Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,444,192 | C→G | 6.9% | G27G (GGC→GGG) ‡ | tamB → | translocation and assembly module subunit TamB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,444,192 | 0 | C | G | 6.9% | 318.8 / 8.2 | 97 | G27G (GGC→GGG) ‡ | tamB | translocation and assembly module subunit TamB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/42); new base G (4/3); total (51/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TGCCGTACCGGTCGCGGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGCGGGCAATCT > NC_000913/4444046‑4444341 | tGCCGTACCGGTCGCGGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGCGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGcacc > 2:163116/1‑150 (MQ=255) ccGTACCGGTCGCGGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGcaccac > 1:672177/1‑150 (MQ=255) ccGTACCGGTCGCGGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGcaccac > 1:309621/1‑150 (MQ=255) cGTACCGGTCGCGGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGGCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAACTCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCaccacc < 1:1084988/150‑1 (MQ=255) tACCGGTCGCGGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAg > 2:1420615/1‑150 (MQ=255) aCCGGTCGCGGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGc < 2:609550/150‑1 (MQ=255) ccGGTCGCGGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGTGCCCACCAgaa < 1:1519947/150‑3 (MQ=255) ggTCGCGGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGc > 1:142502/1‑150 (MQ=255) gTCGCGGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGcc > 2:131480/1‑150 (MQ=255) gTCGCGGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGACTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGTGCCCACCAgaaacg < 1:906698/150‑6 (MQ=255) cgcgGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGcc > 2:883142/1‑148 (MQ=255) cgcgGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGcc < 1:883142/148‑1 (MQ=255) cgcgGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTg > 2:353207/1‑150 (MQ=255) cgcgGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTg < 1:1400699/150‑1 (MQ=255) gcgGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGc > 1:1301175/1‑150 (MQ=255) gATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGTGCACCACCAGCGGCCTGCATc < 1:298562/150‑1 (MQ=255) aaaGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTgg < 2:1242664/150‑1 (MQ=255) aaGCCGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGt > 1:1263381/1‑150 (MQ=255) 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cGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTAttt > 1:374295/1‑150 (MQ=255) gAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTa < 1:74600/150‑1 (MQ=255) ggTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGGGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAgcggc < 2:1492449/150‑1 (MQ=255) gTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAgcggcg < 2:672177/150‑1 (MQ=255) gTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGc > 1:1359527/1‑150 (MQ=255) tttACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGCGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTg > 2:1398073/1‑150 (MQ=255) aCATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGt < 2:1359527/150‑1 (MQ=255) aCATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGt > 2:1162099/1‑150 (MQ=255) cATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAACATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTTTCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGGGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTg < 1:163116/150‑1 (MQ=255) tCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGcc < 2:142502/150‑1 (MQ=255) 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ccAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGata < 2:1077256/150‑1 (MQ=255) ccAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGata > 1:458768/1‑150 (MQ=255) aaatATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTgg < 2:486842/147‑1 (MQ=255) aaTTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTgg < 1:950274/150‑1 (MQ=255) aTTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGc > 1:1064788/1‑150 (MQ=255) 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gAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACcggcgg > 2:731126/1‑150 (MQ=255) gAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACcggcgg > 2:1247996/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaTCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCggcggc < 2:458768/150‑1 (MQ=255) aaaaaTCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTg > 2:1171585/1‑150 (MQ=255) ggctCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGgc > 1:254078/4‑150 (MQ=255) 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gCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGGTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGAGCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGAtc < 2:1152223/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGTACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGAtctc < 2:41684/150‑1 (MQ=255) tCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCa < 2:760689/150‑1 (MQ=255) ggCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCAcc > 1:74239/1‑150 (MQ=255) ggCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCAcc < 1:1400320/150‑1 (MQ=255) ggCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGGGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCAcc < 1:554623/150‑1 (MQ=255) ggTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTc < 1:353207/150‑1 (MQ=255) tatcgttatcTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGa > 2:602559/1‑150 (MQ=255) gttatcTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGAcgtt > 2:833433/1‑150 (MQ=255) atcTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGAcgttcgt < 1:1398073/150‑1 (MQ=255) tACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATg < 2:602826/150‑1 (MQ=255) tACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGGTTCTGGGGGGGACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATg < 1:1590318/150‑1 (MQ=255) aCTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGa > 2:934236/1‑150 (MQ=255) tGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGagc < 1:602559/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATTTTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTTTGagca < 2:1294166/150‑1 (MQ=255) 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tGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCgg < 1:1247996/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGt < 2:309621/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGt < 1:496805/150‑1 (MQ=255) gCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTa < 1:131480/150‑1 (MQ=255) cGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTaa > 2:1443994/1‑150 (MQ=255) cGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTaa > 2:242438/1‑150 (MQ=255) gccgcTGGTGGTGCCCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTaaa > 2:1336469/5‑150 (MQ=255) ccgcTGGTGGTGCCCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGCTCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTaaaa > 1:252191/4‑150 (MQ=255) cgcTGGTGGTGCCCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAg > 1:1358184/3‑150 (MQ=255) gcTGGTGGTGCCCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGc > 1:1053418/2‑150 (MQ=255) cTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGCg > 2:1389897/1‑150 (MQ=255) ggtggGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTg < 1:1360284/110‑1 (MQ=255) ggtggGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTg > 2:1360284/1‑110 (MQ=255) ggtggGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGCggg < 2:1301175/150‑1 (MQ=255) ggtggGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGCggg > 1:362139/1‑150 (MQ=255) gtggGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGCGGGc > 2:1494970/1‑150 (MQ=255) gtggGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGCGGGc < 2:374295/150‑1 (MQ=255) gggCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGCGGGCaa > 1:1494424/1‑150 (MQ=255) gggCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGCGGGCaa > 2:764760/1‑150 (MQ=255) gCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGCGGGCAATc > 1:213105/1‑150 (MQ=255) caccacCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGCGGGCAATCt < 2:74239/150‑1 (MQ=255) caccacCAGCGGCCTGCATCTGGGATTTAAAGCGGCGGCGCGCAGGGGGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCCCCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCGGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGCGGGCAATCt < 2:1558321/150‑1 (MQ=255) | TGCCGTACCGGTCGCGGATAAAGACGAACACGGGTTACAGTTTTACATCGGTCTGGGGCCAGAATTATGAGTTTATGGAAAAAAATCAGCCTCGGCGTGGTTATCGTTATCTTACTGTTGCTGGGATCGGTGGCGTTTCTGGTGGGCACCACCAGCGGCCTGCATCTGGTATTTAAAGCGGCGGATCGCTGGGTGCCAGGACTGGATATTGGCAAGGTCACCGGCGGCTGGCGCGATCTCACCTTGTCTGACGTTCGTTATGAGCAGCCAGGCGTGGCGGTAAAAGCGGGCAATCT > NC_000913/4444046‑4444341 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |