| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 82 (1.420) | 69/272 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
GATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGT > NC_000913/1300556‑1300840 | tactccagttagttataaggatttccttacctgcttctcctcaccatcatggtattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 2:336087‑M2/1‑1 (MQ=255) attacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcatcatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctctggtagagtaaagtgctaaat > 2:126853‑M2/142‑143 (MQ=255) ttacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattagtaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 2:977474‑M2/3‑1 (MQ=255) agttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:1009416‑M2/7‑1 (MQ=255) agttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa > 1:489515‑M2/137‑143 (MQ=255) gttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttagtttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat < 1:808811‑M2/8‑1 (MQ=255) ttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAtt > 1:330835‑M2/131‑143 (MQ=255) ttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAtt < 1:920545‑M2/13‑1 (MQ=255) ttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAtt > 2:629524‑M2/131‑143 (MQ=255) ataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaAGAATAATCAATTGt > 1:291958‑M2/129‑143 (MQ=255) gatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagattacttgaaatgatattattacttccactgcctttggtagaggaaagagctaaATAATAATCAATTGTTAAat > 2:981938‑M2/124‑143 (MQ=255) tccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 2:472505‑M2/24‑1 (MQ=255) aactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCa < 2:283777‑M2/29‑1 (MQ=255) tgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 2:430153‑M2/32‑1 (MQ=255) cttgtccgcaccatcatgttagttgcggcacatcataatcgtgggcgtggtgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 1:549814‑M2/34‑1 (MQ=255) cttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 2:57054‑M2/34‑1 (MQ=255) ttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac < 1:69358‑M2/35‑1 (MQ=255) ttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac < 1:921621‑M2/35‑1 (MQ=255) ttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac < 1:943826‑M2/35‑1 (MQ=255) tctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCact > 2:726647‑M2/108‑143 (MQ=255) cctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcatttggatgagtaaagtgctacATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCcctact > 1:253752‑M2/105‑143 (MQ=255) ctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgacgaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATGCTCAATTGTTCACTTTTTGTGCATTTCCCTACTg > 1:84396‑M2/104‑143 (MQ=255) tcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTgg > 2:34574‑M2/103‑143 (MQ=255) caccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaatacttgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGa > 2:1013676‑M2/102‑143 (MQ=255) accatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa < 1:901483‑M2/43‑1 (MQ=255) accatcatgttattttcgccacatcataatcctcggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgactttggcacaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTATATTATTGTGCATTTTACTACTGGaa > 2:925246‑M2/101‑143 (MQ=255) catcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt > 1:672191‑M2/99‑143 (MQ=255) atcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctcaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:467079‑M2/98‑143 (MQ=255) cttgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTa < 2:637869‑M2/48‑1 (MQ=255) gttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATc > 2:993398‑M2/93‑143 (MQ=255) ttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCa < 1:192212‑M2/52‑1 (MQ=255) ttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattcaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATATACAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGAAACTGTaataa > 2:836834‑M2/92‑141 (MQ=255) attttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGa > 1:628821‑M2/90‑143 (MQ=255) ttttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaa < 1:1049692‑M2/55‑1 (MQ=255) tttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaaa < 1:929257‑M2/56‑1 (MQ=255) tttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaaa < 1:529948‑M2/56‑1 (MQ=255) ttcgtcacatcattatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgtctttggtatatgaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaaaa < 2:521426‑M2/57‑1 (MQ=255) tcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAg > 2:933963‑M2/86‑143 (MQ=255) cgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGa < 1:161615‑M2/59‑1 (MQ=255) gccacatcataatcctgggcttgctgaagaagaattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagcggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAt < 2:334958‑M2/60‑1 (MQ=255) cggggacataatcgtgggcctgcttaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATa < 1:805863‑M2/61‑1 (MQ=255) cacgtcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAg < 2:216941‑M2/62‑1 (MQ=255) tcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACAt > 1:791406‑M2/78‑143 (MQ=255) cataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATg > 2:448910‑M2/77‑143 (MQ=255) atcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTa < 2:558255‑M2/71‑1 (MQ=255) gggcttgaggaagaaaaattaaaatgacattaggaatcccacagcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCaa < 1:3264‑M2/76‑1 (MQ=255) ggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAAt < 1:184146‑M2/77‑1 (MQ=255) cgcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAAt < 2:420056‑M2/77‑1 (MQ=255) cgtgctgaaggttaattgaaatgatagtattaattccactgcttttggtagagggaagtgctaaATAATAATCAAGTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAAtct < 2:419502‑M2/79‑1 (MQ=255) gaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATttgat < 2:794865‑M2/88‑1 (MQ=255) gaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATttgat < 1:420630‑M2/88‑1 (MQ=255) aacaattgaaatgatactattaaatccactgtctgtggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTACTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATttgatt < 2:870158‑M2/89‑1 (MQ=255) aaatggtagtgttaagtccactgcctgtgggagaggaaagggctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATGTCACTACTGGAACTGTAATCAGCGAAGATAGACATGCTTAGCCAATCGCTATTTGAttgaattgaa < 1:138756‑M2/97‑1 (MQ=255) atgatattattaattccaccgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAg < 1:951977‑M2/99‑1 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagttctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtg < 1:495991‑M2/102‑1 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgt > 1:926233‑M2/41‑143 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgttt < 1:221208‑M2/105‑1 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgttt > 1:83671‑M2/39‑143 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgttt < 2:39864‑M2/105‑1 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGTTTGCATTGAAACATGTTTGTT‑aa > 1:49054‑M2/34‑143 (MQ=255) attcctctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAg < 2:72938‑M2/111‑1 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCAt < 1:871533‑M2/115‑1 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCAt > 1:764375‑M2/29‑143 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATg > 1:894261‑M2/24‑143 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATg < 1:541870‑M2/120‑1 (MQ=255) tttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCa > 1:165812‑M2/22‑143 (MQ=255) tttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTAGAACTGTATTTAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGTTGTTTGTT‑AAGTCATGAATTCa > 2:496656‑M2/22‑143 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCaa < 1:83238‑M2/123‑1 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCaa > 1:235341‑M2/21‑143 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCaa < 1:545581‑M2/123‑1 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAg < 1:431160‑M2/124‑1 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCACACCATATTTGATTGAACTGAACGATGTTTGTT‑AACGCATCGATGCACGCta > 2:181835‑M2/17‑143 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATAAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATAGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGAATGCAAGAta > 2:390543‑M2/17‑143 (MQ=255) aggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAg < 2:1045447‑M2/130‑1 (MQ=255) ggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAGa < 2:1021549‑M2/131‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAGAt < 2:53923‑M2/132‑1 (MQ=255) cagtgctaaATAATACTCGATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACAGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTc < 1:328077‑M2/134‑1 (MQ=255) agtgctaaATGATAATCAATTGTTAAATTAGTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCt < 1:277848‑M2/135‑1 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCt < 1:916304‑M2/135‑1 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGACAAGAGAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGa < 1:814650‑M2/137‑1 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATCGAAATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATGGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGCTGCAAGCTCTAGATTCTGa > 1:471543‑M2/7‑143 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGCTGCAAGCTATCGATtctag > 2:117581‑M2/7‑141 (MQ=255) aaaaaaTAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTCTTGGATACAATCGAAAACTGTTTGTTGATGACCTGGA‑GCAAGCTATAGAGGCTGATACg < 1:259416/143‑1 (MQ=255) aaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACg < 2:452822‑M2/141‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACgg < 2:330835‑M2/142‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAGATGCTGATACGGt > 2:730583/1‑143 (MQ=255) ataataatCAATTGTATCAATATTGTGTATTTCACTGCTTTAAATGTAAGAAAGAAAGATTGACATGCTTAGCCAATCTAGTTTTGATTGAATTGAAAGATGTTGGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGt < 2:376182/143‑1 (MQ=255) | GATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTT‑AAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGT > NC_000913/1300556‑1300840 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |