| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 947041 | 70 (0.740) | 10 (0.120) | 8/246 | NT | 12.8% | intergenic (+22/‑188) | ycaD/ycaM | putative transporter YcaD/putative transporter YcaM |
| ? | NC_000913 | = 947049 | 73 (0.860) | intergenic (+30/‑180) | ycaD/ycaM | putative transporter YcaD/putative transporter YcaM | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGT > NC_000913/946892‑947189 | ccGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAA > 1:1424602‑M1/1‑150 (MQ=255) cTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACtt < 1:313211/150‑1 (MQ=255) aTGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCACCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTAc < 2:31638/150‑1 (MQ=255) gCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTg < 2:1385250/150‑1 (MQ=255) cTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAAacagtaag > 1:976814‑M1/1‑142 (MQ=255) cTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGt > 1:1092431/1‑150 (MQ=255) cTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGt > 2:1535255/1‑150 (MQ=255) tGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACCTGTAAATTAATTAAAGCAGAGTGTGGACGTACGGTttga < 1:204701‑M2/150‑5 (MQ=255) gCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTttcac < 2:733410‑M2/150‑6 (MQ=255) gCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTttcac < 2:1310811‑M2/150‑6 (MQ=255) gCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTttcac > 2:1375601‑M2/1‑145 (MQ=255) ttCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAAacagtaagttcacactctgc < 2:1003573‑M1/150‑21 (MQ=255) tcCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAAacagtaagttcacactctgcttg < 1:1605686‑M1/150‑24 (MQ=255) tcCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTAAACCAGAGTGTGAAGTTAGTGTttcacactctgattt < 1:321915‑M2/150‑16 (MQ=255) tcCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTACTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAAacagtaagttcacactctgcttg < 1:1495033‑M1/150‑24 (MQ=255) gATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTTTCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCGGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGATTTCAAGCAGAGTGTGAAacagtaagttcacactctgcttgaat < 1:1288973‑M1/150‑27 (MQ=255) aaTTTATTGTTAATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGtt < 2:1486133/150‑1 (MQ=255) tttATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAAacagtaagttcacactctgc > 1:493081‑M1/1‑119 (MQ=255) tttATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAAacagtaagttcacactctgc < 2:493081‑M1/139‑21 (MQ=255) ttATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTttct < 1:1392496/150‑1 (MQ=255) ttATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTttct > 1:1543629/1‑150 (MQ=255) tATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTttctt < 1:493777/150‑1 (MQ=255) tATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTttctt < 2:1420223/150‑1 (MQ=255) 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tATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCaaa > 1:386008/1‑150 (MQ=255) tCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAAtt < 1:1184607/150‑1 (MQ=255) cGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAAttt > 2:938345/1‑150 (MQ=255) cgatccTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTa < 1:1057777/145‑1 (MQ=255) ttCTCTATTTGCTGATGGGGCTGCGCAACGCCGGTCCTACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATTAATTCACGCCGCGTGTTACCTTACTGTttcacactctgcttgaattcatttacaggtgagcaacgggtttcggcgtatgacc > 2:204701‑M2/1‑95 (MQ=255) 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cAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTttcacactctgcttgaattcatttacacgtgagcaacgggtttcggcgtatgaccggcgttgcgcagcagcatcagcaaatagataaacgatacgctggcgatcatgataaacaataaattatcgga < 1:1605686‑M2/150‑128 (MQ=255) aaatcagagTGTGAAacactaacttcacactctggtttaattcatttacacgtgagcaacgggtttcggcgtatgaccggcgttgcgcagcagcatcagcaaatagataaacgatacgctggcgatcatgataaacaataaattatcgga < 1:321915‑M1/146‑136 (MQ=255) aaGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCgcgc > 2:414246/1‑150 (MQ=255) aGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCa > 2:827519/1‑150 (MQ=255) aGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCa < 2:1403797/150‑1 (MQ=255) 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gagTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCGGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTTTTTCCGCAGTTCTTATTTGCCGCGCATaag > 2:63905/1‑149 (MQ=255) agTGTGAAacagtaagttcacactctgcttgaattcatttacacgtgagcaacgggtttcggcgtatgaccggcgttgcgcagcagcatcagcaaatagataaacgatacgctggcgatcatgataaacaataaattatcggagaaattc > 2:601667‑M1/1‑8 (MQ=255) agTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATc < 1:1559356/150‑1 (MQ=255) tgtgAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATccc > 2:1663279/1‑150 (MQ=255) gtgAAacagtaagttcacactctgcttgaattcatttacacgtgagcaacgggtttcggcgtatgaccggcgttgcgcagcagcatcagcaaatagataaacgatacgctggcgatcatgataaacaataaattatcggagaaattctgc < 2:733410‑M1/150‑146 (MQ=255) gtgAAacagtaagttcacactctgcttgaattcatttacacgtgagcaacgggtttcggcgtatgaccggcgttgcgcagcagcatcagcaaatagataaacgatacgctggcgatcatgataaacaataaattatcggagaaattctgc < 2:1310811‑M1/150‑146 (MQ=255) gtgAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCt > 1:1498720/1‑150 (MQ=255) gtgAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCt > 2:177005/1‑150 (MQ=255) gtgAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCt > 1:132285/1‑150 (MQ=255) tgAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTc > 2:231338/1‑150 (MQ=255) tcaaaccgtacgtccacactctgctttaattaatttacaggtgagcaacgggtttcggcgtatgaccggcgttgcgcagcagcatcagcaaatagataaacgatacgctggcgatcatgataaacaataaattatcggagaaattctgca < 1:204701‑M1/148‑147 (MQ=255) aaCTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGt > 2:430817/1‑150 (MQ=255) | CCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGT > NC_000913/946892‑947189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |