| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,659,470 | G→T | 7.3% | G80V (GGC→GTC) ‡ | mdtE → | multidrug efflux pump membrane fusion protein MdtE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,659,470 | 0 | G | T | 7.3% | 223.8 / 6.0 | 68 | G80V (GGC→GTC) ‡ | mdtE | multidrug efflux pump membrane fusion protein MdtE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/29); new base T (3/2); total (37/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.57e-01 | |||||||||||
GCCATGACGCCTGAGGTCGGTGTCGTCACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGCCAGGCATCGTTGCTGA > NC_000913/3659322‑3659619 | gccATGACGCCTGAGGTCGGTGTCGTCACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGc < 1:1398369/150‑1 (MQ=255) cGCCTGAGGTCGGTGTCGTCACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAg > 2:128253/1‑150 (MQ=255) cGCCTGAGGTCGGTGTCGTCACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAg < 2:1387532/150‑1 (MQ=255) gCCTGAGGTCGGTGTCGTCACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGt < 1:1183294/150‑1 (MQ=255) tGAGGTCGGTGTCGTCACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGaa > 1:416235/1‑150 (MQ=255) gAGGTCGGTGTCGTCACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGCCTTCGATAAAGttgcg < 1:937546/150‑5 (MQ=255) tCGGTGTCGTCACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAgg > 2:444853/1‑150 (MQ=255) tcgtcACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGCCTTCGATAAAg < 2:595425/135‑1 (MQ=255) tcgtcACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGCCTTCGATAAAg > 1:595425/1‑135 (MQ=255) tcgtcACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGAtt < 2:1142013/150‑1 (MQ=255) tcACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGc < 2:982442/150‑1 (MQ=255) acacTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTg < 2:1144389/150‑1 (MQ=255) cacTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGt < 1:372273/150‑1 (MQ=255) tctcCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATc < 1:937146/150‑1 (MQ=255) cccccGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGa > 2:1126206/1‑150 (MQ=255) ttCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATcc > 2:607226/1‑150 (MQ=255) ttCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATcc < 1:1110157/150‑1 (MQ=255) cGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGATTTACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGAAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTg < 2:400372/150‑1 (MQ=255) cGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTg > 2:819886/1‑150 (MQ=255) ggTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGc > 1:1187916/1‑150 (MQ=255) cAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCCAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCATGCAcc > 1:1356489/1‑150 (MQ=255) gtTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACa > 1:211213/1‑150 (MQ=255) tGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAgg > 2:1552947/1‑150 (MQ=255) tGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAgg > 2:457137/1‑150 (MQ=255) tGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAgg > 1:1072585/1‑150 (MQ=255) gAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGc > 1:548134/1‑150 (MQ=255) gAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGc > 2:754468/1‑150 (MQ=255) aGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGAGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGcc > 2:1348343/1‑150 (MQ=255) gCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCg < 1:128253/150‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGc > 1:1375170/1‑150 (MQ=255) aTTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCt < 2:416235/150‑1 (MQ=255) tGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTaa < 1:244670/150‑1 (MQ=255) cccGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAAc < 1:1105010/150‑1 (MQ=255) cccGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAAc > 2:314534/1‑150 (MQ=255) cGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTc > 1:442196/1‑150 (MQ=255) aGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGcc < 1:444853/150‑1 (MQ=255) aGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGcc < 1:559898/150‑1 (MQ=255) aGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGcc < 1:882211/150‑1 (MQ=255) aGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGcc < 1:1126206/150‑1 (MQ=255) cTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCGAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGc > 2:1387978/1‑150 (MQ=255) cTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGc > 2:1393701/1‑150 (MQ=255) ttATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCt > 2:438238/1‑150 (MQ=255) ttATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCt < 1:1652229/150‑1 (MQ=255) tATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTg > 2:221438/1‑150 (MQ=255) tGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGc > 1:1511611/1‑150 (MQ=255) gAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCg < 2:1375170/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCggtaga > 2:889621/1‑145 (MQ=255) tGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAgc > 2:315881/1‑150 (MQ=255) gCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAgcg > 1:1035729/1‑150 (MQ=255) cGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGct < 1:967524/150‑1 (MQ=255) tACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTa > 2:1300303/1‑150 (MQ=255) cAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAACGCGCTCTCTACCGCCAGc > 2:1548130/1‑150 (MQ=255) aGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCa < 2:1072585/150‑1 (MQ=255) ggTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCaa < 1:1387978/150‑1 (MQ=255) ggTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCaa < 1:1393701/150‑1 (MQ=255) gTATTATCATTAAACGCTAGTTTATCGAAGGCGATATAGTGAACGAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGACCTAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCTTAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCa < 2:204124/150‑1 (MQ=255) gTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCa < 2:109745/150‑1 (MQ=255) tatCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCAc > 1:549639/1‑150 (MQ=255) aTTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCttt > 1:248523/1‑150 (MQ=255) tAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTaa < 2:1187916/150‑1 (MQ=255) aaCGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAAcc > 2:1275503/1‑150 (MQ=255) tcaCTTTATCGCCTTCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGCCa > 1:31790/3‑150 (MQ=255) cAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGCCa < 1:315881/150‑1 (MQ=255) caCTTTATCGCCTTCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGCCAg > 2:255802/2‑150 (MQ=255) gAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGc > 2:345726/1‑138 (MQ=255) gAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGc < 1:345726/138‑1 (MQ=255) gAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGCCAGGCATCGTTg > 1:271175/1‑150 (MQ=255) gAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATAAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGCCAGGCATCGTTg > 2:324291/1‑150 (MQ=255) ggCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGCCAGGCATCGTTGCTg < 2:1511611/150‑1 (MQ=255) gCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAACCTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGCCAGGCATCGTTGCTGa > 1:659988/1‑150 (MQ=255) gCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGCCAGGCATCGTTGCTGa < 1:819886/150‑1 (MQ=255) gCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGCCAGGCATCGTTGCTGa < 1:152174/150‑1 (MQ=255) | GCCATGACGCCTGAGGTCGGTGTCGTCACACTCTCCCCCGGTTCGGTCAATGTGTTGAGCGAATTGCCCGGTAGAACCGTTCCTTATGAAGTTGCCGAGATACGTCCCCAGGTGGGCGGTATTATCATTAAACGCAACTTTATCGAAGGCGATAAAGTGAACCAGGGCGATTCGCTGTATCAGATTGATCCTGCACCTTTACAGGCCGAGCTAAACTCCGCCAAAGGCTCGCTGGCGAAAGCGCTCTCTACCGCCAGCAATGCCCGCATCACCTTTAACCGCCAGGCATCGTTGCTGA > NC_000913/3659322‑3659619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |