| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3128352 = | 101 (1.060) | 6 (0.070) | 5/256 | NT | 6.0% | coding (81/765 nt) | glcC | DNA‑binding transcriptional dual regulator GlcC |
| ? | NC_000913 | 3128432 = | 95 (1.070) | coding (161/765 nt) | glcC | DNA‑binding transcriptional dual regulator GlcC | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
ACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCGTGTCGCACGGCTTAATCGGGT > NC_000913/3128205‑3128501 | aagTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAggtcgg < 1:1654226/148‑1 (MQ=255) gcgcgaacgtcgagcagatcgtacagcgttcgcggctgcgtactgaacagatggatcagcgggctggtgtcctgcacccgattaagccgtgcgacacgagaatcgcgaccctgcgccgtttcaataatcccgcgcccgcgcagcaCGGTc < 2:1226807‑M1/5‑1 (MQ=255) gTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAggtcggtc > 2:1289572/1‑150 (MQ=255) cgaacgtcgagcagatcgtacagcgttcgcggctgcgtactgaacagatggatcagcgggctggtgtcctgcacccgattaagccgtgcgacacgagaatcgcgaccctgcgccgtttcaataatcccgcgcccgcgcagcaCGGTCAGc > 1:243730‑M1/143‑150 (MQ=255) tgCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGc > 1:470337/1‑150 (MQ=255) gCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCt < 2:1116316/150‑1 (MQ=255) tttGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTc > 1:881254/1‑150 (MQ=255) tttGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTc < 2:22373/150‑1 (MQ=255) ttGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCg > 2:1306041/1‑150 (MQ=255) tGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCgg < 1:258916/150‑1 (MQ=255) cGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGaa < 1:1615834/150‑1 (MQ=255) cGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGACCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAAGTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCCGCCGCTTCCCTCggca > 2:1635701/1‑148 (MQ=255) gAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAAc < 1:1273445/150‑1 (MQ=255) 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tATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCg < 1:1266660/150‑1 (MQ=255) tATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCg < 1:1653834/150‑1 (MQ=255) aTCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCgt < 1:730426/150‑1 (MQ=255) tCGACGGCGTACTGAAGGGCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGGCGCGATTCTCgtg < 1:1621769/150‑1 (MQ=255) cGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCgtgt < 1:1289572/150‑1 (MQ=255) 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gCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCGTGTCGCAc > 2:8010/1‑150 (MQ=255) gCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCGTGTCGCAc < 1:319278/150‑1 (MQ=255) cGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCGTGTCGCACg < 1:1044062/150‑1 (MQ=255) aCTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCGTGTCGCACGGCt > 2:16288/1‑150 (MQ=255) aCTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCGTGTCGCACGGCt > 2:974045/1‑150 (MQ=255) ggtcggtcAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCGTGTCGCACGGCTTAATCg > 1:1024732/1‑150 (MQ=255) tcggtcAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCGTGTCGCACGGCTTAATCggg < 2:73257/150‑1 (MQ=255) | ACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAAGGGCTGACCGTGCTGCGCGGGCGCGGGATTATTGAAACGGCGCAGGGTCGCGATTCTCGTGTCGCACGGCTTAATCGGGT > NC_000913/3128205‑3128501 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |