| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2865050 = | 97 (1.020) | 8 (0.090) | 7/260 | NT | 8.0% | intergenic (+38/‑51) | ygbM/ygbN | putative 2‑oxo‑tetronate isomerase YgbM/putative transporter YgbN |
| ? | NC_000913 | 2865068 = | 91 (1.010) | intergenic (+56/‑33) | ygbM/ygbN | putative 2‑oxo‑tetronate isomerase YgbM/putative transporter YgbN | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GGCTGTTCCGCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTACAACCATTCGTTGCTTTGCTC > NC_000913/2864903‑2865199 | taacaggctgacgaggagcaaagcaacgaatggttgtacctttgccttgatgaccagcagcaacagcatgattacgccagctaacgcaatgcataacaatgtaattgtggacatgggaaaccctgtctgaaagttatagttaacctaccc > 2:1016387‑M1/148‑150 (MQ=255)taacaggctgacgaggagcaaagcaacgaatggttgtacctttgccttgatgaccagcagcaacagcatgattacgccagctaacgcaatgcataacaatgtaattgtggacatgggaaaccctgtctgaaagttatagttaacctaccc > 2:159558‑M1/148‑150 (MQ=255)taacaggctgacgaggagcaaagcaacgaatggttgtacctttgccttgatgaccagcagcaacagcatgattacgccagctaacgcaatgcataacaatgtaattgtggacatgggaaaccctgtctgaaagttatagttaacctaccc < 2:284696‑M1/3‑1 (MQ=255) aacaggctgacgaggagcaaagcaacgaatggttgtacctttgccttgatgaccagcagcaacagcatgattacgccagctaacgcaatgcataacaatgtaattgtggacatgggaaaccctgtctgaaagttatagttaacctacccc < 1:546898‑M1/4‑1 (MQ=255) aacaggctgacgaggagcaaagcaacgaatggttgtacctttgccttgatgaccagcagcaacagcatgattacgccagctaacgcaatgcataacaatgtaattgtggacatgggaaaccctgtctgaaagttatagttaacctacccc > 1:1188125‑M1/147‑150 (MQ=255) tGTTCCGCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCAt > 2:919950/1‑150 (MQ=255) gTTCCGCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATc < 2:299564/150‑1 (MQ=255) gTTCCGCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATc < 2:71412/150‑1 (MQ=255) tCCGCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTa > 2:1550647/1‑150 (MQ=255) gCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACgg < 2:391047/150‑1 (MQ=255) tGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATg > 1:226130/1‑150 (MQ=255) gTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATgg > 2:823661/1‑150 (MQ=255) tCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCAGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATgggg < 1:773132/150‑1 (MQ=255) gcaaagcaacgaatggttgtacctttgccttgatgaccagcagcaacagcatgattacgccagctaacgcaatgcataacaatgtaattgtggacatgggaaaccctgtctgaaagttatagttaacctaCCCCATCTACGGATGGGGTa > 2:1348363‑M1/131‑150 (MQ=255) tGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAgg < 1:856611/150‑1 (MQ=255) aaagcaacgaatggttgtacctttgccttgatgaccagcagcaacagcatgattacgccagctaacgcaatgcataacaatgtaattgtggacatgggaaaccctgtctgaaagttatagttaacctaCCCCATCTACGGATGGGGTAgg > 2:524651‑M1/129‑150 (MQ=255) gggATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACt > 2:378723/1‑150 (MQ=255) gATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACtat < 2:441214/150‑1 (MQ=255) atatCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACtata > 2:434671/1‑150 (MQ=255) tatCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATaa > 2:1145996/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACt > 2:1258206/1‑150 (MQ=255) aGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACttt < 1:769822/150‑1 (MQ=255) ggCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCa < 1:1258206/150‑1 (MQ=255) ggATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACa > 1:900251/1‑150 (MQ=255) tCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAggg < 2:486713/150‑1 (MQ=255) ggTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGtt > 1:744361/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGtt > 1:530459/1‑150 (MQ=255) ccttgatgaccagcagcaacagcatgattacgccagctaacgcaatgcataacaatgtaattgtggacatgggaaaccctgtctgaaagttatagttaacctaCCCCATCTACGGATGGGGTAgg > 1:1054537‑M1/104‑125 (MQ=255) gtgAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTccc < 2:864085/150‑1 (MQ=255) gtgAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTccc < 1:732494/150‑1 (MQ=255) gtgAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTccc < 2:1377071/150‑1 (MQ=255) tgAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCa < 2:1214108/150‑1 (MQ=255) gAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCAt > 2:344283/1‑150 (MQ=255) tataAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTc > 2:852529/1‑150 (MQ=255) tataAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTc < 1:838/150‑1 (MQ=255) ataAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTcc < 1:1145996/150‑1 (MQ=255) taAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCca > 1:1049726/1‑150 (MQ=255) aaaCCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCcac > 2:1341031/1‑150 (MQ=255) aCCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACt > 2:1528674/1‑123 (MQ=255) aCCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACt < 1:1528674/123‑1 (MQ=255) aCCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACaa > 1:920629/1‑150 (MQ=255) gcaacagcatgattacgccagctaacgcaatgcataacaatgtaattgtggacatgggaaaccctgtcttaaagttatagttaacctaCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAAt < 1:697028‑M1/62‑1 (MQ=255) ccTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAAt < 1:1267508/150‑1 (MQ=255) cTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAAtt < 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cTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGtt > 2:515484/1‑150 (MQ=255) gattacgccagctaacgcaatgcataacaatgtaattgtggacatgggaaaccctgtcttaaagttatagttaacctaCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTa > 2:697028‑M1/79‑150 (MQ=255) cACCTAAGAATGGCTTGTCTGGTTTGACGCCTGGCTCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTAt < 1:723063/150‑1 (MQ=255) cACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTAt > 2:444718/1‑150 (MQ=255) gaagaaGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCAt > 2:685605/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) tAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTgctgct < 1:309471/150‑1 (MQ=255) tAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTgctgct < 2:1427459/150‑1 (MQ=255) tAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTgctgct > 1:924018/1‑150 (MQ=255) tAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTgctgct > 1:634468/1‑150 (MQ=255) aTTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTgg < 2:688229/150‑1 (MQ=255) 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ccATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTACAACCATTCGt < 1:444718/150‑1 (MQ=255) ccATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTACAACCATGCGt > 2:1028822/1‑150 (MQ=255) cATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTACAACCATTCGtt > 2:286386/1‑150 (MQ=255) tACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTACAACCATTCGttgc > 2:1409084/1‑150 (MQ=255) cATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTACAACCATTCGttgctt < 1:1550647/150‑1 (MQ=255) 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GGCTGTTCCGCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTACAACCATTCGTTGCTTTGCTC > NC_000913/2864903‑2865199 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |