| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 4242538 = | 119 (1.250) | 6 (0.070) | 5/258 | NT | 5.3% | intergenic (‑284/+88) | xylE/malG | D‑xylose:H(+) symporter/maltose ABC transporter membrane subunit MalG |
| ? | NC_000913 | 4242556 = | 102 (1.140) | intergenic (‑302/+70) | xylE/malG | D‑xylose:H(+) symporter/maltose ABC transporter membrane subunit MalG | |||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
CCAAAATTGATAAAAACAATACTATTGCCGTGACTCAGAGCACGAAAGAGAATTATCGTAAGTGGGAAAACAAATAACGTAAAAATAATAAGCTCTATGATGGAAATATTAACCGGCGAACGATTCAGATTGCAGACGAAAGAAAAAAAGGCGCTCCGTGGAGCGCCGAATAACAGTCACAAGTTGGGATAACGTAAGTTGAGGGTGCAGCGGCATAACATTGGCAGAACAACATCTTTAACCTTTCACACCACCTGCCGTCAGGCCGTTGACCAGCCAGCGTTGAGCCAGCAAGAAGA > NC_000913/4242389‑4242687 | ccAAAATTGATAAAAACAATACTATTGCCGTGACTCAGAGCACGAAAGAGAATTATCGTAAGTGGGAAAACAAATAACGTAAAAATAATAAGCTCTATGATGGAAATATTAACCGGCGAACGATTCAGATTGCAGACGAAAGAAAAAAAg > 1:1072789/1‑150 (MQ=255)ccAAAATTGATAAAAACAATACTATTGCCGTGACTCAGAGCACGAAAGAGAATTATCGTAAGTGGGAAAACAAATAACGTAAAAATAATAAGCTCTATGATGGAAATATTAACCGGCGAACGATTCAGATTGCAGACGAAAGAAAAAAAg < 2:473663/150‑1 (MQ=255)ccAAAATTGATAAAAACAATACTATTGCCGTGACTCAGAGCACGAAAGAGAATTATCGTAAGTGGGAAAACAAATAACGTAAAAATAATAAGCTCTATGATGGAAATATTAACCGGCGAACGATTCAGATTGCAGACGAAAGAAAAAAAg > 2:641930/1‑150 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CCAAAATTGATAAAAACAATACTATTGCCGTGACTCAGAGCACGAAAGAGAATTATCGTAAGTGGGAAAACAAATAACGTAAAAATAATAAGCTCTATGATGGAAATATTAACCGGCGAACGATTCAGATTGCAGACGAAAGAAAAAAAGGCGCTCCGTGGAGCGCCGAATAACAGTCACAAGTTGGGATAACGTAAGTTGAGGGTGCAGCGGCATAACATTGGCAGAACAACATCTTTAACCTTTCACACCACCTGCCGTCAGGCCGTTGACCAGCCAGCGTTGAGCCAGCAAGAAGA > NC_000913/4242389‑4242687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |