New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 2553451 | 85 (0.890) | 5 (0.050) | 5/268 | NT | 5.7% | coding (227/900 nt) | hemF | coproporphyrinogen III oxidase |
? | NC_000913 | = 2553492 | 82 (0.880) | coding (268/900 nt) | hemF | coproporphyrinogen III oxidase |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CGATGGCGCAGAATTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTG > NC_000913/2553302‑2553600 | cGATGGCGCAGAATTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGC < 1:101016‑M1/150‑1 (MQ=255) cGATGGCGCAGAATTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGC < 1:1614227‑M1/150‑1 (MQ=255) cGATGGCGCAGAATTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGC < 1:1154866‑M1/150‑1 (MQ=255) cgcAGAATTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCg > 2:614026/1‑150 (MQ=255) gAATTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGGGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCg < 1:11551/150‑1 (MQ=255) aaTTTGTCGAAGATAGGTGGCAGTGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCgg < 2:1071104/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGa < 1:757988/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGa > 1:1637559/1‑150 (MQ=255) ttGTCAAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAAc < 2:378583/150‑1 (MQ=255) tGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACt > 1:827550/1‑150 (MQ=255) gTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACtt > 1:1154820/1‑150 (MQ=255) gTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACtt > 2:1003210/1‑150 (MQ=255) gTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACtt > 1:908858/1‑150 (MQ=255) 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cTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCg < 2:176757/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGt > 1:296829/1‑150 (MQ=255) tCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTc < 1:797995/150‑1 (MQ=255) tCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTc > 1:1629027/1‑150 (MQ=255) gCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGTGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCtgg > 1:1103489/1‑150 (MQ=255) gCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCtgg > 1:840373/1‑150 (MQ=255) gCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCtgg > 1:1342242/1‑150 (MQ=255) gCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCtgg > 2:1559282/1‑150 (MQ=255) gCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCtgg < 2:827550/150‑1 (MQ=255) cACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCtggtg < 2:1208968/150‑1 (MQ=255) aCCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGgcggtggcggaagcaggcatcgcctcaccgtggacatgcgaaaagttgacgcctgcctgttcgaaaacaccaccattacgcaacacccgac < 1:944385‑M2/137‑92 (MQ=255) ccGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGgcggtggcggaagcaggcatcgcctcaccgtggacatgcgaaaagttgacgcctgcctgttcgaaaacaccaccattacgcaacacccgactacgcccgccgccg < 1:1037383‑M2/150‑106 (MQ=255) cGCccatcgcctcgaaactgcgcccggcaagttccgggcgatgagcggtggcggaagcaggcatcgcctcaccgtggacatgcgaaaagttgacgcctgcctgttcgaaaacaccaccattacgcaacacccgactacgcccgccgccgc > 2:1637559‑M1/1‑3 (MQ=255) cGCccatcgcctcgaaactgcgcccggcaagttccgggcgatgagcggtggcggaagcaggcatcgcctcaccgtggacatgcgaaaagttgacgcctgcctgttcgaaaacaccaccattacgcaacacccgactacgcccgccgccgc > 1:574832‑M1/1‑3 (MQ=255) gCccatcgcctcgaaactgcgcccggcaagttccgggcgatgagcggtggcggaagcaggcatcgcctcaccgtggacatgcgaaaagttgacgcctgcctgttcgaaaacaccaccattacgcaacacccgactacgcccgccgccgcc < 2:574832‑M1/150‑149 (MQ=255) gCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGgcggtggcggacgcaggcatcgcctcaccgtggacatgcgaaaggttgacgcctgcctgttcgaaaacaccaccattacgcaacccccgactacgcccgccgccgcc < 1:858330‑M2/150‑108 (MQ=255) cTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTg < 1:750592/150‑1 (MQ=255) | CGATGGCGCAGAATTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTG > NC_000913/2553302‑2553600 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |