| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,437,911 | T→A | 6.2% | intergenic (+17/‑113) | trkA → / → mscL | NAD‑binding component of Trk potassium transporters/large conductance mechanosensitive channel |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,437,911 | 0 | T | A | 6.2% | 362.1 / 9.7 | 113 | intergenic (+17/‑113) | trkA/mscL | NAD‑binding component of Trk potassium transporters/large conductance mechanosensitive channel |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (55/51); new base A (3/4); total (58/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGAT > NC_000913/3437763‑3438058 | ggAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATg < 2:568097/150‑1 (MQ=255) cgacgTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTAACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGcc > 1:730250/1‑150 (MQ=255) gacgTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCt < 2:743859/150‑1 (MQ=255) acgTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCtt < 1:1110140/150‑1 (MQ=255) cgTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCAGGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCATTAGACGCCtta < 2:61832/150‑1 (MQ=255) gTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCttat > 1:1205518/1‑150 (MQ=255) tgatTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTattatt < 1:864609/150‑1 (MQ=255) tGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCttattaggatcg > 1:63321/1‑144 (MQ=255) tGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTccc > 2:639453/1‑150 (MQ=255) tGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTccc < 1:1367602/150‑1 (MQ=255) ccAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCtt < 2:626817/150‑1 (MQ=255) ccAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTATCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCtt < 1:1547523/150‑1 (MQ=255) cAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCttt > 2:1513575/1‑150 (MQ=255) aaTGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTg < 1:1218160/150‑1 (MQ=255) tGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGAt < 1:736082/150‑1 (MQ=255) aaTCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATc < 2:61846/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCaa < 2:278341/150‑1 (MQ=255) tGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAgg > 1:402881/1‑150 (MQ=255) gcgcATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGa > 1:822073/1‑150 (MQ=255) tGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGattaatt < 1:1480342/150‑1 (MQ=255) tGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGattaatt < 2:922438/150‑1 (MQ=255) gAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGattaatta > 2:179759/1‑150 (MQ=255) gAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGattaatta > 2:1467625/1‑150 (MQ=255) gAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGattaatta < 1:393130/150‑1 (MQ=255) aGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTATAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGAttaattaa > 2:372949/1‑150 (MQ=255) gCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTaaa > 1:42604/1‑150 (MQ=255) gCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTaaa < 2:1560291/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTaaa > 2:46978/1‑150 (MQ=255) cAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTGATTAAat < 2:821742/150‑1 (MQ=255) aaGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCttatta > 2:1413212/1‑118 (MQ=255) aaGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCttatta < 1:1413212/118‑1 (MQ=255) aaGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAatt < 1:1026182/150‑1 (MQ=255) aaGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAatt > 1:227793/1‑150 (MQ=255) aGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAattc < 1:157321/150‑1 (MQ=255) aCGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTgg < 1:179759/150‑1 (MQ=255) cGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGc < 1:1602437/150‑1 (MQ=255) cGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGc > 1:569291/1‑150 (MQ=255) cGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGc < 2:1049027/150‑1 (MQ=255) gTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCa > 2:1046024/1‑150 (MQ=255) gTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCa < 2:1043257/150‑1 (MQ=255) tAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCATCCAAGCACTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAg < 1:1110709/150‑1 (MQ=255) tAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAg < 2:822073/150‑1 (MQ=255) aTGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAat < 2:1493696/132‑1 (MQ=255) aTGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGaaaa > 1:1133785/1‑150 (MQ=255) aTGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGaaaa < 2:1661456/150‑1 (MQ=255) gTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATg < 2:428040/150‑1 (MQ=255) gTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATg > 2:229324/1‑150 (MQ=255) tCCTCACAGATAAAAATTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGc < 1:1176341/150‑1 (MQ=255) tCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGc < 1:1467625/150‑1 (MQ=255) tCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGc < 1:179427/150‑1 (MQ=255) acaGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAAc < 2:1133785/150‑1 (MQ=255) gATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACAtt > 1:1316572/1‑150 (MQ=255) aTAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACAttt > 1:235432/1‑150 (MQ=255) aTAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACAttt > 2:1075238/1‑150 (MQ=255) tAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTg < 1:1589476/150‑1 (MQ=255) aaaaaGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGt > 2:355411/1‑150 (MQ=255) ttattaCCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTACTGGCAGGAAAATGGATTAACATTTGTTAGACtt > 1:541198/1‑150 (MQ=255) ttaCCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATg < 1:1148719/150‑1 (MQ=255) taCCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATgg > 1:1124806/1‑150 (MQ=255) ccGACGACGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAACGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACAATTGTTAGAATTATGGtt > 2:1587465/1‑150 (MQ=255) cGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTg < 2:235296/150‑1 (MQ=255) gACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGt > 2:1500934/1‑150 (MQ=255) gACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGt > 2:250128/1‑150 (MQ=255) cGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGTTTGTCg > 2:1088874/1‑150 (MQ=255) gTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCgg < 1:250128/150‑1 (MQ=255) tCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGc > 1:6924/1‑150 (MQ=255) tCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGc < 1:95788/150‑1 (MQ=255) gAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCtt > 1:335467/1‑150 (MQ=255) gAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCtt > 2:390063/1‑150 (MQ=255) gAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCtt > 2:587653/1‑150 (MQ=255) gAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCtt > 1:1018176/1‑150 (MQ=255) aaaGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATg < 1:1616994/138‑1 (MQ=255) aaaGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATg > 2:1616994/1‑138 (MQ=255) aCTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAg > 1:18321/1‑150 (MQ=255) tctTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAggg > 1:1546017/1‑150 (MQ=255) tctTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAggg > 2:1164801/1‑150 (MQ=255) aaGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACAt < 1:4334/150‑1 (MQ=255) aGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATg > 2:813515/1‑150 (MQ=255) cccTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAg < 1:1403679/150‑1 (MQ=255) tcttGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCAttatta < 1:1364513/150‑1 (MQ=255) tcttGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCAttatta > 1:593721/1‑150 (MQ=255) cttGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGGAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTaa > 2:1365769/1‑150 (MQ=255) tGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAg > 2:639863/1‑150 (MQ=255) gTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGa < 1:813515/150‑1 (MQ=255) aataaGGCGTCTAATGCCGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTcg > 1:1230197/1‑150 (MQ=255) aataaGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTcg < 1:1046024/150‑1 (MQ=255) ataaGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATTTTTTTCGTCTTCATATGGAGAATAAAATGATAATTATTAAATAAtttata > 1:1480084/1‑147 (MQ=255) ataaGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGaa > 1:1469506/1‑122 (MQ=255) ataaGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGaa < 2:1469506/122‑1 (MQ=255) taaGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTcgcg < 2:1107430/150‑1 (MQ=255) taaGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCatta > 2:1201711/1‑135 (MQ=255) taaGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCatta < 1:1201711/135‑1 (MQ=255) aaGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCAATCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGATGTCGGCTTCATAGTGAGAATAACATGATCATTATTAAAGAATTTCGCGa > 1:1534883/1‑150 (MQ=255) cGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAAttt < 1:229324/150‑1 (MQ=255) gTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTg > 1:1197760/1‑150 (MQ=255) tCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGc < 2:6924/150‑1 (MQ=255) cTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCg < 2:1197760/150‑1 (MQ=255) tAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGa > 1:1177136/1‑150 (MQ=255) aaTGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGAt > 2:770228/1‑150 (MQ=255) aaTGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGAt < 2:1546017/150‑1 (MQ=255) | GGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGAT > NC_000913/3437763‑3438058 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |