New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 3291101 = | 91 (0.960) | 5 (0.060) | 5/258 | NT | 5.6% | coding (2288/2517 nt) | yraJ | putative fimbrial usher protein YraJ |
? | NC_000913 | 3291119 = | 82 (0.920) | coding (2306/2517 nt) | yraJ | putative fimbrial usher protein YraJ |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
AAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATAACGTCGATCTTGAACAAACAACACAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTACGCTGGGGAAATCAGGCAGATC > NC_000913/3290952‑3291250 | agcaaactgacattgttgatctgcctgatttccccagcgtacagtccagctttgtgatttactcgatatcccagagagatatagtatgccgccctcatcgacgatactttgttgccccgtatcatcgttgctggcaagagcgccaaaggg > 1:1538267‑M1/150‑150 (MQ=255) agcaaactgacattgttgatctgcctgatttccccagcgtacagtccagctttgtgatttactcgatatcccagagagatatagtatgccgccctcatcgacgatactttgttgccccgtatcatcgttgctggcaagagcgccaaaggg > 2:255778‑M1/150‑150 (MQ=255) agcaaactgacattgttgatctgcctgatttccccagcgtacagtccagctttgtgatttactcgatatcccagagagatatagtatgccgccctcatcgacgatactttgttgccccgtatcatcgttgctggcaagagcgccaaaggg < 2:289812‑M1/1‑1 (MQ=255) 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tAGATACTACGCAGCTGCCCGATAACGTCGATCTTGAACAAACAACACAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGt > 2:32045/1‑150 (MQ=255) aTACTACGCAGCTGCCCGATAACGTCGATCTTGAACAAACAACACAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGc < 1:1525833/150‑1 (MQ=255) tactacGCAGCTGCCCGATAACGTCGATCTTGAACAAACAACACAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGcc < 2:320736/150‑1 (MQ=255) tctgcctgatttccccagcgtacagtccagctttgtgatttactcgatatcccagagagatatagtatgccgccctcatcgacgatactttgttgccccgtatcatcgttgctggcaagagcgccaaaggGCAACGGTAAACCGTTGccc > 1:1214688‑M1/131‑150 (MQ=255) ctacGCAGCTGCCCGATAACGTCGATCTTGAACAAACAACACAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCt > 1:270990/1‑150 (MQ=255) tacGCAGCTGCCCGATAACGTCGATCTTGAACAAACAACACAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCCTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACCGTAAACCCTTGCCCtt > 1:720095/1‑150 (MQ=255) cGCAGCTGCCCGATAACGTCGATCTTGAACAAACAACACAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTTTACCGTTGcgatcgc < 2:1411179/150‑7 (MQ=255) cGCAGCTGCCCGATAACGTCGATCTTGAACAAACAACACAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTTTACCGTTGcgatcgc < 1:964096/150‑7 (MQ=255) gCAGCTGCCCGATAACGTCGATCTTGAACAAACAACACAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTgg < 2:42623/150‑1 (MQ=255) gCAGCTGCCCGATAACGTCGATCTTGAACAAACAACACAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTgg < 1:1470643/150‑1 (MQ=255) 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tCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGa < 2:1073834/150‑1 (MQ=255) cAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAg > 2:663241/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAg > 2:440467/1‑104 (MQ=255) ccAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCTTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAAt < 2:1555934/150‑1 (MQ=255) ccAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACt < 2:1580259/124‑1 (MQ=255) cAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAAta > 1:1090035/1‑149 (MQ=255) 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cgcgTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACt < 2:1183833/150‑1 (MQ=255) ccgTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTg < 1:1050391/149‑1 (MQ=255) cgTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGt > 2:1461858/1‑150 (MQ=255) gTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTa < 2:495397/150‑1 (MQ=255) tACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACGGTTGCCCTTTGGCGCTTTTGCCATCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATAACAAAGCTGGACTGTACGCTgggg < 2:720095/150‑1 (MQ=255) tACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTACGCTgggg < 1:1172279/150‑1 (MQ=255) aCAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTACGCTGGGGa < 2:340842/150‑1 (MQ=255) gTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTACGCTGGGGAAAt > 1:434552/1‑150 (MQ=255) tCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTACGCTGGGGAAATc < 2:1459082/150‑1 (MQ=255) cGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTACGCTGGGGAAATCAGGc > 1:405620/1‑150 (MQ=255) cGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTACGCTGGGGAAATCAGGCAGAt > 2:904064/1‑150 (MQ=255) GCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTACGCTGGGGAAATCAGGCAGATc < 2:1138811‑M1/150‑1 (MQ=255) GCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTACGCTGGGGAAATCAGGCAGATc < 1:1105024‑M1/150‑1 (MQ=255) GCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTACGCTGGGGAAATCAGGCAGATc > 2:1580213‑M1/1‑150 (MQ=255) GCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTACGCTGGGGAAATCAGGCAGATc < 2:281427‑M1/150‑1 (MQ=255) | AAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATAACGTCGATCTTGAACAAACAACACAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTCAGCGATCGCAACGGTAAACCGTTGCCCTTTGGCGCTCTTGCCAGCAACGATGATACGGGGCAACAAAGTATCGTCGATGAGGGCGGCATACTATATCTCTCTGGGATATCGAGTAAATCACAAAGCTGGACTGTACGCTGGGGAAATCAGGCAGATC > NC_000913/3290952‑3291250 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |