Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,935,569 | A→C | 5.2% | E94D (GAA→GAC) | rbsC → | ribose ABC transporter membrane subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,935,569 | 0 | A | C | 5.2% | 244.1 / 4.9 | 77 | E94D (GAA→GAC) | rbsC | ribose ABC transporter membrane subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/38); new base C (2/2); total (37/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.15e-01 |
CTTATTCAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCTGGTTATGATGCTTTTACTGCGCGGCGTGACCATGGTTT > NC_000913/3935422‑3935717 | cTTATTCAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGt > 1:299480/1‑150 (MQ=255) ttATTCAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTc < 1:1046415/150‑1 (MQ=255) tATTAATTATTCTCCAGCAACCCTTAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGTTGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCa < 1:714869/150‑1 (MQ=255) cAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATgc > 1:1508641/1‑150 (MQ=255) cAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATgc > 1:445157/1‑150 (MQ=255) atatTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATgcgc < 1:737293/150‑1 (MQ=255) tatTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGTGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGTCATCGACTTATCGCTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTACATCTATCGTCGGCATTGACTTCAATgccga < 1:176542/150‑4 (MQ=255) atTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGACTTCAATgccgac < 1:292228/150‑5 (MQ=255) ttCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCtgg > 2:1054686/1‑150 (MQ=255) ttCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCtgg < 2:916165/150‑1 (MQ=255) ctcCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCtggtg < 2:1605878/150‑1 (MQ=255) tcCGGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCtggtgg < 1:725942/150‑1 (MQ=255) tcCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCtggtgg < 1:295249/150‑1 (MQ=255) ccAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGc < 2:481278/150‑1 (MQ=255) aGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGAATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCtt > 1:1650748/1‑149 (MQ=255) gCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGt > 1:312674/1‑150 (MQ=255) ccTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCgctg > 1:463522/1‑150 (MQ=255) ccTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCgctg < 1:1277708/150‑1 (MQ=255) cTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCgctgc < 2:1030668/150‑1 (MQ=255) cAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCgctgctg > 2:474516/1‑150 (MQ=255) aGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCgctgctgc < 2:4242/150‑1 (MQ=255) aGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCgctgctgc < 2:10438/150‑1 (MQ=255) gTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCgctgctgct < 1:1228803/150‑1 (MQ=255) ccgaccGCCATAATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCAACTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCgctgctgct > 1:1471743/6‑150 (MQ=255) gAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGaa < 1:296038/118‑1 (MQ=255) gAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGaa > 2:296038/1‑118 (MQ=255) aaCGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCtctc > 2:64442/1‑150 (MQ=255) cGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTcgc < 1:234968/150‑1 (MQ=255) aTTATGGCGTTCGGGATGAGGCTGGTGATCCTGACGTCGGGAATCGACTTATAGGTAGTTTATCTGTTGGCGCTGACCGGCTCATTTGCTGCATCTATCGTCGGGTTTGTAGTAAATGCGGTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTa < 2:1003850/150‑1 (MQ=255) aTTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTa > 1:492857/1‑150 (MQ=255) gCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGcc < 2:1382018/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTGGGCGCGGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGcc < 2:1387716/150‑1 (MQ=255) ggTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGc < 2:33800/150‑1 (MQ=255) gggATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAAtt < 2:299480/150‑1 (MQ=255) ggATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTg > 1:1213956/1‑150 (MQ=255) tGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTGCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTg < 1:897127/150‑1 (MQ=255) gACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGc < 2:1213956/150‑1 (MQ=255) cGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCgg > 1:711207/1‑150 (MQ=255) cTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTa < 1:1036396/150‑1 (MQ=255) tGGTGATCCAGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTaa > 2:1185963/1‑150 (MQ=255) gTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAAcc > 2:827027/1‑150 (MQ=255) cTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTACCCGGGGTg > 2:328243/1‑150 (MQ=255) gACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGAt < 2:445157/150‑1 (MQ=255) cGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCGGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTat < 2:969108/150‑2 (MQ=255) tCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAg > 1:452224/1‑150 (MQ=255) cTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTcg < 1:1043277/150‑1 (MQ=255) tATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTcgcg > 1:689695/1‑150 (MQ=255) aTCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGt > 2:1334626/1‑150 (MQ=255) cGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTg < 1:1007801/132‑1 (MQ=255) cGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTg > 2:1007801/1‑132 (MQ=255) cGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTcc < 1:802317/150‑1 (MQ=255) ggTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCgctgctgc < 1:462695/87‑1 (MQ=255) ggTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCgctgctgc > 2:462695/1‑87 (MQ=255) ggTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAg > 2:748003/1‑134 (MQ=255) ggTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAg < 1:748003/134‑1 (MQ=255) tctGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTAt > 1:1105920/1‑150 (MQ=255) gcTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCt < 1:64442/150‑1 (MQ=255) tGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCTgg > 1:46648/1‑150 (MQ=255) tGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCTgg < 2:1656279/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCTGGTTa > 2:168535/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCTGGTTa > 1:91678/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCTGGTTatg > 1:1107910/1‑150 (MQ=255) gcAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCTGTTTatgatg < 1:63062/150‑1 (MQ=255) aGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCTGGTTATGATGCt > 2:595302/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCTGGTTATGATGCtt > 2:1553504/1‑150 (MQ=255) 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aaGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCTGGTTATGATGCTTTTACTGCGCGGCGTGACCATGGttt < 2:1107910/150‑1 (MQ=255) | CTTATTCAATATTCTCCAGCAAACCTCAGTGAACGCCATTATGGCGGTCGGGATGACGCTGGTGATCCTGACGTCGGGCATCGACTTATCGGTAGGTTCTCTGTTGGCGCTGACCGGCGCAGTTGCTGCATCTATCGTCGGCATTGAAGTCAATGCGCTGGTGGCTGTCGCTGCTGCTCTCGCGTTAGGTGCCGCAATTGGTGCGGTAACCGGGGTGATTGTAGCGAAAGGTCGCGTCCAGGCGTTTATCGCTACGCTGGTTATGATGCTTTTACTGCGCGGCGTGACCATGGTTT > NC_000913/3935422‑3935717 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |