑143 (MQ=255) cGTTCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTa < 2:134685/143‑1 (MQ=255) ttCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTaaa > 2:747971/1‑143 (MQ=255) cGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGTGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTg < 2:758802/143‑1 (MQ=255) aGGTCCTGAATGCGATTATTTACCTGATTAATTTCAAACATGGTCTGCTTTCTTTTATTGCGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCa < 2:508225/143‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAACTGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGatat > 1:521492/1‑143 (MQ=255) tGAATGCGATTATCTGCCGATTTAATTTCAAGCATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATAtt < 2:862724/143‑1 (MQ=255) aaTGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAGACGTGGTCTGATTTATTTTATTGAGCTAGTCAGCATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTGTTTTATAGAGAAGTTGAGGCTAAGTTGGCCAggcagggt > 1:527013/1‑136 (MQ=255) aTGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTc < 2:897853/143‑1 (MQ=255) gATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCgatg > 2:655326/1‑143 (MQ=255) tattTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATa < 2:741247/143‑1 (MQ=255) cGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTCTTGAGCTAGTCAAAAGGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGGTAAATTGGCCAGATATTGTCGAAGGTAATTTgta > 2:315717/1‑141 (MQ=255) cGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCa < 1:555049/143‑1 (MQ=255) aTTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGCTAATTTGCAgcc > 2:100157/1‑141 (MQ=255) aTTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATACTTTGCAGGc > 2:139372/1‑143 (MQ=255) aTTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCCAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGc > 2:838090/1‑143 (MQ=255) ttAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCt > 1:756165/1‑143 (MQ=255) aTTTCACACATGTCCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAAATCTTTACTGTATCCAAGCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCg < 2:918332/143‑1 (MQ=255) aTTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCg < 1:115210/143‑1 (MQ=255) aTTTCAAACAGGGGCTGAGTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGTTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCg < 1:735795/143‑1 (MQ=255) ttCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGt > 1:659556/1‑143 (MQ=255) aaaCATGGTCTGATTTCTTTTATTGGGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGc < 2:899522/143‑1 (MQ=255) aaaCATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCAcgctcttatcaccgcattttgactagctcaataaaagaaatcagaccatgttt > 2:753625‑M2/1‑70 (MQ=255) aaaCATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCAcgctcttatcaccgcattttgactagctcaataaaagaaatcagaccatgttt < 1:753625‑M2/123‑54 (MQ=255) acgtGGTCTGGTTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCcg < 2:791409/140‑1 (MQ=255) tCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGacac > 2:276618/1‑143 (MQ=255) cTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGCTAATTTGCAGGCTGCGGTCGCCGCGAAACt > 2:11249/1‑143 (MQ=255) tGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTc > 1:452550/1‑143 (MQ=255) tttCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGtt < 1:33442/143‑1 (MQ=255) ttttATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGata > 2:128085/1‑143 (MQ=255) gtATTGTGCTAGTCAAAATGCGGTGCTAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATc < 1:669514/142‑1 (MQ=255) aTTGGGCTAGTCAACGTGCGGTGATGCGGGCGGGTTTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTTGTTGATATCGa < 2:386089/143‑1 (MQ=255) tGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGc < 2:346914/143‑1 (MQ=255) cTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGATAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGAAATCGAGCTtat > 2:184327/1‑143 (MQ=255) gTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCAcgctcttatcaccgcattttgactagctcaataaaagaaatcagaccatgtttgaaattaatccggtaaataatcgcattcaggacctcacggaacgctccga < 1:93693‑M2/143‑104 (MQ=255) gTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGTGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAg > 2:621541/1‑143 (MQ=255) aaaaTGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCa > 1:833016/1‑143 (MQ=255) caggCGGTGATAAGAGCGAGATTGTGCCCAAGCCACGCTCTTTTTTATAGGGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGGTATGGTCAATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGt < 2:871632/140‑1 (MQ=255) gCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACTCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGAGATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGc < 2:182083/143‑1 (MQ=255) gATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCAcgctcttatcaccgcattttgactagctcaataaaagaaatcagaccatgtttgaaattaatccggtaaataatcgcattcaggccctcacggaacgctccgacgcgcttaggggg < 2:14192‑M2/143‑117 (MQ=255) tAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGGGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGCTAATTTGCAGCCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTcgc < 2:442215/143‑1 (MQ=255) tAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTcgc < 2:452550/143‑1 (MQ=255) gagCGGGCTTGTACCCAATCCAcgctcttatcaccgcattttgactagctcaataaaagaaatcagaccatgtttgaaattaatccggtaaataatcgccctccggccctcacggcacgctccgccgtccttcgtgggtatct < 1:36546‑M2/143‑122 (MQ=255) agCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTTTTTTTTATTTGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGTAACTCGTTGATATCGGGCTTATCAGCCCGTTCCACTTCGCGCAc > 2:630276/1‑143 (MQ=255) agCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTGGCACTTCGCGCAc > 1:616572/1‑143 (MQ=255) tccccACTCCACGCTCTTTTTTATAGTGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATcc < 2:379914/141‑1 (MQ=255) cccAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACCTCGCGCCCGCCGTTCTCCgg > 2:556231/1‑143 (MQ=255) cAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAACCTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGcc < 1:242787/143‑1 (MQ=255) aTCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGGTATCCGGCCag > 1:705287/1‑143 (MQ=255) aCGCCCTTGTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATACGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAggg < 1:779988/143‑1 (MQ=255) | TCAAAGATACCCCCTAAGAACGTCGGAGCGTTCCGTGAGGTCCTGAATGCGATTATTTACCGGATTAATTTCAAACATGGTCTGATTTCTTTTATTGAGCTAGTCAAAATGCGGTGATAAGAGCGGGATTGTACCCAATCCACGCTCTTTTTTATAGAGAAGATGACGCTAAATTGGCCAGATATTGTCGATGATAATTTGCAGGCTGCGGTTGCCGCGAAACTCGTTGATATCGAGCTTATAAGCCAGTTGCACTTCGCGCACGCCGTTATCCGGCCAGAGGG > NC_000913/3036205‑3036488 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |