New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 3556611 | 82 (0.920) | coding (239/1017 nt) | rtcA | RNA 3'‑terminal phosphate cyclase |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CCGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACAACTTCCGGCGCTACCGATAGCAAAGCGGTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGTGATGGTAAATGGCTG > NC_000913/3556465‑3556759 | ccGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACAACTTCCGGCGCTACCGATAGCAAAGCGGTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGgcc < 1:289131‑M2/150‑4 (MQ=255) cGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACAACTTCCGGCGCTACCGATAGCAAAGCGGTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGgccg > 1:295128‑M2/1‑146 (MQ=255) gggTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACAACTTCCGGCGCTACCGATAGCAAAGCGGTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGgccggaag > 2:1173205‑M2/1‑142 (MQ=255) 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aTCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACAACTTCCGGCGCTACCGATAGCAAAGCGGTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAg < 2:604670/150‑1 (MQ=255) tggagccgctgctCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACAACTTCCGGCGCTACCGATAGCAAAGCGGTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGAc < 2:180722‑M2/137‑1 (MQ=255) ggTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACAACTTCCGGCGCTACCGATAGCAAAGCGGTAATCGCCGCCGCGCCCGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGCCg > 2:1638342/1‑150 (MQ=255) gccgccGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACAACTTCCGGCGCTACCGATAGCAAAGCGGTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTg < 2:691721/150‑1 (MQ=255) cgccgcTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACAACTTCCGGCGCTACCGATAGCAAAGCGGTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCg > 1:902552/1‑150 (MQ=255) 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gCAAAGCGGTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTcgcccgc > 2:1038089/1‑150 (MQ=255) aaGCGGTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGcccgcccg > 2:1382500/1‑150 (MQ=255) gCGGTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGc > 2:227760/1‑150 (MQ=255) ggTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCAc < 1:743007/150‑1 (MQ=255) gTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACg < 1:1100754/150‑1 (MQ=255) tCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATg > 1:1198627/1‑150 (MQ=255) gccgcGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGt < 1:1273776/150‑1 (MQ=255) gcgcACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGTGAt < 1:278374/150‑1 (MQ=255) gcACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGGTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGTGATgg < 2:291289/150‑1 (MQ=255) cACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGTGATGGt < 2:197942/150‑1 (MQ=255) cACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGTGATGGt < 1:644302/150‑1 (MQ=255) aCGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGTGATGGTa < 2:52448/150‑1 (MQ=255) aCGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGTGATGGTa < 1:1038089/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGTGATGGTaa > 1:595951/1‑150 (MQ=255) ggccgggccggAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCTCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGTTATGGTAAAtg < 2:117890/149‑1 (MQ=255) cgggccggAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGTGATGGTAAAtggct < 2:756784/150‑1 (MQ=255) gggccggAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGTGATGGTAAAtggctg < 2:1154397/150‑1 (MQ=255) | CCGACGGGTTATCGGTGCCGCCGCTCACTTCAACACGCGAAGGTCCATCGGCAAACCACAGCGCGGGCAGCACCGTTTGCAGCACCAGCGTACAACTTCCGGCGCTACCGATAGCAAAGCGGTAATCGCCGCCGCGCACGGTGCCGGGCCGGAAGAGCAGACGCTGCGACCCCAGCTCCGCGCCTTCCACGGTTGCTCCGCAAATTTCCGTCGCCGCCTTTACCGCGGTCAGATGCTGGCGCAACAGCCCCGGTTTCGCCCGCCCGGCACGAATGCTGGTGATGGTAAATGGCTG > NC_000913/3556465‑3556759 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |