New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2501197 = | 83 (0.870) | 7 (0.080) | 7/268 | NT | 8.6% | coding (68/858 nt) | ypdC | putative AraC‑type DNA‑binding transcriptional regulator YpdC |
? | NC_000913 | 2501252 = | 67 (0.720) | coding (123/858 nt) | ypdC | putative AraC‑type DNA‑binding transcriptional regulator YpdC |
AGATCTGGATTTTGAAGTGCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGAAGCAAAGCAGCAACGTTTGGTGGAA > NC_000913/2501048‑2501345 | aGATCTGGATTTTGAAGTGCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTaa < 1:979211/150‑1 (MQ=255) aGATCTGGATTTTGAAGTGCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTaa < 1:985475/150‑1 (MQ=255) ttgttgttgaccggtaaattagccgcgcgcgccggaataaacagcatttctccttccaccaaacgttgctgctttgcttccagcagattgccgtattcgccgcgcagcacgatatccagacggggaaaatcaatacataaactgcccAcc < 2:188370‑M1/3‑1 (MQ=255) aTCTGGATTTTGAAGTGCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAAcc > 2:56776/1‑150 (MQ=255) aTCTGGATTTTGAAGTGCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTAAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAAcc < 2:1568932/150‑1 (MQ=255) tGGATTTTGAAGTGCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGc < 1:766221/150‑1 (MQ=255) aTTTTGAAGTGCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAac < 1:868366/150‑1 (MQ=255) aTTTTGAAGTGCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAac < 2:972144/150‑1 (MQ=255) ttttGAAGTGCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGCAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAact < 2:1362721/150‑1 (MQ=255) tGAAGTGCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAactact > 1:32173/1‑150 (MQ=255) ccggtaaattagccgcgcgcgccggaataaacagcatttctccttccaccaaacgttgctgctttgcttccagcagattgccgtattcgccgcgcagcacgatatccagacggggaaaatcaatacataaactgcccACCCGCAactact < 1:280009‑M1/13‑1 (MQ=255) gAAGTGCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTAGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTg > 2:1463196/1‑150 (MQ=255) gCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGgcg < 2:173147/150‑1 (MQ=255) tagccgcgcgcgccggaataaacagcatttctccttccaccaaacgttgctgctttgcttccagcagattgccgtattcgccgcgcagcacgatatccagacggggaaaatcaatacataaactgcccACCCGCAACTACTGGGGCGCGt < 1:1358872‑M1/22‑1 (MQ=255) gCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGt > 1:917085/1‑150 (MQ=255) ccGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGtt < 1:1628771/150‑1 (MQ=255) cGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGttt > 2:688376/1‑150 (MQ=255) cagcaAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTgc > 2:858792/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) gAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCagccagcc > 2:467954/1‑150 (MQ=255) aaaGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAgcct > 2:419045/1‑150 (MQ=255) aaTTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGTAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGTTCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAgcctgcct < 1:1393073/150‑1 (MQ=255) aTTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTc < 1:486173/150‑1 (MQ=255) tttCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCg < 1:36022/150‑1 (MQ=255) 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aTTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACgg < 2:204792/147‑1 (MQ=255) cGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATctgct < 1:858792/150‑1 (MQ=255) gCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATctgctg < 1:1380067/150‑1 (MQ=255) gATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGaa < 1:431763/150‑1 (MQ=255) gATCTGTTCAGCGGCCCGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGaa > 2:1653143/1‑150 (MQ=255) cTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGaagca < 2:370775/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGaagcaaa > 2:561653/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGaagcaaa > 2:1460483/1‑150 (MQ=255) tCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGaagcaaagc < 1:1585034/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGaagcaaagca < 1:805449/150‑1 (MQ=255) cGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGAAGCAAAgcagca < 1:688376/150‑1 (MQ=255) ggTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGAAGCAAAGCAGCAACGttt > 1:554178/1‑150 (MQ=255) ggTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGAAGCAAAGCAGCAACGttt > 2:1286808/1‑150 (MQ=255) ggTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGAAGCAAAGCAGCAACGttt > 1:1638901/1‑150 (MQ=255) tGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGAAGCAAAGCAGCAACGTTtgg > 1:331486/1‑150 (MQ=255) 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AGATCTGGATTTTGAAGTGCCGGTCAGCCGCAGCAAAGTGAAAGAATTTCGCCAGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCTGCGCGGCGAATACGGCAATCTGCTGGAAGCAAAGCAGCAACGTTTGGTGGAA > NC_000913/2501048‑2501345 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |