| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,569,436 | G→A | 5.5% | H628H (CAC→CAT) | glgX ← | limit dextrin alpha‑1,6‑glucohydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,569,436 | 0 | G | A | 5.5% | 344.6 / 6.1 | 109 | H628H (CAC→CAT) | glgX | limit dextrin alpha‑1,6‑glucohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/55); new base A (4/2); total (52/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATCGATTTAGCCA > NC_000913/3569289‑3569585 | gagcCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAAATAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAAAACACACAATCCGTGTGCATTTACCTGCCAGAAAGACGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTg > 2:97949/3‑150 (MQ=255) cgcCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGc < 2:320926/150‑1 (MQ=255) gcCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCTAATGGGGGAATGGCGTGcc < 2:1398030/150‑1 (MQ=255) ccAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCa > 1:134217/1‑150 (MQ=255) ccAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCa > 2:234807/1‑150 (MQ=255) aTTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑ccc < 1:308184/150‑1 (MQ=255) aTTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAAT‑GGGGAGTGGCACGCCATT‑cccc > 2:601110/1‑150 (MQ=255) ttAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTATTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAGTGGCACGCCATT‑cccc < 1:721771/150‑1 (MQ=255) aaGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCcag > 2:573963/1‑150 (MQ=255) aGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCcagc < 1:991367/150‑1 (MQ=255) gTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCcagca < 1:39384/150‑1 (MQ=255) gATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAgg > 2:104134/1‑150 (MQ=255) aTCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGt < 2:140346/150‑1 (MQ=255) tCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTa < 1:516855/150‑1 (MQ=255) tCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTa > 2:662808/1‑150 (MQ=255) tCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTa > 2:539816/1‑150 (MQ=255) cGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTaa > 2:797616/1‑150 (MQ=255) gTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTaaa > 1:709770/1‑150 (MQ=255) ttcttcTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTaaaa < 1:797616/150‑1 (MQ=255) cttctCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACa < 1:1174049/150‑1 (MQ=255) cttctCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGAAGTTAAAACa > 2:654822/1‑150 (MQ=255) ctctAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCAGTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAAtc > 2:551994/1‑150 (MQ=255) ctctAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAAtc < 1:1559942/150‑1 (MQ=255) tctAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAAtct > 2:1501930/1‑150 (MQ=255) tctAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAAtct < 2:709770/150‑1 (MQ=255) ctAAACTAACCATGACTAACTGCTTTTTTATCATCGCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGAGCGCGGTAATCACTGGGGTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CGCCAGCCGGTAAAACAAtctc > 2:686765/1‑150 (MQ=255) tAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATctct < 2:1554996/150‑1 (MQ=255) aaCTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGt < 2:456404/150‑1 (MQ=255) cTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTa < 2:486674/150‑1 (MQ=255) aCCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCt > 1:1481587/1‑150 (MQ=255) aTGAATAACTCATTTTTTATAATCTATGGAACACACACAATCAGTGTGCAGGTCCCTGCAATAAAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCaa > 2:1226767/1‑150 (MQ=255) tcaCTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAg > 2:221352/3‑150 (MQ=255) tGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAg > 1:1499235/1‑150 (MQ=255) gACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGc > 1:1136854/1‑150 (MQ=255) aCTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCg < 1:1118322/150‑1 (MQ=255) aCTAACTCCTTTTTTATCATCCCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCg > 2:1408442/1‑150 (MQ=255) aCTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGc > 1:293157/1‑150 (MQ=255) cTCGTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCg > 2:87393/1‑150 (MQ=255) ccTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGtt > 1:538270/1‑150 (MQ=255) cTTTTTTATCATCTCTGGAACACACTCAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCGACT‑GCCCATCAGGTTAAACAATCTCTTTTACCTCAAGCGTGGCGTTa < 1:1096282/150‑1 (MQ=255) cTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTa > 1:759122/1‑150 (MQ=255) ttttATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCATGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAAtt < 2:847830/150‑1 (MQ=255) ttttATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTACCTGCCAGACAGCAGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCAAT‑CCCCATCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTTGCTTTAAtt < 1:97949/150‑1 (MQ=255) tttATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTg > 2:1664807/1‑150 (MQ=255) ttATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGc < 1:818939/150‑1 (MQ=255) tATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCa < 1:682858/132‑1 (MQ=255) tATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCa > 2:682858/1‑132 (MQ=255) tATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGAAATCACTGGGTTATCATCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCATGTAAAAAAATCTCTGTTACCTCAAGCCTGCCTTTAATTGCg > 2:779425/1‑150 (MQ=255) catcTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATc < 2:987470/150‑1 (MQ=255) atcTCTTGAACACACACAATCCGTGTTCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTTCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCAAT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCa < 1:654822/150‑1 (MQ=255) atcTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCa > 2:597157/1‑150 (MQ=255) tctcTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCaa > 2:1592244/1‑150 (MQ=255) tGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGAAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAg > 1:952481/1‑150 (MQ=255) ggAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGc < 1:516809/150‑1 (MQ=255) ggAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGc < 2:222692/150‑1 (MQ=255) cacacacaATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATc < 1:1501930/150‑1 (MQ=255) cacaATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATAACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGATACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCgag > 2:1073538/1‑150 (MQ=255) acaATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAATACAATCTCTGTTACTTCTTGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCtaga < 2:865389/150‑1 (MQ=255) caATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGagag < 2:758039/150‑1 (MQ=255) caATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGagag < 1:1622691/150‑1 (MQ=255) tgCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTg > 2:133301/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGc < 1:573963/150‑1 (MQ=255) cAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCa < 2:793615/150‑1 (MQ=255) aGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAg < 1:619151/150‑1 (MQ=255) ccTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGtt > 1:1254982/1‑150 (MQ=255) ccTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGtt > 1:35446/1‑150 (MQ=255) ccTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGtt < 2:757700/150‑1 (MQ=255) ccAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCgg > 2:920955/1‑150 (MQ=255) aGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGt > 1:1666422/1‑82 (MQ=255) aGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGt < 2:1666422/82‑1 (MQ=255) aGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGcc < 1:139307/150‑1 (MQ=255) cGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTg > 1:346216/1‑150 (MQ=255) cGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTg < 2:591243/150‑1 (MQ=255) tAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGcc < 2:1191531/150‑1 (MQ=255) cACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTc > 2:839804/1‑150 (MQ=255) aCTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCa > 2:894664/1‑150 (MQ=255) tGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATc < 1:1480054/150‑1 (MQ=255) gggTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATcc < 1:539816/150‑1 (MQ=255) tATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CACCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGc < 1:1194793/150‑1 (MQ=255) aTCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCTGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCt < 1:1220802/150‑1 (MQ=255) aTCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCt < 1:1226767/150‑1 (MQ=255) aTCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCt < 2:35446/150‑1 (MQ=255) tctcCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTaaa > 2:1096537/1‑150 (MQ=255) ctcCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAg < 2:346216/150‑1 (MQ=255) ctcCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCACGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAg > 1:1352791/1‑150 (MQ=255) aGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTg > 1:560602/1‑150 (MQ=255) cctgctggggAGTGGCACGCCATTCCCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGa > 2:480817/7‑150 (MQ=255) cGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAg < 2:1499235/150‑1 (MQ=255) aaTGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCa < 1:1664807/150‑1 (MQ=255) aTGGGGGAATGGCGTGCCACT‑ACCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGAGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAAATTGAAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATACCTGCTTAAAGGTTGAGCat > 2:385361/1‑150 (MQ=255) tggggAGTGGCACGCCATT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCatat > 2:619480/2‑150 (MQ=255) ggggAGTGGCACGCCATT‑CCCCAGCAGGTAAAACAAGCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCATAAAGCGATCCGAGAGCACAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGGTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCatata > 1:695937/1‑149 (MQ=255) ggggAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATc < 1:1242458/150‑1 (MQ=255) ggggAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATc < 2:134217/150‑1 (MQ=255) gggAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATCg < 2:1453331/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATCGAttt < 1:234807/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATCGATTTAg < 2:759122/150‑1 (MQ=255) gCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATCGATTTAGc < 1:1183111/150‑1 (MQ=255) cGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATCGATTTAGcc < 1:133301/150‑1 (MQ=255) gTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAACGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATCGATTTAGCCa < 2:1484695/150‑1 (MQ=255) | GCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGACTAACTCCTTTTTTATCATCTCTGGAACACACACAATCCGTGTGCAGGTCCCTGCCAGACAGCCGTAATCACTGGGTTATCCTCTCCAGCGAATGGGGGAATGGCGTGCCACT‑CCCCAGCAGGTAAAACAATCTCTGTTACCTCAAGCGTGGCGTTAATTGCGATCAAAAAGCGATCCGAGAGCAGAATTTGCAGCTGTTTCGGCCCGTTTTGCCACTCATCCGTGCTTAAAGGTTGAGCATATCGATTTAGCCA > NC_000913/3569289‑3569585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |