Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,402,140 | G→A | P569L (CCG→CTG) | nuoC ← | NADH:quinone oxidoreductase subunit CD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,402,140 | 0 | G | A | 98.5% | 187.1 / NA | 66 | P569L (CCG→CTG) | nuoC | NADH:quinone oxidoreductase subunit CD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (31/33); total (32/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
TCTGCCGCACTCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCATTGGCAGGCATCA > NC_000913/2402000‑2402278 | tctGCCGCACTCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGa > 2:416070/1‑143 (MQ=255) gCACTCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTtgc < 1:47481/143‑1 (MQ=255) gCACTCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTtgc < 2:414061/143‑1 (MQ=255) cTCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAACTCGATACTGCCCAGATAAACACGCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTtgctgc < 2:1037865/143‑1 (MQ=255) tCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACCTCTGACATAACAAACTCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTAAGACACCGGGCTGCCGCGGATCACAGCCAGAGTTcgctgac > 2:829200/1‑141 (MQ=255) tCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTCGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCCGGTCAGACACCAGGCTGCCGCCGATCGCCGCGAGAATATGCTGCAAATga > 2:247452/1‑142 (MQ=255) cAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATgcg > 1:741009/1‑143 (MQ=255) aaaaGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACATCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATgcgc > 1:798199/1‑143 (MQ=255) cTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAGTGCGCAAAGCt > 2:510969/1‑143 (MQ=255) cGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCg < 2:1112009/143‑1 (MQ=255) tttGTGGTTGTAGATTCTCGTGCATAGTTAGCGGTCCACATCTGACATGGCAAACTCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGTCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCgtgg < 2:865050/143‑1 (MQ=255) ttggtgCTTGTAGAGTCGCGTGCATCATTAGTGGTTGACAGCTGACATACCAATATCGATACTGCCCAGATAAACAAGCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCgggg < 2:644738/140‑1 (MQ=255) tgGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCCGGTCCGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAACTTGCTGCACATGCGCAAAGCTCGGGGGACg > 2:1032848/1‑143 (MQ=255) tgGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCCGAAACCAGTCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAAGGCGCAACGCCCggggcgcg > 2:389490/1‑139 (MQ=255) tgGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAAGGCGCAAAGCCCGGGGTACg > 2:219476/1‑143 (MQ=255) ggTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACGATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGa < 2:355128/143‑1 (MQ=255) ttgttgATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAac < 2:679849/143‑1 (MQ=255) ttgATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGAACGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACg > 2:988512/1‑143 (MQ=255) gtgATTCTCGTGCATAACGAGCGGTCCACATCTGACATAACACAGTCGATACCGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACg < 1:518920/142‑1 (MQ=255) aTTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCC‑CCAGAATTTGCTGCAAATGCGCCACGCCCGGGGTCCGAACACGGGTg > 2:6749/1‑143 (MQ=255) ctcGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCg < 1:52516/143‑1 (MQ=255) tGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTCCTGCAAAGGCGCAACGCCCGGGGACCGCACACGGGTGCgaaaa > 2:387475/1‑139 (MQ=255) tGCATAATTAGCGGTACACATCTGACATAACAAAATCGATACTGACCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAAGGCGCCACGCTCGGCGTACGACGACGGGCGCgggag > 2:109160/1‑140 (MQ=255) tGCATAAGTAGCGGTCCACATCTGACAGACCAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTaa < 2:25493/143‑1 (MQ=255) aTAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGGAAcgc > 1:262265/1‑141 (MQ=255) tAATTAGCCGTCTACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCATATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCa < 2:273846/143‑1 (MQ=255) tAACTAGCGGTCCACATCTGACATCACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAAGCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCa < 1:36781/143‑1 (MQ=255) aaaTGAGCGGCCCACATCTGCCATAACAAAATCGACACTGCCCGGATAAACAACCAGGTCAGGCACGGGAGGGCCTGGGGTTGCCGCCAGAATTGGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCa < 2:972482/142‑1 (MQ=255) caTTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCAt < 2:332973/142‑1 (MQ=255) cttAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAAGCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATg < 2:409550/142‑1 (MQ=255) ttcgtggTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATgg < 1:749150/138‑1 (MQ=255) ttAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATgg > 2:80284/1‑143 (MQ=255) aGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGtg > 2:660331/1‑143 (MQ=255) gTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGCCACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAGATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGtgctgc > 1:972246/1‑143 (MQ=255) gTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGAGAGGTAACTCATGGtgctgc > 2:159189/1‑143 (MQ=255) cacaTCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGt < 2:746332/143‑1 (MQ=255) aTCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGc > 1:372771/1‑143 (MQ=255) aTCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGGACGAACACGGGGGCAGGAACACATGGTGATGCCGACGc > 2:981312/1‑143 (MQ=255) aTCTGACAGCACAAAGTCGATACTGCACAGAGAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCTGAATTTGCTGCACATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGc < 1:871444/143‑1 (MQ=255) cTGACATACCAACATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTg < 1:372929/143‑1 (MQ=255) tGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTgg > 2:91035/1‑143 (MQ=255) aCATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCggggc > 2:459277/1‑141 (MQ=255) aTAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAg > 1:1059851/1‑143 (MQ=255) ccAAAAGCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGgta < 1:1039636/142‑1 (MQ=255) aCAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGgta > 1:638593/1‑143 (MQ=255) aaaaTCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGCTGCTGCCGTCGCTGGTCAGgtcgt > 1:428665/1‑143 (MQ=255) aaaaTCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCAGGGTGCTGCCGTCGCTGGGCAGgtagt > 1:519169/1‑143 (MQ=255) aaaTCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGgtagta > 1:590716/1‑143 (MQ=255) actCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCCGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTGGCTGCGAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTaa < 2:963759/141‑1 (MQ=255) aCTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCGGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGa < 1:1014573/143‑1 (MQ=255) cTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGAt < 1:967344/143‑1 (MQ=255) aGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGACCGCCGCCAAAATTTGCTGCCAAGGCGCAAAGCTCGGGCTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCGGCCGTCGCTGGCCAGGTCGTACCTGTCGCGCCCttt > 2:215106/1‑143 (MQ=255) tAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGt < 1:91035/143‑1 (MQ=255) tAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGt < 1:835544/143‑1 (MQ=255) gcggtCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGGTCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGc < 2:480963/139‑1 (MQ=255) aCAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGc < 1:80284/143‑1 (MQ=255) gACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCACTTTGGTCGGCTCGATCATCTg > 1:343544/1‑143 (MQ=255) acacCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTgg < 1:416070/143‑1 (MQ=255) cacCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTGGATCCCTTTGGTCGCCTCGATCATCTggc > 1:924617/1‑142 (MQ=255) tcctggCTGCCGCGGCTCGCCGCCAGCATCTGCTGCAAACGCGCAGAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGGAACTCATCGCTCTCCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGACCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGaa < 1:101924/139‑1 (MQ=255) ccAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGaaa < 1:907009/143‑1 (MQ=255) ccGCGGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCAtt > 2:923353/1‑143 (MQ=255) gcgGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTGGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCATTgg < 1:768524/143‑1 (MQ=255) cgGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGt < 1:313497/113‑1 (MQ=255) cgGATCGCCGCCAGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGt > 2:313497/1‑113 (MQ=255) cgGATCGCCGCCAGAATTCGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCATTggc < 1:615594/143‑1 (MQ=255) ccgccaGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACAAACACGGACGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCTGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTAGAAAGAGTCATTGGCAGGCATc > 2:868841/1‑143 (MQ=255) cgccaGAACTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCATTGGCAGGCATCa < 1:1071581/143‑1 (MQ=255) | TCTGCCGCACTCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCATTGGCAGGCATCA > NC_000913/2402000‑2402278 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |