New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 64036 = | 78 (0.820) | 4 (0.040) | 4/262 | NT | 5.4% | coding (1745/2352 nt) | polB | DNA polymerase II |
? | NC_000913 | 64073 = | 65 (0.710) | coding (1708/2352 nt) | polB | DNA polymerase II |
AAACACCATCCGCTGCTTGTCGCCCTCCTGAATCAGTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCACCAGTGCACGACCGATTTTCGCCGCTTCTTCTTCCGAATGTGCGCCTTTCAGCCAGACAAACGTTGAGTCGGTATCGCCGTAGATAACGTCGTAGCCCTGTGCTTCAATCAAC > NC_000913/63888‑64185 | aaaCAGCATGCGCTGGTTGTCTCCCTCCCTAATCAGTCCGTCATATCGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCTCGAATGTTTGGCATCAGAAATCGGCAGAAATTTGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGTTCAGCCTTTGTTTTTg < 2:111340/150‑1 (MQ=255) aaaCACCATCCGCTGCTTGTCGCCCTCCTGAATCAGTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTg > 2:702504/1‑150 (MQ=255) aaaCACCATCCGCTGCTTGTCGCCCTCCTGAATCAGTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTg < 1:1298395/150‑1 (MQ=255) 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gctTGTGGCCCTCCTGAATCAGTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGccc < 2:528282/150‑1 (MQ=255) gctTGTCGCCCTCCTGAATCAGTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGccc > 1:1162805/1‑150 (MQ=255) gctTGTCGCCCTCCTGAATCAGTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGccc < 2:220174/150‑1 (MQ=255) tGTCGCCCTCCTGAATCAGTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGGTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCccacc < 2:1619348/150‑1 (MQ=255) tCGCCCTCCTGAATCAGTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAg > 2:1450455/1‑150 (MQ=255) 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tCAGTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGtgct < 2:16602/150‑1 (MQ=255) tCAGTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGtgct > 2:1138855/1‑150 (MQ=255) aGTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGtgctgc < 1:666197/150‑1 (MQ=255) gTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCa < 2:1475379/150‑1 (MQ=255) ccGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGtgct > 2:478085/1‑145 (MQ=255) 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gcTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCACCAGTGCACGACCGATTTTCGCCGCTTCTTCTTCCGAATGTGCGCCTTTCAGCCAGACAAACGTTGAGTCGGTATCGCCGTAGATAACGTCGTa < 2:447187/150‑1 (MQ=255) cTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCACCAGTGCACGACCGATTTTCGCCGCTTCTTCTTCCGAATGTGCGCCTTTCAGCCAGACAAACGTTGAGTCGGTATCGCCGTAGATAACGTCGTAg < 2:1424523/150‑1 (MQ=255) gTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCACCAGTGCACGACCGATTTTCGCCGCTTCTTCTTCCGAATGTGCGCCTTTCAGCCAGACAAACGTTGAGTCGGTATCGCCGTAGATAACGTCGTAGccc < 1:775787/150‑1 (MQ=255) gCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCACCAGTGCACGACCGATTTTCGCCGCTTCTTCTTCCGAATGTGCGCCTTTCAGCCAGACAAACGTTGAGTCGGTATCGCCGTAGATAACGTCGTAGCCCtgtg > 2:529883/1‑150 (MQ=255) gCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCACCAGTGCACGACCGATTTTCGCCGCTTCTTCTTCCGAATGTGCGCCTTTCAGCCAGACAAACGTTGAGTCGGTATCGCCGTAGATAACGTCGTAGCCCtgtg > 2:1530366/1‑150 (MQ=255) ccGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCACCAGTGCACGACCGATTTTCGCCGCTTCTTCTTCCGAATGTGCGCCTTTCAGCCAGACAAACGTTGAGTCGGTATCGCCGTAGATAACGTCGTAGCCCTGTGc < 1:1450455/150‑1 (MQ=255) ccGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCACCAGTGCACGACCGATTTTCGCCGCTTCTTCTTCCGAATGTGCGCCTTTCAGCCAGACAAACGTTGAGTCGGTATCGCCGTAGATAACGTCGTAGCCCTGTGc < 1:1456102/150‑1 (MQ=255) ccGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCACCAGTGCACGACCGATTTTCGCCGCTTCTTCTTCCGAATGTGCGCCTTTCAGCCAGACAAACGTTGAGTCGGTATCGCCGTAGATAACGTCGTAGCCCTGTGc > 2:1046515/1‑150 (MQ=255) ttgttTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCACCAGTGCACGACCGATTTTCGCCGCTTCTTCTTCCGAATGTGCGCCTTTCAGCCAGACAAACGTTGAGTCGGTATCGCCGTAGATAACGTCGTAGCCCTGTGCTtc < 2:376828/150‑1 (MQ=255) TGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCACCAGTGCACGACCGATTTTCGCCGCTTCTTCTTCCGAATGTGCGCCTTTCAGCCAGACAAACGTTGAGTCGGTATCGCCGTAGATAACGTCGTAGCCCTGTGCTTCAATCAAc > 1:1610504‑M1/1‑150 (MQ=255) | AAACACCATCCGCTGCTTGTCGCCCTCCTGAATCAGTCCGGCATAACGCTTTTTACTGCCGGTATCGGCTCCGCGAATGGTTGGCATCAGAAAACGGCAGAAATGGGTTTCATACTCCAGTTCTAATGCGCTGGTCAGCCGTTGTTTTTGCAGC‑‑GTTTCCGCCCACCAGGCGTTAACGTGCTGCACCAGTGCACGACCGATTTTCGCCGCTTCTTCTTCCGAATGTGCGCCTTTCAGCCAGACAAACGTTGAGTCGGTATCGCCGTAGATAACGTCGTAGCCCTGTGCTTCAATCAAC > NC_000913/63888‑64185 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |