| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 2805389 = | 71 (0.750) | 5 (0.050) | 4/262 | NT | 6.7% | coding (575/1203 nt) | proV | glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV |
| ? | NC_000913 | 2805422 = | 72 (0.790) | coding (608/1203 nt) | proV | glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV | |||||
GAAAAAGCCCTTGATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCATTATGCAAAATGGT > NC_000913/2805241‑2805537 | taaaaaGCCCTTGATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTtc < 1:527146/149‑1 (MQ=255)gAAAAAGCCCTTGATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTtc > 1:306707/1‑150 (MQ=255)atttcatccggtgtgccgacctgtaccacttcaccattttgcataatggcaattcggtcgccaatacgcatggcttcatcaagatcgtgggaaataaagacaatggtgcgctgatgtttcgcctgtaattttaccagctcatcctgcatc > 1:1427825‑M1/149‑150 (MQ=255) catccggtgtgccgacctgtaccacttcaccattttgcataatggcaattcggtcgccaatacgcatggcttcatcaagatcgtgggaaataaagacaatggtgcgctgatgtttcgcctgtaattttaccagctcatcctgcaTCTCgg > 1:1498704‑M1/145‑150 (MQ=255) aaGCCCTTGATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCgg < 2:71938/150‑1 (MQ=255) aaGCCCTTGATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCgg > 2:1085065/1‑150 (MQ=255) aaGCCCTTGATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCgg < 1:1408147/150‑1 (MQ=255) cccTTGATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCACACAGCTACCCGGATGAAGTATCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGgcgc > 2:1463345/1‑150 (MQ=255) ccTTGATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCt > 2:1108527/1‑150 (MQ=255) cTTGATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTc > 1:1027191/1‑150 (MQ=255) aCTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCAtt > 2:784104/1‑150 (MQ=255) gTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTc < 2:1523909/150‑1 (MQ=255) gTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTc < 1:498258/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |