| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,454,799 | G→T | 7.3% | R271S (CGT→AGT) | fbp ← | fructose‑1,6‑bisphosphatase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,454,799 | 0 | G | T | 7.3% | 324.1 / 10.5 | 96 | R271S (CGT→AGT) | fbp | fructose‑1,6‑bisphosphatase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/50); new base T (2/5); total (41/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.53e-01 | |||||||||||
TTCAACCATATGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTAA > NC_000913/4454650‑4454948 | ttCAACCATATGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACg > 2:81029/1‑150 (MQ=255) tCAACCATATGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGc < 1:472339/150‑1 (MQ=255) tCAACCATATGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGc < 2:603470/150‑1 (MQ=255) aCCATATGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACGGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGt > 1:1041955/1‑150 (MQ=255) cATATGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGttt < 2:1466556/150‑1 (MQ=255) atatGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTg < 2:978963/150‑1 (MQ=255) tGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCg > 1:367535/1‑150 (MQ=255) gTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACGGCAAACTGCGTTTGCTGta < 1:357182/150‑2 (MQ=255) gTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTc > 1:1624117/1‑150 (MQ=255) tCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTcc < 2:297947/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACGGCAAACTGCGTTTGCTGtatg < 1:337243/150‑4 (MQ=255) gTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCgg < 1:1259191/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCgg < 2:761099/150‑1 (MQ=255) ttGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACTGCGTTTGCTGtatgag < 1:753806/150‑6 (MQ=255) aCAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGtggctg < 1:1296664/150‑1 (MQ=255) aaGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACTGCGTTTGCTGt > 1:1417804/1‑136 (MQ=255) aaGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACTGCGTTTGCTGt < 2:1417804/136‑1 (MQ=255) aaGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCg < 1:985835/150‑1 (MQ=255) 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ggggcTGGTGCATGGTTTCCGGGTTGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGt < 2:110364/147‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCATAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGt < 2:105133/150‑1 (MQ=255) gcTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTaga < 2:1395187/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTagag > 2:1063196/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTagag < 1:1536815/150‑1 (MQ=255) 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cGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGAttt < 1:58573/150‑1 (MQ=255) ttccgctctTACAGCAATCGGAGTTTGCCGTCCGGGTGGCGGGCGGGGCTTGGGTTGTGATAAATACCGCCTTTCAGCTGTTTTTGGTGGTATTCCGCGAGCAGTGAACGGTTATTACGTGTGGTATAAGGGCGGTTTGTGGATTTAtgt < 2:1258906/145‑3 (MQ=255) tGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTAtctt < 2:367535/150‑1 (MQ=255) gCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTAtcttc < 2:82213/150‑1 (MQ=255) gCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTAtcttc > 1:866221/1‑150 (MQ=255) cACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTAtcttct > 2:1429217/1‑150 (MQ=255) cATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTg < 1:994305/114‑1 (MQ=255) cATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTg > 2:994305/1‑114 (MQ=255) aTACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTg < 1:1665831/150‑1 (MQ=255) aGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAg < 1:1074158/150‑1 (MQ=255) aaCGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAAtt > 1:1284495/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAAttt > 1:1076163/1‑150 (MQ=255) gCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTaa > 1:344241/1‑150 (MQ=255) | TTCAACCATATGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTAA > NC_000913/4454650‑4454948 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |