New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 370078 = | 85 (0.890) | 5 (0.050) | 5/262 | NT | 6.3% | coding (1468/1665 nt) | mhpA | putative 3‑(3‑hydroxyphenyl)propanoate/3‑hydroxycinnamate hydroxylase |
? | NC_000913 | 370113 = | 67 (0.740) | coding (1503/1665 nt) | mhpA | putative 3‑(3‑hydroxyphenyl)propanoate/3‑hydroxycinnamate hydroxylase |
TGTGGGGGATGAGCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCG > NC_000913/369965‑370261 | tgtgGGGGATGAGCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCt > 1:886282/1‑150 (MQ=255) tgtgGGGGATGAGCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCt < 1:904033/150‑1 (MQ=255) tcaccgacgccagtttattcagggtcttgcccagggtttgcggaatggcggtggcggcaacaaagcgatccgggcgcatcaccaccagcgaagcattgtgttgcgcgaaccagCTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCt > 1:446675‑M1/114‑150 (MQ=255) gtgGGGGATGAGCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTg > 1:1195126/1‑150 (MQ=255) caccgacgccagtttattcagggtcttgcccagggtttgcggaatggcggtggcggcaacaaagcgatccgggcgcatcaccaccagcgaagcattgtgttgcgcgaaccagCTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTg > 1:1012452‑M1/113‑150 (MQ=255) tgGGGGATGAGCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTgg < 2:1435756/150‑1 (MQ=255) accgacgccagtttattcagggtcttgcccagggtttgcggaatggcggtggcggcaacaaagcgatccgggcgcatcaccaccagcgaagcattgtgttgcgcgaaccagCTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTgg > 2:440290‑M1/112‑150 (MQ=255) gggggATGAGCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGt > 2:990318/1‑150 (MQ=255) tGAGCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCgcgc < 1:298830/150‑1 (MQ=255) gAGCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCa < 1:1235180/150‑1 (MQ=255) agtttattcagggtcttgcccagggtttgcggaatggcggtggcggcaacaaagcgatccgggcgcatcaccaccagcgaagcattgtgttgcgcgaaccagCTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTcgc < 2:994370‑M1/44‑1 (MQ=255) agtttattcagggtcttgcccagggtttgcggaatggcggtggcggcaacaaagcgatccgggcgcatcaccaccagcgaagcattgtgttgcgcgaaccagCTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTcgc > 1:994370‑M1/103‑146 (MQ=255) aGCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCaa > 2:1139446/1‑150 (MQ=255) gCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAac < 1:600169/150‑1 (MQ=255) gCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAac < 1:83996/150‑1 (MQ=255) gCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGGTGGGCACACGCTGCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAac < 1:1171527/150‑1 (MQ=255) gacgaGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAacac < 2:1363202/150‑1 (MQ=255) cgaGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACaa > 2:516458/1‑150 (MQ=255) 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agTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCtggtgg < 1:822425/150‑1 (MQ=255) gTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTggtggt > 1:1384154/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGa > 2:488859/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGa > 1:872403/1‑150 (MQ=255) gcgcgcGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGAt < 1:1327847/150‑1 (MQ=255) cgcgcgTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATg < 2:236997/150‑1 (MQ=255) cgTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGcc > 1:870027/1‑150 (MQ=255) ggCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGAt < 1:1139446/150‑1 (MQ=255) gCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATc > 2:1273951/1‑150 (MQ=255) cacaCGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCg < 1:1330420/150‑1 (MQ=255) cacaCGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCg > 2:619939/1‑150 (MQ=255) acacGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGc < 2:1181911/150‑1 (MQ=255) cacGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCt < 1:1294876/150‑1 (MQ=255) tcattcaGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTttgttg > 2:338331/1‑150 (MQ=255) ttcaGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTgccg < 1:558739/150‑1 (MQ=255) ttcaGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTgccg < 2:1412127/150‑1 (MQ=255) tcaGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTGATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTgccgc < 2:1349539/150‑1 (MQ=255) tcaGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTgccgc > 2:779684/1‑150 (MQ=255) caGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTgccgcc > 2:899229/1‑150 (MQ=255) caGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTgccgcc > 1:202141/1‑150 (MQ=255) 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agctacgcaggcgaccttgcgtatcgcccacgcgtagCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGtga > 1:446675‑M2/38‑150 (MQ=255) TACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGtgatga > 2:357569‑M1/1‑150 (MQ=255) ACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGAc > 2:797884‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGc > 2:870027‑M1/1‑150 (MQ=255) CGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCt < 1:38374‑M1/150‑1 (MQ=255) gggCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGAc < 2:520472/150‑1 (MQ=255) ggCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCTAGCAACACAATGCATCGCTGGTGGTGATGCCCCCGCATCGCTTTGTTGCCGCCAACGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGCCCCTGAATAAACTGGCGTCCCTGATGACGCTGccc > 2:701694/1‑150 (MQ=255) gCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGAccc > 1:527200/1‑150 (MQ=255) gATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGc < 2:38374/150‑1 (MQ=255) cGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTg > 2:1081812/1‑150 (MQ=255) cGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTg > 1:173180/1‑150 (MQ=255) aGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGc < 2:974419/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGcc < 2:1384154/150‑1 (MQ=255) tGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTgg < 1:934320/111‑1 (MQ=255) tGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTgg > 2:934320/1‑111 (MQ=255) gcgtagCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTc > 2:120761‑M2/7‑150 (MQ=255) gcgtagCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTc < 1:39824‑M2/144‑1 (MQ=255) cgcagCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCt > 2:338211‑M2/6‑150 (MQ=255) gtagCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTg < 1:1118495‑M2/146‑1 (MQ=255) gtagCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCCGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTg > 1:66186‑M2/5‑150 (MQ=255) gCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACGCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCg < 2:1207902‑M2/149‑1 (MQ=255) | TGTGGGGGATGAGCGACGAGCAAATCCAGCAGTGGCGCGCGTTGGGCACACGCTTCATTCAGGTGGTGCCGGAAGTGCAAATTCATACCGCACAGGATAACCACGACGGCGTACTACGCGTGGGCGATACGCAAGGTCGCCTGCGTAGCTGGTTCGCGCAACACAATGCTTCGCTGGTGGTGATGCGCCCGGATCGCTTTGTTGCCGCCACCGCCATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCG > NC_000913/369965‑370261 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |