| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,402,140 | G→A | 44.6% | P569L (CCG→CTG) | nuoC ← | NADH:quinone oxidoreductase subunit CD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,402,140 | 0 | G | A | 44.6% | 7.7 / 66.2 | 64 | P569L (CCG→CTG) | nuoC | NADH:quinone oxidoreductase subunit CD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (14/20); new base A (11/17); total (25/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
CGCACTCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCATTGGC > NC_000913/2402005‑2402270 | cGCCCTCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAGTCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTtg < 1:773284/143‑1 (MQ=255)cGCACTCAGCTCAAACGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACACCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTtg < 1:7894/143‑1 (MQ=255)cGCACTCAGCTCAAACGCCTCGGTTTGTGGGTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATATCAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTtg < 2:819837/143‑1 (MQ=255) tCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCa > 1:814934/1‑143 (MQ=255) aGCGCAAGAGCCTCGGGTTGTGGGTGTGGATGCTCGTGCAGAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAGGTCGATACTGCCCAGATAAACGAGCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCaaa < 1:230070/143‑1 (MQ=255) gCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATATGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATAGCCGCCGGAATTtgccgcgagg > 2:878623/1‑139 (MQ=255) tCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCCGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATgc < 1:480553/143‑1 (MQ=255) tCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATgc < 1:443110/143‑1 (MQ=255) tCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTACGGCGGACCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATgc > 1:586597/1‑143 (MQ=255) tCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATCCTCGTGCATAATCACCCGCCCACATCTTACATAACAAAATCGATAATACCCAGATAAACAATCAGATCAGACACCAAGCTGCCGCAGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATgc > 1:945890/1‑143 (MQ=255) aaGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATCATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGCACTTTGCTGCAAATGCGCaa > 2:185149/1‑143 (MQ=255) tCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTc > 1:91954/1‑143 (MQ=255) ggTTTGTGGTCTTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGTAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCgg < 2:36365/143‑1 (MQ=255) gttgATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACGAAATCGGTACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAAGGCGCACGGCTCGGGGTACGAacac > 2:12307/1‑143 (MQ=255) tctcGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGc > 2:37502/1‑143 (MQ=255) cgcGTGCAGAAGTAGCGGGCCACCTCTGAAATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCg < 2:406808/141‑1 (MQ=255) tcGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCgg > 2:689885/1‑143 (MQ=255) cGTTCATATTTGTCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGCTACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGTATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCACAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGt < 2:52334/143‑1 (MQ=255) gTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCACAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTa > 2:603013/1‑143 (MQ=255) tAATTCGCGGTCCACATCTGACATCACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCa < 1:760258/143‑1 (MQ=255) tAATTAGCGGTCCGCATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCa < 1:271733/143‑1 (MQ=255) aaTGAGCGGTCCACATCTGACATAACCTCTCCCTTACTGCCCATATAACCAATCAGGTCAGACGCCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCAt < 2:410539/143‑1 (MQ=255) actaccGGTCCACATCTGACATGACAAAATCGATACTGCGCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATg < 2:318322/138‑1 (MQ=255) aTTAGCGGTCCACATCTGACATAACAATATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGAACGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATg < 2:872099/143‑1 (MQ=255) aTTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTACAAATACGCAAAGCTCGGGGTAAGAACACGGGTGCGGTAACTCATg > 1:470825/1‑143 (MQ=255) ttAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGCACACGGGGGCGGTAACTCATgg > 2:149028/1‑143 (MQ=255) ttAGCGGTCCACACCTGACATAGCAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATgg < 2:932329/143‑1 (MQ=255) cGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGACAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCGAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGtgct > 1:38580/1‑143 (MQ=255) tCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCCGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATTCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGcc > 1:922945/1‑143 (MQ=255) tCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTACCTCATCTTGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGcc < 1:685391/143‑1 (MQ=255) cTGACATAGCATAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTg < 1:580591/143‑1 (MQ=255) gtggtacaaTCGATACTGCCCAGATACACGGTCAGGTCAGTCGTCAGGCGACCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAg < 2:371322/136‑1 (MQ=255) tAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAgg > 1:96456/1‑143 (MQ=255) aaTCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACGCATGGTGCTGCCGTCGCAGGTCAGGTAGaaa > 2:744075/1‑143 (MQ=255) aTCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGGAGTAAc > 2:73445/1‑143 (MQ=255) cGATACTGCCCAGATAACCGCTCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCGAGTGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTg < 2:686329/143‑1 (MQ=255) ataTACTGCCCAGCGAAGCCATCAGGGCAGACACCAGGATGCCGCGGATCGCCGCCGGAGTTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTg < 2:687440/141‑1 (MQ=255) cTGCGCAGGTAAGCAAGCTGGTCGGACACCGGGCTGCCGCGGCTCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCGCGGGGTACGCACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGAt < 2:57177/143‑1 (MQ=255) gCCCAGATACACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATcc < 1:656448/143‑1 (MQ=255) gCCCAGATACACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGATTGTCTCCATTGCTTATGCGCACAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATcc < 1:431623/143‑1 (MQ=255) cccAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGGCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATccc > 1:294427/1‑143 (MQ=255) cccAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACAGGGGTGCGGCAACTCATCGTGCTGCCGTCGCTGGCCAGGTAGTAACTGTTGATcac > 1:431056/1‑141 (MQ=255) ccAGATAAACAAGCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCt < 1:604902/143‑1 (MQ=255) aGACAAACAGTCAGGTCAGACACGAGGCTGCCGCGGATCGGCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCttt < 2:258709/143‑1 (MQ=255) gATAAACAGTCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTg < 2:678905/143‑1 (MQ=255) aCAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTACCTAACGGACCTTCCTTTGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGc > 1:211010/1‑143 (MQ=255) aaTCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCt < 1:557066/143‑1 (MQ=255) aTCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAGTGCGCAACGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTc < 2:814934/143‑1 (MQ=255) aGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTCTGGTCGCCTCCat > 2:425171/1‑143 (MQ=255) ggTCAGGCATCAGGCTGCCGCGGCTCGCCGCCAGAAGTTGCTGCAAATGCGCACAGCTCGGGGTACGACCACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAatc < 2:809080/143‑1 (MQ=255) gTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAGGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAatca > 1:62419/1‑143 (MQ=255) cAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGCACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCGCAatcatc > 1:594690/1‑143 (MQ=255) cAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCGatcatc > 1:594880/1‑143 (MQ=255) agcaacCAGGCGGCCGCGGAGCGCCGCCAGAAGTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACCCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCt < 1:320012/139‑1 (MQ=255) gACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTg < 1:374576/143‑1 (MQ=255) cacCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGa > 1:37022/1‑143 (MQ=255) ccAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGAAGCGAAGCCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGaaa < 1:890080/143‑1 (MQ=255) ggCTGCCGCGGATCGCCGCCGGCATGTGCTGCAAATGCGCAGAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGAt < 2:750080/143‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGCGCCGCCAGAATTTGCGGCAAATGCGCAAAGCGCGGGGTACGAACACGGGGGCGGTAACTCATGGTGCTACCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCAt < 2:902589/143‑1 (MQ=255) gCCGCGGATCCCCCCCGTAACTTGCTGCAAATGCGCAACGCTCCGAGTACTAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGTTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCAt < 1:283044/143‑1 (MQ=255) ccGCGGGTGGCCGCCAGACGTTGCGGCTAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGCACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCAtt < 2:45860/143‑1 (MQ=255) cgcgGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCATTg < 1:878623/143‑1 (MQ=255) gctgttcgtcgCCTGAATTTGCTGCAAATGCGCACAGATCGGGGTCCGAACACGGCTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTTGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCATTgg < 1:588411/138‑1 (MQ=255) cgcgtCGCCCCCAGAACTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGGCGACTCCATCATCTGGAAAGATTCATTggc < 1:644422/139‑1 (MQ=255) | CGCACTCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCATTGGC > NC_000913/2402005‑2402270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |