| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,041,216 | T→C | 7.7% | Q73R (CAG→CGG) ‡ | mobB ← | molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis adaptor protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,041,216 | 0 | T | C | 7.7% | 265.7 / 10.2 | 92 | Q73R (CAG→CGG) ‡ | mobB | molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis adaptor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/49); new base C (3/4); total (39/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.12e-01 | |||||||||||
CGCGAAACAGCACAATCTTTGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCGGGATCAGTTTTTTCAA > NC_000913/4041067‑4041364 | cgcgAAACAGCACAATCTTTGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTgct > 2:817889/1‑150 (MQ=255)cgcgAAACAGCACAATCTTTGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCCACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTgct < 2:290896/150‑1 (MQ=255) gcgAAACAGCACAATCTTTGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTgctg < 2:645429/150‑1 (MQ=255) gAAACAGCACAATCTTTGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTgctggc > 2:900317/1‑150 (MQ=255) cacaATCTTTGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAAc > 1:131830/1‑150 (MQ=255) acaATCTTTGCGATCTCTTCATTCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTTTCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACg < 2:684239/150‑1 (MQ=255) acaATCTTTGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACg > 1:1319151/1‑150 (MQ=255) aTCTTTGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATg < 1:701378/150‑1 (MQ=255) aTCTTTGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCCAGCCAGCAACGATg < 1:659457/150‑1 (MQ=255) tCTTTGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCCAGCCAGCAACGATgg < 1:906693/150‑1 (MQ=255) ttGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGttt < 1:1609247/150‑1 (MQ=255) tGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGACTCAAATCCAGCGTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGGTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTtg < 1:773069/150‑1 (MQ=255) tGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCATATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTtg < 1:617859/150‑1 (MQ=255) tGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTtg > 1:492090/1‑150 (MQ=255) tGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCCAGCCAGCAACGATgggcct < 2:211502/150‑5 (MQ=255) gCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTtgt < 1:1031906/150‑1 (MQ=255) cGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTtgtg < 1:1203307/150‑1 (MQ=255) gATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGc < 1:1647991/150‑1 (MQ=255) ctctTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCcgc > 2:1269903/1‑150 (MQ=255) ctctTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGGCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCcgc < 1:923218/150‑1 (MQ=255) tctTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCcgcg < 1:1129680/150‑1 (MQ=255) ctTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCgcgc > 2:182418/1‑150 (MQ=255) ctTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCgcgc > 1:458796/1‑150 (MQ=255) tGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGcc > 1:1585193/1‑150 (MQ=255) tGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGcc < 1:1078429/150‑1 (MQ=255) gCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAACCTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCt < 1:1093534/150‑1 (MQ=255) gCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCt < 1:1087831/150‑1 (MQ=255) gCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTAGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCt > 2:387086/1‑150 (MQ=255) 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ccATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCa < 1:398523/150‑1 (MQ=255) cATTCGACTTGCGAGAGACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCat > 2:1609710/1‑150 (MQ=255) aTTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCata < 1:851790/150‑1 (MQ=255) aTTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCAGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCata > 1:612685/1‑150 (MQ=255) tCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATc < 1:821981/150‑1 (MQ=255) 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2:1513277/1‑98 (MQ=255) gtTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAAc < 1:1513277/98‑1 (MQ=255) ttCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCa < 1:434031/150‑1 (MQ=255) ccGTCATCAAGGCAAATCGTTTCTGGATGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGATCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCAATATCATGGTGCGTATGATTAATCAGCACTGGAAGGATCCCTCTGTCGCATa > 2:1605828/1‑150 (MQ=255) gTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAAt > 1:682874/1‑150 (MQ=255) tcatcaAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATg < 1:1269903/150‑1 (MQ=255) caAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGc > 2:512602/1‑109 (MQ=255) caAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGc < 1:512602/109‑1 (MQ=255) caAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCgg < 2:755164/150‑1 (MQ=255) acaaaccATCGTTGCCAGCCAGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCggg < 2:414002/145‑1 (MQ=255) acaaaccATCGTTGCCAGCCAGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCggg > 1:414002/6‑150 (MQ=255) ggCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCGGGAt < 2:204936/150‑1 (MQ=255) aaccATCGTTGCCAGCCAGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCGGGATc > 2:1536170/3‑150 (MQ=255) cccATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCGGGATCa > 1:1664710/1‑150 (MQ=255) ccATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCGGGATCAg < 1:1597932/150‑1 (MQ=255) cATCGTTGCCAGCCAGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCGGGATCAGt > 1:988094/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCGGGATCAGttttt < 2:707018/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCGGGATCAGtttttt < 1:182418/150‑1 (MQ=255) ctggctggCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCGGGATCAGTTTTTTCaa < 1:558703/150‑1 (MQ=255) | CGCGAAACAGCACAATCTTTGCGATCTCTTCATGCTTAAACCCTTCGACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTAATCAGCCCTGGACGGATCCCTCTGGCGCATAATGCCGGGATCAGTTTTTTCAA > NC_000913/4041067‑4041364 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |