| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,405,592 | A→G | 8.2% | M53V (ATG→GTG) | accB → | biotin carboxyl carrier protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,405,592 | 0 | A | G | 8.2% | 282.3 / 12.6 | 97 | M53V (ATG→GTG) | accB | biotin carboxyl carrier protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (46/43); new base G (5/3); total (51/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.18e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
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aGCTTACGCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTAc > 1:1037422/1‑132 (MQ=255) aGCTTACGCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTAc < 2:1037422/132‑1 (MQ=255) aGCTTACGCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAg < 1:1133978/150‑1 (MQ=255) aGCTTACGCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAg > 1:284442/1‑150 (MQ=255) gCTTACGCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGc > 2:870426/1‑150 (MQ=255) ctggctgCTGCATCATTGGTGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGc > 1:1235382/7‑150 (MQ=255) ttACGCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGccc < 1:458290/150‑1 (MQ=255) ttACGCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGccc < 1:448155/150‑1 (MQ=255) tACGCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCGCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCg < 2:1119997/150‑1 (MQ=255) tACGCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCg < 2:479120/150‑1 (MQ=255) tACGCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCg < 1:162353/150‑1 (MQ=255) ctgCTGCATCATTGGTGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCgg > 2:920542/3‑150 (MQ=255) ctgCTGCATCATTGGTGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCgg > 1:1545060/3‑150 (MQ=255) ctgCTGCATCATTGGTGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCgg > 1:309072/3‑150 (MQ=255) ctgCTGCATCATTGGTGCAGCAGCCAGCGCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAAGCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCCCCCCAAGCCCgg > 1:247043/3‑150 (MQ=255) gCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACATTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCGGAc < 1:1301483/150‑1 (MQ=255) gCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACATTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCGGAc < 1:1295399/150‑1 (MQ=255) gCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCGGACGCa < 1:870426/150‑1 (MQ=255) tgatgCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCGGACGCAAAAGCGt < 2:1610500/150‑1 (MQ=255) gatgCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCGGACGCAAAAGCGtt < 2:1592403/150‑1 (MQ=255) gatgCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCGGACGCAAAAGCGtt < 2:203249/150‑1 (MQ=255) | TTCGTAAGATTAAAAAACTGATCGAGCTGGTTGAAGAATCAGGCATCTCCGAACTGGAAATTTCTGAAGGCGAAGAGTCAGTACGCATTAGCCGTGCAGCTCCTGCCGCAAGTTTCCCTGTGATGCAACAAGCTTACGCTGCACCAATGATGCAGCAGCCAGCTCAATCTAACGCAGCCGCTCCGGCGACCGTTCCTTCCATGGAAGCGCCAGCAGCAGCGGAAATCAGTGGTCACATCGTACGTTCCCCGATGGTTGGTACTTTCTACCGCACCCCAAGCCCGGACGCAAAAGCGTT > NC_000913/3405443‑3405740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |